MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 chromosome

Total Repeats: 751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017735	GCAGCT	2	12	1045	1056	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386747039
2	NC_017735	TGAAAC	2	12	5322	5333	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386747043
3	NC_017735	GAAAAA	2	12	8871	8882	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386747045
4	NC_017735	TGTCTT	2	12	17777	17788	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386747049
5	NC_017735	TATCTT	2	12	23154	23165	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386747057
6	NC_017735	CAAATT	2	12	23452	23463	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386747057
7	NC_017735	CAATGC	2	12	27306	27317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386747062
8	NC_017735	AAAGAT	2	12	28796	28807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386747063
9	NC_017735	GAATTA	2	12	28823	28834	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386747063
10	NC_017735	TAGAAG	2	12	29178	29189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386747063
11	NC_017735	CTAAGA	2	12	41204	41215	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386747070
12	NC_017735	TTTAGT	2	12	41611	41622	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386747071
13	NC_017735	ACTAAT	2	12	47810	47821	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386747078
14	NC_017735	TGTTCT	2	12	49390	49401	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386747081
15	NC_017735	TCAAAT	2	12	50097	50108	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386747082
16	NC_017735	CCTTGT	2	12	51044	51055	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386747082
17	NC_017735	GCCCCA	2	12	52899	52910	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386747085
18	NC_017735	ACCATT	2	12	62464	62475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747096
19	NC_017735	TATGCC	2	12	62727	62738	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386747096
20	NC_017735	GCTCAA	2	12	64560	64571	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386747097
21	NC_017735	TTAGAG	2	12	65197	65208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747098
22	NC_017735	GTGGCT	2	12	65879	65890	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386747098
23	NC_017735	CTGGTT	2	12	65897	65908	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386747098
24	NC_017735	TATTAG	2	12	66197	66208	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386747098
25	NC_017735	CCTTAG	2	12	76174	76185	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386747107
26	NC_017735	AGAAAC	2	12	76559	76570	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386747107
27	NC_017735	TCAAAA	2	12	77723	77734	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386747108
28	NC_017735	TTGTGG	2	12	80644	80655	0 %	50 %	50 %	0 %	386747111
29	NC_017735	AAGCTT	2	12	83019	83030	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386747115
30	NC_017735	TTTGAT	2	12	83414	83425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386747116
31	NC_017735	TTAGAA	2	12	84686	84697	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386747118
32	NC_017735	AAATGA	2	12	86213	86224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386747120
33	NC_017735	TGAGAA	2	12	88789	88800	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386747121
34	NC_017735	GGCTTT	2	12	89003	89014	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386747121
35	NC_017735	TTGGTT	2	12	89554	89565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747122
36	NC_017735	ATTGCT	2	12	91906	91917	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386747125
37	NC_017735	GCTAAA	2	12	92091	92102	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386747126
38	NC_017735	TTAGAT	2	12	105281	105292	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386747137
39	NC_017735	GAATAC	2	12	106306	106317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386747138
40	NC_017735	CAAACA	2	12	110036	110047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747142
41	NC_017735	AGCTGG	2	12	111065	111076	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386747142
42	NC_017735	AAAGCT	2	12	111120	111131	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386747142
43	NC_017735	TAAAGA	2	12	114062	114073	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386747145
44	NC_017735	AGAAAA	2	12	114759	114770	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386747146
45	NC_017735	GGCTTT	2	12	115440	115451	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386747147
46	NC_017735	TTTCTT	2	12	118268	118279	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386747151
47	NC_017735	AAATCT	2	12	118771	118782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386747152
48	NC_017735	TATGCC	2	12	120092	120103	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386747155
49	NC_017735	ATTAAC	2	12	127466	127477	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386747160
50	NC_017735	ATTGAT	2	12	129172	129183	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386747162
51	NC_017735	TGTAGA	2	12	132977	132988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747168
52	NC_017735	TTTTGG	2	12	138908	138919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747175
53	NC_017735	CTTCAG	2	12	141054	141065	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386747175
54	NC_017735	ATTTAG	2	12	141622	141633	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386747175
55	NC_017735	GAAGTG	2	12	143057	143068	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386747178
56	NC_017735	TCGTAT	2	12	143156	143167	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386747178
57	NC_017735	TGGTGA	2	12	144048	144059	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386747179
58	NC_017735	CCCATG	2	12	145889	145900	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386747181
59	NC_017735	GCGATG	2	12	148086	148097	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386747182
60	NC_017735	CTTACA	2	12	148276	148287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747182
61	NC_017735	TTGCAT	2	12	151531	151542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386747184
62	NC_017735	AGCATA	2	12	151730	151741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386747184
63	NC_017735	TAAACA	2	12	156849	156860	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386747186
64	NC_017735	GGCACA	2	12	158084	158095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386747188
65	NC_017735	AGTGGG	2	12	159347	159358	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386747190
66	NC_017735	AAATTG	2	12	162015	162026	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386747197
67	NC_017735	GCTCAA	2	12	166336	166347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386747201
68	NC_017735	GAAAGT	2	12	166351	166362	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386747201
69	NC_017735	ACAAAA	2	12	168204	168215	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386747201
70	NC_017735	ACCAAC	2	12	168292	168303	50 %	0 %	0 %	50 %	386747201
71	NC_017735	TTTGGA	2	12	168553	168564	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386747201
72	NC_017735	ACGCTA	2	12	172072	172083	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386747203
73	NC_017735	GATAAA	2	12	173324	173335	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386747204
74	NC_017735	AAGCTC	2	12	174182	174193	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386747205
75	NC_017735	CTAGAG	2	12	174828	174839	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386747206
76	NC_017735	AGCGAA	2	12	179620	179631	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386747212
77	NC_017735	CAATGT	2	12	181404	181415	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386747213
78	NC_017735	ATTTAA	2	12	185201	185212	50 %	50 %	0 %	0 %	386747219
79	NC_017735	TAAAAA	2	12	186125	186136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386747221
80	NC_017735	TTGCAT	2	12	189440	189451	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386747225
81	NC_017735	TTTTTA	2	12	189822	189833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386747226
82	NC_017735	ATTTTT	2	12	190674	190685	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386747227
83	NC_017735	ATTAGT	2	12	190911	190922	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386747227
84	NC_017735	CTTTTT	2	12	193078	193089	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386747228
85	NC_017735	CTATGT	2	12	194206	194217	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386747228
86	NC_017735	CCTTGT	2	12	194418	194429	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386747228
87	NC_017735	CATGCT	2	12	195407	195418	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386747228
88	NC_017735	CTTTTG	2	12	195953	195964	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386747228
89	NC_017735	CCATGC	2	12	200449	200460	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386747236
90	NC_017735	GTTAGT	2	12	202708	202719	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386747238
91	NC_017735	AGCTAC	2	12	205334	205345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386747241
92	NC_017735	TAAAGC	2	12	207033	207044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386747243
93	NC_017735	ATTCTT	2	12	207737	207748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386747243
94	NC_017735	CTAAGC	2	12	208353	208364	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386747243
95	NC_017735	GATAAA	2	12	212068	212079	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386747246
96	NC_017735	ATTGAT	2	12	215831	215842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386747249
97	NC_017735	TTTAAA	2	12	216437	216448	50 %	50 %	0 %	0 %	386747249
98	NC_017735	TTCTAA	2	12	222201	222212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386747254
99	NC_017735	CTTTTT	2	12	222665	222676	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386747254
100	NC_017735	ACGCAT	2	12	223796	223807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386747255
101	NC_017735	AGTGCG	2	12	224900	224911	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386747256
102	NC_017735	TGTTTG	2	12	226027	226038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747257
103	NC_017735	TACCAT	2	12	230268	230279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747262
104	NC_017735	CTTTAG	2	12	231341	231352	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386747263
105	NC_017735	TAGAAT	2	12	232369	232380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386747264
106	NC_017735	TTATGG	2	12	232841	232852	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386747264
107	NC_017735	TTTTTC	2	12	233368	233379	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386747265
108	NC_017735	TTATGG	2	12	236622	236633	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386747266
109	NC_017735	GAAAAA	2	12	239021	239032	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386747269
110	NC_017735	AAAATA	2	12	239704	239715	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386747270
111	NC_017735	CAATAC	2	12	242399	242410	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386747274
112	NC_017735	TTCGCC	2	12	243027	243038	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386747274
113	NC_017735	CAATTT	2	12	248822	248833	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386747278
114	NC_017735	CTTAGC	2	12	250640	250651	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386747280
115	NC_017735	ACAGCT	2	12	256280	256291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386747285
116	NC_017735	AAAATC	2	12	263249	263260	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386747289
117	NC_017735	TCAAAA	2	12	269286	269297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386747297
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