MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 plasmid pHCD

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017736	TA	3	6	167	172	50 %	50 %	0 %	0 %	386747021
2	NC_017736	AT	3	6	1804	1809	50 %	50 %	0 %	0 %	386747022
3	NC_017736	CT	3	6	2411	2416	0 %	50 %	0 %	50 %	386747024
4	NC_017736	CT	4	8	2761	2768	0 %	50 %	0 %	50 %	386747025
5	NC_017736	AC	3	6	2916	2921	50 %	0 %	0 %	50 %	386747025
6	NC_017736	GA	3	6	3383	3388	50 %	0 %	50 %	0 %	386747025
7	NC_017736	AG	3	6	3532	3537	50 %	0 %	50 %	0 %	386747025
8	NC_017736	AG	3	6	4087	4092	50 %	0 %	50 %	0 %	386747025
9	NC_017736	AC	3	6	4112	4117	50 %	0 %	0 %	50 %	386747025
10	NC_017736	AG	4	8	4156	4163	50 %	0 %	50 %	0 %	386747025
11	NC_017736	AG	3	6	4504	4509	50 %	0 %	50 %	0 %	386747025
12	NC_017736	AG	3	6	4546	4551	50 %	0 %	50 %	0 %	386747025
13	NC_017736	TC	4	8	4974	4981	0 %	50 %	0 %	50 %	386747026
14	NC_017736	AC	3	6	5942	5947	50 %	0 %	0 %	50 %	386747026
15	NC_017736	TA	3	6	6070	6075	50 %	50 %	0 %	0 %	386747026
16	NC_017736	TA	3	6	6315	6320	50 %	50 %	0 %	0 %	386747027
17	NC_017736	AT	3	6	7952	7957	50 %	50 %	0 %	0 %	386747028
18	NC_017736	CA	3	6	9235	9240	50 %	0 %	0 %	50 %	386747030
19	NC_017736	GA	3	6	10176	10181	50 %	0 %	50 %	0 %	386747030
20	NC_017736	AT	3	6	10339	10344	50 %	50 %	0 %	0 %	386747030
21	NC_017736	CT	3	6	10994	10999	0 %	50 %	0 %	50 %	386747032
22	NC_017736	AT	3	6	11124	11129	50 %	50 %	0 %	0 %	386747032
23	NC_017736	AT	3	6	13043	13048	50 %	50 %	0 %	0 %	386747035
24	NC_017736	AG	3	6	13166	13171	50 %	0 %	50 %	0 %	386747035
25	NC_017736	CA	3	6	13400	13405	50 %	0 %	0 %	50 %	386747035
26	NC_017736	TA	3	6	13632	13637	50 %	50 %	0 %	0 %	386747035

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.