MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter cetorum MIT 00-7128 plasmid pHCW

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017738	ACCA	2	8	415	422	50 %	0 %	0 %	50 %	386748712
2	NC_017738	ACCT	2	8	865	872	25 %	25 %	0 %	50 %	386748713
3	NC_017738	GATA	2	8	1056	1063	50 %	25 %	25 %	0 %	386748713
4	NC_017738	AACA	2	8	1747	1754	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017738	AAAT	2	8	1992	1999	75 %	25 %	0 %	0 %	386748714
6	NC_017738	GAAA	2	8	2138	2145	75 %	0 %	25 %	0 %	386748714
7	NC_017738	TCTA	2	8	2359	2366	25 %	50 %	0 %	25 %	386748715
8	NC_017738	CAAG	2	8	2558	2565	50 %	0 %	25 %	25 %	386748716
9	NC_017738	GAAA	2	8	3007	3014	75 %	0 %	25 %	0 %	386748716
10	NC_017738	CCAA	2	8	3135	3142	50 %	0 %	0 %	50 %	386748716
11	NC_017738	TATC	2	8	3176	3183	25 %	50 %	0 %	25 %	386748716
12	NC_017738	AAAC	2	8	3277	3284	75 %	0 %	0 %	25 %	386748716
13	NC_017738	AAAG	2	8	3482	3489	75 %	0 %	25 %	0 %	386748716
14	NC_017738	TAGT	2	8	4101	4108	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017738	ATAA	2	8	4270	4277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017738	ACTC	2	8	4928	4935	25 %	25 %	0 %	50 %	386748719
17	NC_017738	CTTG	2	8	5324	5331	0 %	50 %	25 %	25 %	386748719
18	NC_017738	GTAA	2	8	5456	5463	50 %	25 %	25 %	0 %	386748719
19	NC_017738	AGTA	2	8	5599	5606	50 %	25 %	25 %	0 %	386748719
20	NC_017738	GTAA	2	8	5631	5638	50 %	25 %	25 %	0 %	386748719
21	NC_017738	TTGG	2	8	6441	6448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017738	ACTC	2	8	6784	6791	25 %	25 %	0 %	50 %	386748721
23	NC_017738	CTTG	2	8	7180	7187	0 %	50 %	25 %	25 %	386748721
24	NC_017738	TTAG	2	8	8110	8117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017738	TTTC	2	8	8614	8621	0 %	75 %	0 %	25 %	386748722
26	NC_017738	GTCT	2	8	9016	9023	0 %	50 %	25 %	25 %	386748722
27	NC_017738	TGAG	2	8	10045	10052	25 %	25 %	50 %	0 %	386748722
28	NC_017738	TTAG	2	8	10069	10076	25 %	50 %	25 %	0 %	386748722
29	NC_017738	TAAC	2	8	10187	10194	50 %	25 %	0 %	25 %	386748722
30	NC_017738	TTTG	2	8	10511	10518	0 %	75 %	25 %	0 %	386748723
31	NC_017738	GATT	2	8	10635	10642	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017738	AGTG	2	8	11481	11488	25 %	25 %	50 %	0 %	386748725
33	NC_017738	ATCT	2	8	11805	11812	25 %	50 %	0 %	25 %	386748725
34	NC_017738	TTTC	2	8	11973	11980	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017738	CTAA	2	8	12424	12431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.