MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter cetorum MIT 00-7128 chromosome

Total Repeats: 985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017737	TTGTAA	2	12	867	878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386748728
2	NC_017737	CCCCTA	2	12	4645	4656	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386748733
3	NC_017737	GTTTTT	2	12	6200	6211	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386748734
4	NC_017737	TTATTT	2	12	6904	6915	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386748735
5	NC_017737	TGGAGC	2	12	7332	7343	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386748735
6	NC_017737	TTTCAG	2	12	7889	7900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748735
7	NC_017737	CAAGCG	2	12	9245	9256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386748736
8	NC_017737	ATTAAA	2	12	10113	10124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017737	ATTTTT	2	12	11614	11625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017737	TAGATG	2	12	12143	12154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017737	AGCCTA	2	12	18561	18572	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386748744
12	NC_017737	TGAAAT	2	12	19626	19637	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748746
13	NC_017737	AACCCT	2	12	22092	22103	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386748749
14	NC_017737	AATCGT	2	12	23395	23406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386748750
15	NC_017737	ATTTTG	2	12	26341	26352	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386748752
16	NC_017737	AATTTT	2	12	28114	28125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748752
17	NC_017737	TGTTAT	2	12	32639	32650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386748756
18	NC_017737	AGCCCT	2	12	40057	40068	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386748765
19	NC_017737	CAATGC	2	12	42465	42476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386748769
20	NC_017737	CATTAG	2	12	44332	44343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386748770
21	NC_017737	GGGTTA	2	12	44631	44642	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386748770
22	NC_017737	GCTATT	2	12	45905	45916	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748770
23	NC_017737	TATGTG	2	12	46737	46748	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017737	GAATTG	2	12	47668	47679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748771
25	NC_017737	TAGAAG	2	12	48023	48034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386748771
26	NC_017737	TTGCTA	2	12	49236	49247	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017737	TATAAT	2	12	63086	63097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017737	TTAGAA	2	12	63447	63458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748782
29	NC_017737	GTTTCA	2	12	65100	65111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748783
30	NC_017737	TGGGTG	2	12	69035	69046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386748788
31	NC_017737	TGCATT	2	12	69686	69697	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748788
32	NC_017737	AAGAAA	2	12	73237	73248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017737	AGTGAT	2	12	73488	73499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748791
34	NC_017737	TAGATG	2	12	78944	78955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748798
35	NC_017737	AAAGGC	2	12	79805	79816	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386748799
36	NC_017737	TTTATA	2	12	81291	81302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748802
37	NC_017737	ACCATA	2	12	84689	84700	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386748804
38	NC_017737	AAAAAC	2	12	84792	84803	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017737	CTCCAA	2	12	86895	86906	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386748807
40	NC_017737	AGATTT	2	12	88329	88340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386748808
41	NC_017737	AAAAGA	2	12	95190	95201	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386748816
42	NC_017737	GTAATG	2	12	96755	96766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748818
43	NC_017737	TCTAGC	2	12	99086	99097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386748818
44	NC_017737	CTTCTA	2	12	99237	99248	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386748818
45	NC_017737	TCTTTC	2	12	99665	99676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748819
46	NC_017737	ACAATC	2	12	102647	102658	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386748822
47	NC_017737	TCATTC	2	12	104016	104027	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386748824
48	NC_017737	CTCTTT	2	12	105073	105084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748824
49	NC_017737	AGCTAT	2	12	105170	105181	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386748824
50	NC_017737	CAATGC	2	12	106204	106215	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386748825
51	NC_017737	TTTATT	2	12	110631	110642	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386748829
52	NC_017737	CTAAGT	2	12	115887	115898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017737	TTAAAA	2	12	115929	115940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017737	CTATTT	2	12	118399	118410	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386748835
55	NC_017737	CTCCTG	2	12	121148	121159	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386748837
56	NC_017737	TGTTTA	2	12	124257	124268	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386748843
57	NC_017737	GGAATA	2	12	126599	126610	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386748846
58	NC_017737	TTATCT	2	12	128777	128788	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386748851
59	NC_017737	TGCTCT	2	12	134142	134153	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386748864
60	NC_017737	CAGAAC	2	12	135229	135240	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386748866
61	NC_017737	ACAAAA	2	12	136070	136081	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386748867
62	NC_017737	CTTACT	2	12	137420	137431	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386748868
63	NC_017737	AAAATA	2	12	138179	138190	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386748869
64	NC_017737	ATTTAA	2	12	141537	141548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017737	TTAGAA	2	12	151905	151916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748884
66	NC_017737	AAGCCA	2	12	155084	155095	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386748886
67	NC_017737	TAATGC	2	12	156283	156294	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386748886
68	NC_017737	TGCTTA	2	12	157363	157374	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748886
69	NC_017737	TACAAT	2	12	157550	157561	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386748886
70	NC_017737	TAAGCC	2	12	161358	161369	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386748892
71	NC_017737	AAACCA	2	12	161371	161382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748892
72	NC_017737	CCTAAA	2	12	161464	161475	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386748892
73	NC_017737	CTAAGT	2	12	162388	162399	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017737	TTAAAA	2	12	162430	162441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017737	CTTATG	2	12	163947	163958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748894
76	NC_017737	CTATTT	2	12	165117	165128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017737	AAAATC	2	12	170634	170645	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386748901
78	NC_017737	CATCTT	2	12	173032	173043	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386748903
79	NC_017737	TTCAAT	2	12	177075	177086	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386748908
80	NC_017737	ATAAGA	2	12	179100	179111	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386748910
81	NC_017737	AATAAA	2	12	180479	180490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386748913
82	NC_017737	TAAAAA	2	12	182316	182327	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386748915
83	NC_017737	AAAGAA	2	12	182836	182847	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386748915
84	NC_017737	AAAAAC	2	12	199085	199096	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017737	TAAAGA	2	12	200096	200107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386748931
86	NC_017737	CAAATC	2	12	200494	200505	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386748932
87	NC_017737	TGTCCT	2	12	201517	201528	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017737	AAGAAA	2	12	207911	207922	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386748938
89	NC_017737	TTGCAT	2	12	207953	207964	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386748938
90	NC_017737	GCTTAG	2	12	208336	208347	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386748939
91	NC_017737	TTAAGC	2	12	210296	210307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386748940
92	NC_017737	TTTGTC	2	12	210331	210342	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386748940
93	NC_017737	TAGAGA	2	12	211233	211244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386748941
94	NC_017737	GTGATT	2	12	212582	212593	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386748942
95	NC_017737	TCACTA	2	12	213233	213244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748943
96	NC_017737	CATTAG	2	12	213939	213950	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386748943
97	NC_017737	CAATAT	2	12	214308	214319	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386748943
98	NC_017737	GTATAA	2	12	215814	215825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748944
99	NC_017737	TCTTTT	2	12	220964	220975	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386748949
100	NC_017737	TTTTTA	2	12	221016	221027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386748949
101	NC_017737	TCTTTC	2	12	221647	221658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748949
102	NC_017737	ATTTAT	2	12	224098	224109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748952
103	NC_017737	ATTTTT	2	12	227270	227281	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386748955
104	NC_017737	CTTCAT	2	12	227353	227364	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386748955
105	NC_017737	GCCAGA	2	12	228669	228680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386748956
106	NC_017737	TGTGCC	2	12	233137	233148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386748959
107	NC_017737	GTATTT	2	12	234934	234945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386748961
108	NC_017737	TGATTA	2	12	236743	236754	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386748964
109	NC_017737	CCTATG	2	12	239038	239049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386748967
110	NC_017737	ATAAAG	2	12	243122	243133	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017737	AAAATC	2	12	243555	243566	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386748970
112	NC_017737	GAAAAA	2	12	244478	244489	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386748970
113	NC_017737	TTAGAA	2	12	244715	244726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748970
114	NC_017737	GACAAA	2	12	246074	246085	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386748970
115	NC_017737	AAAAAG	2	12	246761	246772	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386748970
116	NC_017737	TAAAAA	2	12	248550	248561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017737	CCATGC	2	12	249940	249951	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386748973
118	NC_017737	CAAATT	2	12	251463	251474	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386748974
119	NC_017737	ATTTCA	2	12	251491	251502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386748974
120	NC_017737	GTGCAA	2	12	252871	252882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386748977
121	NC_017737	AAATTG	2	12	255782	255793	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386748979
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