MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi417 chromosome

Total Repeats: 1748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017739	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017739	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017739	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017739	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017739	TGG	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017739	GTG	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017739	ACC	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017739	GGT	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017739	AAT	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017739	TAC	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017739	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017739	AAT	2	6	7091	7096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017739	TAA	2	6	7568	7573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017739	ATT	2	6	7587	7592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017739	CAA	2	6	7655	7660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017739	GAA	2	6	7716	7721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017739	ATA	2	6	11478	11483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017739	CTG	2	6	14512	14517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017739	AAG	2	6	20814	20819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017739	CTT	2	6	22951	22956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017739	GTT	2	6	23153	23158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017739	TCA	2	6	27786	27791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017739	AGC	2	6	28355	28360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017739	TTA	2	6	33613	33618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017739	TAA	2	6	36572	36577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017739	AGT	2	6	40172	40177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017739	ATT	2	6	40190	40195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017739	ATC	2	6	40263	40268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017739	TAA	2	6	46499	46504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017739	ATC	2	6	46515	46520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017739	TTA	2	6	46558	46563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017739	TAA	3	9	53211	53219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017739	AAG	2	6	53915	53920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017739	GAT	2	6	54187	54192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017739	TTA	2	6	54202	54207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017739	TAG	2	6	55739	55744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017739	GAA	2	6	55789	55794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017739	AGA	3	9	55824	55832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017739	TAA	2	6	55878	55883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017739	CTT	2	6	55889	55894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017739	TGA	2	6	55908	55913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017739	ATA	2	6	56051	56056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017739	AGA	2	6	56196	56201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017739	TGG	2	6	56328	56333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017739	TAG	2	6	56378	56383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017739	ACC	2	6	56429	56434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017739	AGG	2	6	56588	56593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017739	CAA	2	6	56673	56678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017739	TTA	2	6	56928	56933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017739	GAC	2	6	56958	56963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017739	TTG	2	6	57076	57081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017739	TGA	2	6	57162	57167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017739	AGA	2	6	57281	57286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017739	CTT	2	6	57440	57445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017739	AGG	2	6	57512	57517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017739	GAT	2	6	57606	57611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017739	AAG	2	6	57835	57840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017739	AGA	2	6	58016	58021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017739	GAA	2	6	58026	58031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017739	GAC	2	6	58089	58094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017739	ACA	2	6	58699	58704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017739	GAT	2	6	58968	58973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017739	AGA	2	6	58999	59004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017739	AAG	2	6	59052	59057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017739	TCC	2	6	59245	59250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017739	GCT	2	6	59258	59263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017739	TGA	2	6	59587	59592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017739	TGA	2	6	59706	59711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017739	GCG	2	6	59712	59717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017739	TGA	2	6	59728	59733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017739	TGA	2	6	59884	59889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017739	CTT	2	6	59920	59925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017739	CAT	2	6	59987	59992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017739	GAA	2	6	60069	60074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017739	CTT	2	6	60154	60159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017739	ATG	2	6	60160	60165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017739	TAA	2	6	60281	60286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017739	AGC	2	6	60367	60372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017739	GAA	2	6	60447	60452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017739	TCA	2	6	60542	60547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017739	AGA	2	6	60695	60700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017739	TTA	3	9	60702	60710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017739	ACA	2	6	67333	67338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017739	TTG	2	6	67360	67365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017739	TTA	2	6	70036	70041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017739	ATT	3	9	70046	70054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017739	AAT	3	9	70196	70204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017739	CTT	2	6	72481	72486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017739	AAT	2	6	72494	72499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017739	TAT	2	6	72506	72511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017739	CTT	2	6	72516	72521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017739	TTG	2	6	72537	72542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017739	ACC	2	6	73688	73693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017739	GCA	2	6	74382	74387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017739	ACC	2	6	74474	74479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017739	AGT	2	6	74502	74507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017739	GTG	2	6	74877	74882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017739	TAA	2	6	75044	75049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017739	TAC	2	6	75138	75143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017739	CAG	2	6	75283	75288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017739	AGG	2	6	75311	75316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017739	CAA	2	6	75371	75376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017739	CCG	2	6	75379	75384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017739	TCT	2	6	75604	75609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017739	TGT	2	6	75664	75669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017739	AAG	2	6	75710	75715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017739	TAC	2	6	78064	78069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017739	GGT	2	6	78121	78126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017739	ATT	2	6	80184	80189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017739	ATT	2	6	80194	80199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017739	GCT	2	6	81212	81217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017739	AAC	2	6	81302	81307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017739	TAT	2	6	81391	81396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017739	TTA	2	6	88262	88267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017739	AAT	2	6	90452	90457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017739	GCC	2	6	90486	90491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017739	AGC	2	6	90543	90548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017739	CTT	3	9	90565	90573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017739	CTT	2	6	90747	90752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017739	GGT	2	6	90802	90807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017739	TTC	2	6	90809	90814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017739	ATT	2	6	90827	90832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017739	CAC	2	6	91248	91253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017739	TTG	2	6	92931	92936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017739	TGA	2	6	95613	95618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017739	ATG	2	6	95621	95626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017739	TCA	2	6	95716	95721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017739	ATA	2	6	98965	98970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017739	GTT	2	6	102355	102360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017739	CAA	2	6	102387	102392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017739	ATA	2	6	104241	104246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017739	CCA	2	6	104326	104331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017739	TCC	2	6	106919	106924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017739	TTA	2	6	106997	107002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017739	ATG	2	6	107354	107359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017739	TAC	2	6	107467	107472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017739	TGA	2	6	107671	107676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017739	AAG	2	6	107720	107725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_017739	TAA	2	6	111076	111081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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