MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 plasmid pHCD

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017736	A	6	6	312	317	100 %	0 %	0 %	0 %	386747021
2	NC_017736	T	8	8	524	531	0 %	100 %	0 %	0 %	386747021
3	NC_017736	T	6	6	632	637	0 %	100 %	0 %	0 %	386747021
4	NC_017736	T	7	7	1245	1251	0 %	100 %	0 %	0 %	386747021
5	NC_017736	A	7	7	1304	1310	100 %	0 %	0 %	0 %	386747021
6	NC_017736	T	7	7	1458	1464	0 %	100 %	0 %	0 %	386747022
7	NC_017736	A	6	6	1871	1876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017736	A	6	6	1949	1954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017736	A	7	7	1971	1977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017736	C	6	6	2254	2259	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_017736	C	6	6	2264	2269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_017736	A	7	7	2377	2383	100 %	0 %	0 %	0 %	386747024
13	NC_017736	T	6	6	3219	3224	0 %	100 %	0 %	0 %	386747025
14	NC_017736	A	6	6	4656	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017736	A	6	6	4677	4682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017736	A	6	6	4936	4941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017736	A	6	6	4960	4965	100 %	0 %	0 %	0 %	386747026
18	NC_017736	A	7	7	5197	5203	100 %	0 %	0 %	0 %	386747026
19	NC_017736	A	7	7	5676	5682	100 %	0 %	0 %	0 %	386747026
20	NC_017736	A	6	6	5896	5901	100 %	0 %	0 %	0 %	386747026
21	NC_017736	A	7	7	6092	6098	100 %	0 %	0 %	0 %	386747026
22	NC_017736	A	6	6	6460	6465	100 %	0 %	0 %	0 %	386747027
23	NC_017736	T	8	8	6672	6679	0 %	100 %	0 %	0 %	386747027
24	NC_017736	T	6	6	6780	6785	0 %	100 %	0 %	0 %	386747027
25	NC_017736	T	7	7	7393	7399	0 %	100 %	0 %	0 %	386747027
26	NC_017736	A	7	7	7452	7458	100 %	0 %	0 %	0 %	386747027
27	NC_017736	T	7	7	7606	7612	0 %	100 %	0 %	0 %	386747028
28	NC_017736	A	6	6	8019	8024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017736	T	6	6	8144	8149	0 %	100 %	0 %	0 %	386747029
30	NC_017736	A	6	6	8367	8372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017736	T	6	6	8399	8404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017736	G	8	8	8424	8431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017736	A	6	6	8442	8447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017736	T	6	6	8451	8456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017736	G	7	7	8458	8464	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017736	A	6	6	8475	8480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017736	T	6	6	8484	8489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017736	A	6	6	8496	8501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017736	T	6	6	8505	8510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017736	A	6	6	8604	8609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017736	T	6	6	8636	8641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017736	G	8	8	8661	8668	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017736	A	6	6	8679	8684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017736	T	6	6	8688	8693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017736	G	7	7	8695	8701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017736	A	6	6	8712	8717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017736	T	6	6	8721	8726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017736	A	6	6	8733	8738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017736	T	6	6	8742	8747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017736	A	6	6	8841	8846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017736	T	6	6	8873	8878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017736	A	7	7	9222	9228	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
53	NC_017736	T	7	7	9297	9303	0 %	100 %	0 %	0 %	386747030
54	NC_017736	A	6	6	9421	9426	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
55	NC_017736	A	6	6	9548	9553	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
56	NC_017736	A	7	7	9611	9617	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
57	NC_017736	A	6	6	10108	10113	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
58	NC_017736	A	6	6	10227	10232	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
59	NC_017736	T	6	6	10263	10268	0 %	100 %	0 %	0 %	386747030
60	NC_017736	A	6	6	10279	10284	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
61	NC_017736	T	8	8	10566	10573	0 %	100 %	0 %	0 %	386747031
62	NC_017736	T	7	7	10608	10614	0 %	100 %	0 %	0 %	386747031
63	NC_017736	T	6	6	10641	10646	0 %	100 %	0 %	0 %	386747031
64	NC_017736	T	6	6	10676	10681	0 %	100 %	0 %	0 %	386747031
65	NC_017736	T	6	6	10698	10703	0 %	100 %	0 %	0 %	386747031
66	NC_017736	T	6	6	10872	10877	0 %	100 %	0 %	0 %	386747031
67	NC_017736	T	7	7	11020	11026	0 %	100 %	0 %	0 %	386747032
68	NC_017736	T	7	7	11043	11049	0 %	100 %	0 %	0 %	386747032
69	NC_017736	A	6	6	11081	11086	100 %	0 %	0 %	0 %	386747032
70	NC_017736	T	7	7	11275	11281	0 %	100 %	0 %	0 %	386747032
71	NC_017736	A	6	6	11436	11441	100 %	0 %	0 %	0 %	386747032
72	NC_017736	T	6	6	11791	11796	0 %	100 %	0 %	0 %	386747033
73	NC_017736	T	6	6	11901	11906	0 %	100 %	0 %	0 %	386747033
74	NC_017736	A	6	6	11909	11914	100 %	0 %	0 %	0 %	386747033
75	NC_017736	T	6	6	11927	11932	0 %	100 %	0 %	0 %	386747033
76	NC_017736	T	6	6	11947	11952	0 %	100 %	0 %	0 %	386747033
77	NC_017736	T	6	6	12050	12055	0 %	100 %	0 %	0 %	386747033
78	NC_017736	A	6	6	12203	12208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017736	A	7	7	12225	12231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017736	A	6	6	12456	12461	100 %	0 %	0 %	0 %	386747034
81	NC_017736	A	6	6	12538	12543	100 %	0 %	0 %	0 %	386747034
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83	NC_017736	A	8	8	12705	12712	100 %	0 %	0 %	0 %	386747035
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87	NC_017736	T	6	6	13656	13661	0 %	100 %	0 %	0 %	386747035
88	NC_017736	A	6	6	13869	13874	100 %	0 %	0 %	0 %	386747035
89	NC_017736	A	6	6	13930	13935	100 %	0 %	0 %	0 %	386747035
90	NC_017736	C	6	6	14013	14018	0 %	0 %	0 %	100 %	386747035

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.