MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 chromosome

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017735	TTTGT	2	10	2420	2429	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017735	CCTCT	2	10	7976	7985	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_017735	ATGAG	2	10	8469	8478	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017735	ACGCA	2	10	8774	8783	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017735	AAAAC	2	10	11019	11028	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017735	GTGTG	2	10	13513	13522	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017735	ACCAC	2	10	30050	30059	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017735	AGTAA	2	10	32986	32995	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017735	TTCAT	2	10	43155	43164	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017735	AAAAG	2	10	46435	46444	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017735	CTTAG	2	10	51755	51764	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017735	ATTTT	2	10	59400	59409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017735	TTTTC	2	10	66587	66596	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017735	ATATA	2	10	67153	67162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017735	TTTAT	2	10	69912	69921	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017735	ATAAA	2	10	116894	116903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017735	CCAAG	2	10	120801	120810	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017735	CAATA	2	10	120823	120832	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017735	TTCAA	2	10	122314	122323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017735	CTCAT	2	10	122544	122553	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017735	TCACT	2	10	124022	124031	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017735	TACTT	2	10	124322	124331	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017735	TAAAG	2	10	124954	124963	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017735	TTTGG	2	10	131570	131579	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017735	CTTTT	2	10	153142	153151	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017735	AGATG	2	10	153637	153646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017735	CACGA	2	10	154202	154211	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017735	TTACC	2	10	155000	155009	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017735	AGATA	2	10	175296	175305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017735	TAGTG	2	10	180971	180980	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017735	AATGA	2	10	203496	203505	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017735	AGATT	2	10	206368	206377	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017735	GGTTT	2	10	209259	209268	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017735	TGTAT	2	10	213295	213304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017735	TACTA	2	10	230851	230860	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017735	GCCAA	2	10	253538	253547	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017735	ATTTT	2	10	256034	256043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017735	AAAAT	2	10	261439	261448	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017735	AAGCG	2	10	261557	261566	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017735	CCTTA	2	10	261669	261678	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017735	TGAGC	2	10	289317	289326	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017735	ACTAA	2	10	291216	291225	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017735	ATTTT	2	10	292131	292140	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017735	TTTTA	2	10	293270	293279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017735	TATTT	2	10	295905	295914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017735	AAAAT	2	10	298655	298664	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017735	TTTTA	2	10	315706	315715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017735	TTATC	2	10	319014	319023	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017735	ATTTT	2	10	322111	322120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017735	AGTTC	2	10	330371	330380	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017735	ATTTT	2	10	349660	349669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017735	ACTAT	2	10	350539	350548	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017735	TCACA	2	10	350678	350687	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017735	ACTTT	2	10	362822	362831	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017735	ATTTT	2	10	366251	366260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017735	ATTTA	2	10	366373	366382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017735	ATTTC	2	10	368166	368175	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017735	TTTAA	2	10	369451	369460	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017735	AAGTA	2	10	373148	373157	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017735	TTTAA	2	10	379509	379518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017735	AAGTA	2	10	383083	383092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017735	AATTT	2	10	383638	383647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017735	AATAA	2	10	383691	383700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017735	AAGTA	2	10	393482	393491	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017735	AAGTA	2	10	393575	393584	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017735	AAGTA	2	10	393668	393677	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017735	AAGTA	2	10	393761	393770	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017735	AAGTA	2	10	393854	393863	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017735	AAGTA	2	10	393947	393956	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017735	TTAAA	2	10	414708	414717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017735	TCAAG	2	10	415095	415104	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017735	TAAAG	2	10	418599	418608	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017735	TAAAG	2	10	418991	419000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017735	AAATT	2	10	419284	419293	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017735	ACAAT	2	10	420074	420083	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017735	CAAAT	2	10	424179	424188	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017735	ATGAT	2	10	434940	434949	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017735	TATAT	2	10	440155	440164	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017735	TTTAC	2	10	442155	442164	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017735	TAAAA	2	10	451650	451659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017735	TTGGT	2	10	457803	457812	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017735	TAGTC	2	10	457815	457824	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017735	TTTTG	2	10	457926	457935	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017735	ATAAA	2	10	458624	458633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017735	TTTGC	2	10	458829	458838	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017735	TTCAA	2	10	464407	464416	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017735	CTCAT	2	10	464637	464646	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017735	TCACT	2	10	466115	466124	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017735	TACTT	2	10	466415	466424	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017735	GATAA	2	10	468358	468367	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017735	ATTTA	2	10	469225	469234	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017735	ATTTA	2	10	510838	510847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017735	GTTTA	2	10	511168	511177	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017735	AGAAA	2	10	511225	511234	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017735	TTTGA	2	10	511403	511412	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017735	TAGCA	2	10	514284	514293	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017735	TATAT	2	10	525208	525217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017735	AATAA	2	10	527611	527620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017735	TTGTT	2	10	570191	570200	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017735	TTTTC	2	10	578938	578947	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017735	TAATC	2	10	579678	579687	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017735	TTCGT	2	10	602989	602998	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017735	ATTAT	2	10	603316	603325	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017735	CTTGT	2	10	605467	605476	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017735	CTAGA	2	10	619466	619475	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017735	TTTAA	2	10	620294	620303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017735	ATTTT	2	10	637351	637360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017735	ATATA	2	10	642651	642660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017735	ATTTT	2	10	670822	670831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017735	GTTAA	2	10	688792	688801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017735	TAAAA	2	10	695104	695113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017735	AAATG	2	10	695510	695519	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017735	TAAAA	2	10	695525	695534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017735	TTCAC	2	10	706268	706277	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017735	TTTAA	2	10	708009	708018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017735	TAAAG	2	10	713274	713283	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017735	ATAAA	2	10	722911	722920	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017735	TTAAA	2	10	734166	734175	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017735	TTAAA	2	10	741221	741230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017735	CTTAA	2	10	743896	743905	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017735	ATTTG	2	10	749134	749143	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017735	CTTTT	2	10	756969	756978	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017735	TTTTG	2	10	766978	766987	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017735	TTTTA	2	10	780036	780045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017735	CAATG	2	10	784152	784161	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017735	TGTAG	2	10	785218	785227	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017735	TGAAA	2	10	799535	799544	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017735	GAAAG	2	10	803037	803046	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017735	AGGTA	2	10	804696	804705	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017735	CAAAA	2	10	829556	829565	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017735	CCTTT	2	10	839946	839955	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017735	TATAT	2	10	846693	846702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017735	TTATT	2	10	847303	847312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017735	AACAA	2	10	847691	847700	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017735	TAAAA	2	10	847701	847710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017735	TTTAA	2	10	849065	849074	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017735	ATTTG	2	10	851804	851813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017735	GTTTT	2	10	893296	893305	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017735	TTTGT	2	10	893580	893589	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017735	GTTTT	2	10	893618	893627	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017735	TACAA	2	10	926251	926260	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017735	AACAA	2	10	928945	928954	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017735	TAATA	2	10	937055	937064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017735	TATTT	2	10	939789	939798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017735	TTTAC	2	10	949178	949187	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017735	ATTTA	2	10	949416	949425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017735	TGTAT	2	10	949564	949573	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017735	ACAAT	2	10	950089	950098	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.