MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 plasmid pHCD

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017736	A	6	6	312	317	100 %	0 %	0 %	0 %	386747021
2	NC_017736	T	8	8	524	531	0 %	100 %	0 %	0 %	386747021
3	NC_017736	T	6	6	632	637	0 %	100 %	0 %	0 %	386747021
4	NC_017736	T	7	7	1245	1251	0 %	100 %	0 %	0 %	386747021
5	NC_017736	A	7	7	1304	1310	100 %	0 %	0 %	0 %	386747021
6	NC_017736	T	7	7	1458	1464	0 %	100 %	0 %	0 %	386747022
7	NC_017736	A	7	7	2377	2383	100 %	0 %	0 %	0 %	386747024
8	NC_017736	T	6	6	3219	3224	0 %	100 %	0 %	0 %	386747025
9	NC_017736	A	6	6	4960	4965	100 %	0 %	0 %	0 %	386747026
10	NC_017736	A	7	7	5197	5203	100 %	0 %	0 %	0 %	386747026
11	NC_017736	A	7	7	5676	5682	100 %	0 %	0 %	0 %	386747026
12	NC_017736	A	6	6	5896	5901	100 %	0 %	0 %	0 %	386747026
13	NC_017736	A	7	7	6092	6098	100 %	0 %	0 %	0 %	386747026
14	NC_017736	A	6	6	6460	6465	100 %	0 %	0 %	0 %	386747027
15	NC_017736	T	8	8	6672	6679	0 %	100 %	0 %	0 %	386747027
16	NC_017736	T	6	6	6780	6785	0 %	100 %	0 %	0 %	386747027
17	NC_017736	T	7	7	7393	7399	0 %	100 %	0 %	0 %	386747027
18	NC_017736	A	7	7	7452	7458	100 %	0 %	0 %	0 %	386747027
19	NC_017736	T	7	7	7606	7612	0 %	100 %	0 %	0 %	386747028
20	NC_017736	T	6	6	8144	8149	0 %	100 %	0 %	0 %	386747029
21	NC_017736	A	7	7	9222	9228	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
22	NC_017736	T	7	7	9297	9303	0 %	100 %	0 %	0 %	386747030
23	NC_017736	A	6	6	9421	9426	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
24	NC_017736	A	6	6	9548	9553	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
25	NC_017736	A	7	7	9611	9617	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
26	NC_017736	A	6	6	10108	10113	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
27	NC_017736	A	6	6	10227	10232	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
28	NC_017736	T	6	6	10263	10268	0 %	100 %	0 %	0 %	386747030
29	NC_017736	A	6	6	10279	10284	100 %	0 %	0 %	0 %	386747030
30	NC_017736	T	8	8	10566	10573	0 %	100 %	0 %	0 %	386747031
31	NC_017736	T	7	7	10608	10614	0 %	100 %	0 %	0 %	386747031
32	NC_017736	T	6	6	10641	10646	0 %	100 %	0 %	0 %	386747031
33	NC_017736	T	6	6	10676	10681	0 %	100 %	0 %	0 %	386747031
34	NC_017736	T	6	6	10698	10703	0 %	100 %	0 %	0 %	386747031
35	NC_017736	T	6	6	10872	10877	0 %	100 %	0 %	0 %	386747031
36	NC_017736	T	7	7	11020	11026	0 %	100 %	0 %	0 %	386747032
37	NC_017736	T	7	7	11043	11049	0 %	100 %	0 %	0 %	386747032
38	NC_017736	A	6	6	11081	11086	100 %	0 %	0 %	0 %	386747032
39	NC_017736	T	7	7	11275	11281	0 %	100 %	0 %	0 %	386747032
40	NC_017736	A	6	6	11436	11441	100 %	0 %	0 %	0 %	386747032
41	NC_017736	T	6	6	11791	11796	0 %	100 %	0 %	0 %	386747033
42	NC_017736	T	6	6	11901	11906	0 %	100 %	0 %	0 %	386747033
43	NC_017736	A	6	6	11909	11914	100 %	0 %	0 %	0 %	386747033
44	NC_017736	T	6	6	11927	11932	0 %	100 %	0 %	0 %	386747033
45	NC_017736	T	6	6	11947	11952	0 %	100 %	0 %	0 %	386747033
46	NC_017736	T	6	6	12050	12055	0 %	100 %	0 %	0 %	386747033
47	NC_017736	A	6	6	12456	12461	100 %	0 %	0 %	0 %	386747034
48	NC_017736	A	6	6	12538	12543	100 %	0 %	0 %	0 %	386747034
49	NC_017736	A	6	6	12609	12614	100 %	0 %	0 %	0 %	386747035
50	NC_017736	A	8	8	12705	12712	100 %	0 %	0 %	0 %	386747035
51	NC_017736	A	6	6	13089	13094	100 %	0 %	0 %	0 %	386747035
52	NC_017736	T	6	6	13209	13214	0 %	100 %	0 %	0 %	386747035
53	NC_017736	A	6	6	13365	13370	100 %	0 %	0 %	0 %	386747035
54	NC_017736	T	6	6	13656	13661	0 %	100 %	0 %	0 %	386747035
55	NC_017736	A	6	6	13869	13874	100 %	0 %	0 %	0 %	386747035
56	NC_017736	A	6	6	13930	13935	100 %	0 %	0 %	0 %	386747035
57	NC_017736	C	6	6	14013	14018	0 %	0 %	0 %	100 %	386747035

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.