MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 chromosome

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017735	AATTAT	2	12	7938	7949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017735	AAAATT	2	12	10694	10705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017735	ACCTAA	2	12	10986	10997	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017735	ACCTAA	2	12	11145	11156	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017735	CTTAAC	2	12	100758	100769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017735	TAATTA	2	12	100811	100822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017735	TTTTAG	2	12	116868	116879	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017735	TTTTAG	2	12	141975	141986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017735	CTAACA	2	12	178127	178138	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017735	CATACA	2	12	203447	203458	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017735	AGTCGC	2	12	203677	203688	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017735	TTATTT	2	12	217767	217778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017735	AATTAA	2	12	236203	236214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017735	CTACAA	2	12	245284	245295	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017735	ACAAAG	2	12	298793	298804	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017735	ACCAAG	2	12	301609	301620	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017735	CTAGAA	2	12	322025	322036	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017735	TGCATA	2	12	368541	368552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017735	TTAGGC	2	12	418275	418286	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017735	TGAAAT	2	12	419239	419250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017735	AACTCA	2	12	419926	419937	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017735	TTATTT	2	12	435796	435807	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017735	ATAATT	2	12	468307	468318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017735	TTAAAA	2	12	469052	469063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017735	TTTAAA	2	12	508011	508022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017735	TTTGAT	2	12	525260	525271	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017735	TTAATT	2	12	526953	526964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017735	TTTATA	2	12	558997	559008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017735	TTATAT	2	12	596637	596648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017735	ATTAAT	2	12	603295	603306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017735	TACTCC	2	12	604201	604212	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017735	TTAAAT	2	12	629362	629373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017735	TTGTAT	2	12	695869	695880	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017735	GTTTTT	2	12	703973	703984	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017735	AGACTT	2	12	708053	708064	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017735	TAATTT	2	12	739598	739609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017735	CAAAAA	2	12	743113	743124	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017735	GTATTT	2	12	743700	743711	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017735	GACAGA	2	12	784310	784321	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017735	TATTTT	2	12	797090	797101	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017735	TTTTCT	2	12	892533	892544	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017735	TTTTCT	2	12	893564	893575	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017735	ATTTTA	2	12	920515	920526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017735	ACAAAA	2	12	926502	926513	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017735	CCTTAG	2	12	948824	948835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017735	ACCTAA	2	12	997235	997246	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017735	TGGCAG	2	12	1012066	1012077	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017735	ACAAAG	2	12	1017083	1017094	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017735	CTATTT	2	12	1031158	1031169	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017735	ATTTTT	2	12	1066232	1066243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017735	ATAATT	2	12	1068891	1068902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017735	CAAAAA	2	12	1088944	1088955	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017735	TTTATT	2	12	1161352	1161363	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017735	TTTTTA	2	12	1202855	1202866	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017735	ATTTTT	2	12	1278501	1278512	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017735	AAATAA	2	12	1321293	1321304	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017735	ACTTTT	2	12	1340123	1340134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017735	ACAATA	2	12	1340163	1340174	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017735	AATTTT	2	12	1351758	1351769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017735	TTTTCA	2	12	1357167	1357178	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017735	AGAACA	2	12	1384287	1384298	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017735	TTGGTT	2	12	1391547	1391558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017735	AGAATA	2	12	1400165	1400176	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017735	AAAATT	2	12	1400288	1400299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017735	TAAAGA	2	12	1413840	1413851	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017735	TATAGT	2	12	1422276	1422287	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017735	AGATAA	2	12	1422488	1422499	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017735	AATTTT	2	12	1466416	1466427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017735	TATTTT	2	12	1473049	1473060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017735	TCTTCG	2	12	1473294	1473305	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017735	TCTTTT	2	12	1473591	1473602	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017735	TATTGA	2	12	1474552	1474563	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017735	TTAATT	2	12	1475647	1475658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017735	AAAAAG	2	12	1507503	1507514	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017735	AACTAA	2	12	1507525	1507536	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017735	TATAAA	2	12	1511783	1511794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017735	AGCTTG	2	12	1511882	1511893	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017735	GTTATA	2	12	1513251	1513262	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017735	TTAAGA	2	12	1513317	1513328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017735	TAAAAT	2	12	1534122	1534133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017735	AATTAA	2	12	1542329	1542340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017735	AAAAAG	2	12	1545640	1545651	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017735	TCAATA	2	12	1546547	1546558	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017735	AGAATA	2	12	1583078	1583089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017735	ATTTTA	2	12	1586344	1586355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017735	GGCTAA	2	12	1603381	1603392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017735	TTGTTT	2	12	1649299	1649310	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017735	TTGTTT	2	12	1649364	1649375	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017735	TTGTTT	2	12	1649429	1649440	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017735	TTGTTT	2	12	1649494	1649505	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017735	TTGTTT	2	12	1649816	1649827	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017735	TTGTTT	2	12	1649881	1649892	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017735	TTTCTT	2	12	1654704	1654715	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017735	TTGATT	2	12	1663524	1663535	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017735	TTAGTG	2	12	1663857	1663868	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017735	AGTTCT	2	12	1673852	1673863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017735	TTTAAA	2	12	1674489	1674500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017735	AATTTT	2	12	1680518	1680529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017735	ATCAAA	2	12	1701331	1701342	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017735	TTTTAT	2	12	1733916	1733927	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017735	ATTATC	2	12	1748150	1748161	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017735	ATTTTT	2	12	1749327	1749338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017735	GGCTTA	2	12	1778326	1778337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017735	TTTAAT	2	12	1780923	1780934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017735	TCTTTA	2	12	1822911	1822922	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017735	TAAAAT	2	12	1823416	1823427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017735	ACAAAA	2	12	1823694	1823705	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.