MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 chromosome

Total Repeats: 1208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017735	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386747039
2	NC_017735	TCTTT	2	10	1743	1752	0 %	80 %	0 %	20 %	386747040
3	NC_017735	TTTCT	2	10	5987	5996	0 %	80 %	0 %	20 %	386747043
4	NC_017735	CTTCA	2	10	6498	6507	20 %	40 %	0 %	40 %	386747043
5	NC_017735	AATTT	2	10	6826	6835	40 %	60 %	0 %	0 %	386747043
6	NC_017735	TTGTT	2	10	7161	7170	0 %	80 %	20 %	0 %	386747044
7	NC_017735	TTACT	2	10	15094	15103	20 %	60 %	0 %	20 %	386747048
8	NC_017735	GTTTG	2	10	18079	18088	0 %	60 %	40 %	0 %	386747049
9	NC_017735	TGCCT	2	10	18295	18304	0 %	40 %	20 %	40 %	386747050
10	NC_017735	AAGTG	2	10	18445	18454	40 %	20 %	40 %	0 %	386747050
11	NC_017735	TTCAT	2	10	19966	19975	20 %	60 %	0 %	20 %	386747052
12	NC_017735	GCACA	2	10	20350	20359	40 %	0 %	20 %	40 %	386747053
13	NC_017735	GTTCT	2	10	20922	20931	0 %	60 %	20 %	20 %	386747053
14	NC_017735	ATCAC	2	10	22492	22501	40 %	20 %	0 %	40 %	386747056
15	NC_017735	CGCTA	2	10	23401	23410	20 %	20 %	20 %	40 %	386747057
16	NC_017735	CCCAC	2	10	23495	23504	20 %	0 %	0 %	80 %	386747057
17	NC_017735	GAATT	2	10	26696	26705	40 %	40 %	20 %	0 %	386747061
18	NC_017735	ACCCA	2	10	27164	27173	40 %	0 %	0 %	60 %	386747062
19	NC_017735	TACCA	2	10	27864	27873	40 %	20 %	0 %	40 %	386747062
20	NC_017735	ATGGA	2	10	32275	32284	40 %	20 %	40 %	0 %	386747064
21	NC_017735	TATCT	2	10	33422	33431	20 %	60 %	0 %	20 %	386747065
22	NC_017735	TTTCA	2	10	34760	34769	20 %	60 %	0 %	20 %	386747066
23	NC_017735	ACACC	2	10	41921	41930	40 %	0 %	0 %	60 %	386747072
24	NC_017735	CAAAA	2	10	43929	43938	80 %	0 %	0 %	20 %	386747074
25	NC_017735	GCCAT	2	10	45300	45309	20 %	20 %	20 %	40 %	386747075
26	NC_017735	ATTTG	2	10	47841	47850	20 %	60 %	20 %	0 %	386747078
27	NC_017735	TAAAA	2	10	52257	52266	80 %	20 %	0 %	0 %	386747084
28	NC_017735	AAATA	2	10	52916	52925	80 %	20 %	0 %	0 %	386747085
29	NC_017735	GAAAA	2	10	56667	56676	80 %	0 %	20 %	0 %	386747090
30	NC_017735	AATAG	2	10	57723	57732	60 %	20 %	20 %	0 %	386747091
31	NC_017735	CGCAC	2	10	58087	58096	20 %	0 %	20 %	60 %	386747092
32	NC_017735	CAATA	2	10	58945	58954	60 %	20 %	0 %	20 %	386747093
33	NC_017735	CCCCA	2	10	62202	62211	20 %	0 %	0 %	80 %	386747095
34	NC_017735	GATAG	2	10	62274	62283	40 %	20 %	40 %	0 %	386747095
35	NC_017735	TTATT	2	10	64184	64193	20 %	80 %	0 %	0 %	386747097
36	NC_017735	TTTGA	2	10	65070	65079	20 %	60 %	20 %	0 %	386747098
37	NC_017735	TGCTT	2	10	65132	65141	0 %	60 %	20 %	20 %	386747098
38	NC_017735	TGTTT	2	10	67715	67724	0 %	80 %	20 %	0 %	386747099
39	NC_017735	ATTGA	2	10	67833	67842	40 %	40 %	20 %	0 %	386747099
40	NC_017735	TGTTT	2	10	67965	67974	0 %	80 %	20 %	0 %	386747099
41	NC_017735	CATAG	2	10	68010	68019	40 %	20 %	20 %	20 %	386747099
42	NC_017735	TGATT	2	10	69188	69197	20 %	60 %	20 %	0 %	386747099
43	NC_017735	CAATG	2	10	71874	71883	40 %	20 %	20 %	20 %	386747103
44	NC_017735	GTGAA	2	10	72849	72858	40 %	20 %	40 %	0 %	386747104
45	NC_017735	TTTCT	2	10	72964	72973	0 %	80 %	0 %	20 %	386747104
46	NC_017735	AAAGG	2	10	73999	74008	60 %	0 %	40 %	0 %	386747104
47	NC_017735	TCAAA	2	10	74648	74657	60 %	20 %	0 %	20 %	386747105
48	NC_017735	AATCA	2	10	76586	76595	60 %	20 %	0 %	20 %	386747107
49	NC_017735	TTTAT	2	10	82633	82642	20 %	80 %	0 %	0 %	386747114
50	NC_017735	TTTTG	2	10	82925	82934	0 %	80 %	20 %	0 %	386747115
51	NC_017735	TATTT	2	10	83111	83120	20 %	80 %	0 %	0 %	386747115
52	NC_017735	CAAGA	2	10	85003	85012	60 %	0 %	20 %	20 %	386747118
53	NC_017735	CTTAG	2	10	86067	86076	20 %	40 %	20 %	20 %	386747120
54	NC_017735	TGTTT	2	10	86180	86189	0 %	80 %	20 %	0 %	386747120
55	NC_017735	TCAAA	2	10	86722	86731	60 %	20 %	0 %	20 %	386747120
56	NC_017735	GGGGC	2	10	87845	87854	0 %	0 %	80 %	20 %	386747121
57	NC_017735	TCACT	2	10	89098	89107	20 %	40 %	0 %	40 %	386747121
58	NC_017735	CTTTT	2	10	90276	90285	0 %	80 %	0 %	20 %	386747122
59	NC_017735	AGACC	2	10	90415	90424	40 %	0 %	20 %	40 %	386747122
60	NC_017735	CTTTT	2	10	93655	93664	0 %	80 %	0 %	20 %	386747126
61	NC_017735	TTCTC	2	10	94230	94239	0 %	60 %	0 %	40 %	386747127
62	NC_017735	GCTTT	2	10	99997	100006	0 %	60 %	20 %	20 %	386747130
63	NC_017735	ACAAA	2	10	100457	100466	80 %	0 %	0 %	20 %	386747130
64	NC_017735	TAAAA	2	10	102913	102922	80 %	20 %	0 %	0 %	386747134
65	NC_017735	AAAAG	2	10	105553	105562	80 %	0 %	20 %	0 %	386747137
66	NC_017735	ATTTT	2	10	105965	105974	20 %	80 %	0 %	0 %	386747138
67	NC_017735	AAAAT	2	10	107759	107768	80 %	20 %	0 %	0 %	386747139
68	NC_017735	ACTTT	2	10	108395	108404	20 %	60 %	0 %	20 %	386747140
69	NC_017735	ATTTG	2	10	110675	110684	20 %	60 %	20 %	0 %	386747142
70	NC_017735	AAGAA	2	10	112243	112252	80 %	0 %	20 %	0 %	386747144
71	NC_017735	AAGTG	2	10	113225	113234	40 %	20 %	40 %	0 %	386747145
72	NC_017735	AATTT	2	10	113868	113877	40 %	60 %	0 %	0 %	386747145
73	NC_017735	TGTGG	2	10	115647	115656	0 %	40 %	60 %	0 %	386747147
74	NC_017735	CTTTT	2	10	116342	116351	0 %	80 %	0 %	20 %	386747148
75	NC_017735	ATTGC	2	10	117390	117399	20 %	40 %	20 %	20 %	386747149
76	NC_017735	ATGGC	2	10	126509	126518	20 %	20 %	40 %	20 %	386747159
77	NC_017735	TTTGA	2	10	127737	127746	20 %	60 %	20 %	0 %	386747160
78	NC_017735	ACCCT	2	10	128937	128946	20 %	20 %	0 %	60 %	386747162
79	NC_017735	TCTTT	2	10	130668	130677	0 %	80 %	0 %	20 %	386747165
80	NC_017735	TTGGC	2	10	132382	132391	0 %	40 %	40 %	20 %	386747167
81	NC_017735	AAAAT	2	10	132574	132583	80 %	20 %	0 %	0 %	386747168
82	NC_017735	TTCAT	2	10	133408	133417	20 %	60 %	0 %	20 %	386747168
83	NC_017735	TTCCT	2	10	133758	133767	0 %	60 %	0 %	40 %	386747169
84	NC_017735	ATCTA	2	10	134870	134879	40 %	40 %	0 %	20 %	386747170
85	NC_017735	TCATT	2	10	136390	136399	20 %	60 %	0 %	20 %	386747172
86	NC_017735	CATTT	2	10	136717	136726	20 %	60 %	0 %	20 %	386747173
87	NC_017735	AAAGC	2	10	142219	142228	60 %	0 %	20 %	20 %	386747177
88	NC_017735	AGCCC	2	10	142946	142955	20 %	0 %	20 %	60 %	386747178
89	NC_017735	CCAAA	2	10	143365	143374	60 %	0 %	0 %	40 %	386747178
90	NC_017735	CACCC	2	10	159296	159305	20 %	0 %	0 %	80 %	386747190
91	NC_017735	TTGAA	2	10	159396	159405	40 %	40 %	20 %	0 %	386747191
92	NC_017735	ACCAC	2	10	161672	161681	40 %	0 %	0 %	60 %	386747196
93	NC_017735	GGGCT	2	10	162829	162838	0 %	20 %	60 %	20 %	386747197
94	NC_017735	CAAGC	2	10	168279	168288	40 %	0 %	20 %	40 %	386747201
95	NC_017735	CTGGG	2	10	172028	172037	0 %	20 %	60 %	20 %	386747203
96	NC_017735	CTCAT	2	10	172346	172355	20 %	40 %	0 %	40 %	386747203
97	NC_017735	CGCTT	2	10	172824	172833	0 %	40 %	20 %	40 %	386747203
98	NC_017735	GAAGG	2	10	174112	174121	40 %	0 %	60 %	0 %	386747205
99	NC_017735	TGCCC	2	10	175403	175412	0 %	20 %	20 %	60 %	386747207
100	NC_017735	GTAGA	2	10	175443	175452	40 %	20 %	40 %	0 %	386747207
101	NC_017735	AGCGT	2	10	179164	179173	20 %	20 %	40 %	20 %	386747212
102	NC_017735	TAAAA	2	10	181313	181322	80 %	20 %	0 %	0 %	386747213
103	NC_017735	GTTTT	2	10	182396	182405	0 %	80 %	20 %	0 %	386747215
104	NC_017735	CTTTT	2	10	182484	182493	0 %	80 %	0 %	20 %	386747215
105	NC_017735	TAGAT	2	10	182718	182727	40 %	40 %	20 %	0 %	386747216
106	NC_017735	TTTAG	2	10	182908	182917	20 %	60 %	20 %	0 %	386747216
107	NC_017735	CGCCT	2	10	185388	185397	0 %	20 %	20 %	60 %	386747220
108	NC_017735	TTTTG	2	10	186544	186553	0 %	80 %	20 %	0 %	386747221
109	NC_017735	ATTTC	2	10	186600	186609	20 %	60 %	0 %	20 %	386747221
110	NC_017735	TGTTA	2	10	187627	187636	20 %	60 %	20 %	0 %	386747223
111	NC_017735	CATAC	2	10	187767	187776	40 %	20 %	0 %	40 %	386747223
112	NC_017735	CTTGT	2	10	188882	188891	0 %	60 %	20 %	20 %	386747225
113	NC_017735	TTGTA	2	10	189213	189222	20 %	60 %	20 %	0 %	386747225
114	NC_017735	CAAAT	2	10	190882	190891	60 %	20 %	0 %	20 %	386747227
115	NC_017735	TAGTT	2	10	194894	194903	20 %	60 %	20 %	0 %	386747228
116	NC_017735	TTGGT	2	10	195266	195275	0 %	60 %	40 %	0 %	386747228
117	NC_017735	TTAAT	2	10	198971	198980	40 %	60 %	0 %	0 %	386747234
118	NC_017735	AAATG	2	10	199612	199621	60 %	20 %	20 %	0 %	386747235
119	NC_017735	TCTGC	2	10	200503	200512	0 %	40 %	20 %	40 %	386747236
120	NC_017735	ATTTA	2	10	201271	201280	40 %	60 %	0 %	0 %	386747237
121	NC_017735	ATTTT	2	10	201629	201638	20 %	80 %	0 %	0 %	386747237
122	NC_017735	ACTAC	2	10	202208	202217	40 %	20 %	0 %	40 %	386747237
123	NC_017735	TATAA	2	10	206527	206536	60 %	40 %	0 %	0 %	386747243
124	NC_017735	GGAAT	2	10	209369	209378	40 %	20 %	40 %	0 %	386747244
125	NC_017735	TGTCA	2	10	210727	210736	20 %	40 %	20 %	20 %	386747245
126	NC_017735	TTAAA	2	10	210773	210782	60 %	40 %	0 %	0 %	386747245
127	NC_017735	TTGAG	2	10	210920	210929	20 %	40 %	40 %	0 %	386747245
128	NC_017735	TGGTT	2	10	214143	214152	0 %	60 %	40 %	0 %	386747248
129	NC_017735	AAACC	2	10	217240	217249	60 %	0 %	0 %	40 %	386747249
130	NC_017735	AAGCG	2	10	218759	218768	40 %	0 %	40 %	20 %	386747250
131	NC_017735	AATGC	2	10	219385	219394	40 %	20 %	20 %	20 %	386747251
132	NC_017735	AAGCA	2	10	224588	224597	60 %	0 %	20 %	20 %	386747255
133	NC_017735	CCACC	2	10	229006	229015	20 %	0 %	0 %	80 %	386747261
134	NC_017735	TAAAC	2	10	229115	229124	60 %	20 %	0 %	20 %	386747261
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