MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 plasmid pHCD

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017736	CTAA	2	8	35	42	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017736	CGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	25 %	25 %	386747021
3	NC_017736	GTTA	2	8	1654	1661	25 %	50 %	25 %	0 %	386747022
4	NC_017736	CAAA	3	12	2301	2312	75 %	0 %	0 %	25 %	386747024
5	NC_017736	CAAT	2	8	2594	2601	50 %	25 %	0 %	25 %	386747024
6	NC_017736	GTTA	2	8	2625	2632	25 %	50 %	25 %	0 %	386747024
7	NC_017736	ATTA	2	8	2677	2684	50 %	50 %	0 %	0 %	386747025
8	NC_017736	CTAA	2	8	2743	2750	50 %	25 %	0 %	25 %	386747025
9	NC_017736	CTTA	2	8	2868	2875	25 %	50 %	0 %	25 %	386747025
10	NC_017736	ACAA	2	8	3482	3489	75 %	0 %	0 %	25 %	386747025
11	NC_017736	AGAA	2	8	3765	3772	75 %	0 %	25 %	0 %	386747025
12	NC_017736	AGAA	2	8	4197	4204	75 %	0 %	25 %	0 %	386747025
13	NC_017736	ACAG	2	8	4315	4322	50 %	0 %	25 %	25 %	386747025
14	NC_017736	TACT	2	8	5391	5398	25 %	50 %	0 %	25 %	386747026
15	NC_017736	TTCT	2	8	5999	6006	0 %	75 %	0 %	25 %	386747026
16	NC_017736	GAAT	2	8	6062	6069	50 %	25 %	25 %	0 %	386747026
17	NC_017736	CTAA	2	8	6183	6190	50 %	25 %	0 %	25 %	386747026
18	NC_017736	CGTT	2	8	7135	7142	0 %	50 %	25 %	25 %	386747027
19	NC_017736	GTTA	2	8	7802	7809	25 %	50 %	25 %	0 %	386747028
20	NC_017736	CTAA	2	8	8950	8957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017736	CAAC	2	8	9486	9493	50 %	0 %	0 %	50 %	386747030
22	NC_017736	TACC	2	8	9565	9572	25 %	25 %	0 %	50 %	386747030
23	NC_017736	CTTA	2	8	9738	9745	25 %	50 %	0 %	25 %	386747030
24	NC_017736	CAAA	2	8	11337	11344	75 %	0 %	0 %	25 %	386747032
25	NC_017736	ATAA	2	8	11833	11840	75 %	25 %	0 %	0 %	386747033
26	NC_017736	GTTT	2	8	11917	11924	0 %	75 %	25 %	0 %	386747033
27	NC_017736	TAAA	2	8	12260	12267	75 %	25 %	0 %	0 %	386747034
28	NC_017736	CTAA	2	8	12445	12452	50 %	25 %	0 %	25 %	386747034
29	NC_017736	AAGA	2	8	12796	12803	75 %	0 %	25 %	0 %	386747035
30	NC_017736	AAAG	2	8	12930	12937	75 %	0 %	25 %	0 %	386747035
31	NC_017736	CATT	2	8	13453	13460	25 %	50 %	0 %	25 %	386747035
32	NC_017736	CAAT	2	8	13906	13913	50 %	25 %	0 %	25 %	386747035

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.