MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 chromosome

Total Repeats: 17511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017735	CTT	2	6	35	40	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747037
2	NC_017735	ATT	2	6	305	310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747037
3	NC_017735	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747037
4	NC_017735	AAT	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747037
5	NC_017735	TAG	2	6	456	461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747038
6	NC_017735	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747038
7	NC_017735	CAT	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747038
8	NC_017735	AAT	2	6	697	702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747038
9	NC_017735	AAT	2	6	744	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747038
10	NC_017735	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747038
11	NC_017735	ATA	2	6	820	825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747038
12	NC_017735	TCA	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747039
13	NC_017735	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747039
14	NC_017735	ATT	2	6	1165	1170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747039
15	NC_017735	TTA	2	6	1240	1245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747039
16	NC_017735	TAC	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747039
17	NC_017735	TGA	2	6	1358	1363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747039
18	NC_017735	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747039
19	NC_017735	TCA	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747039
20	NC_017735	ATT	2	6	1841	1846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747040
21	NC_017735	TTC	2	6	1970	1975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747040
22	NC_017735	CAT	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747040
23	NC_017735	ATG	2	6	2094	2099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747040
24	NC_017735	TGG	2	6	2180	2185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747040
25	NC_017735	ACT	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747040
26	NC_017735	AGA	2	6	2536	2541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747041
27	NC_017735	TGA	2	6	2659	2664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747041
28	NC_017735	AGT	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747041
29	NC_017735	GTG	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747041
30	NC_017735	AGA	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747041
31	NC_017735	TGG	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747041
32	NC_017735	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747042
33	NC_017735	TGA	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747042
34	NC_017735	CTA	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747042
35	NC_017735	ATT	2	6	3912	3917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747042
36	NC_017735	TAG	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747042
37	NC_017735	CAT	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747043
38	NC_017735	CTG	2	6	5258	5263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386747043
39	NC_017735	TCT	2	6	5275	5280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
40	NC_017735	CTT	2	6	5381	5386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
41	NC_017735	CGC	2	6	5465	5470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386747043
42	NC_017735	AGC	2	6	5487	5492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386747043
43	NC_017735	TAA	2	6	5525	5530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747043
44	NC_017735	TCA	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747043
45	NC_017735	TGC	2	6	5595	5600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386747043
46	NC_017735	ACC	2	6	5601	5606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386747043
47	NC_017735	CTT	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
48	NC_017735	AGC	2	6	5697	5702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386747043
49	NC_017735	TTG	2	6	5777	5782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747043
50	NC_017735	TCA	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747043
51	NC_017735	GTG	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747043
52	NC_017735	TTC	2	6	5882	5887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
53	NC_017735	TTC	2	6	5937	5942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
54	NC_017735	ACC	2	6	5955	5960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386747043
55	NC_017735	GAT	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747043
56	NC_017735	GAA	2	6	6146	6151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747043
57	NC_017735	CTT	2	6	6311	6316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
58	NC_017735	TCT	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
59	NC_017735	CAG	2	6	6521	6526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386747043
60	NC_017735	CTT	2	6	6542	6547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
61	NC_017735	TGT	2	6	6576	6581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747043
62	NC_017735	CTG	2	6	6593	6598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386747043
63	NC_017735	CGG	2	6	6602	6607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386747043
64	NC_017735	CTT	2	6	6620	6625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
65	NC_017735	CAT	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747043
66	NC_017735	ATG	2	6	6925	6930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747044
67	NC_017735	ACA	2	6	6940	6945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747044
68	NC_017735	TCT	2	6	6974	6979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747044
69	NC_017735	TTC	3	9	7171	7179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747044
70	NC_017735	CTA	2	6	7188	7193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747044
71	NC_017735	CAA	2	6	8923	8928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747045
72	NC_017735	CAA	2	6	8935	8940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747045
73	NC_017735	ATG	2	6	9088	9093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747045
74	NC_017735	GAT	2	6	9094	9099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747045
75	NC_017735	GGA	2	6	9124	9129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386747045
76	NC_017735	TGG	2	6	9147	9152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747045
77	NC_017735	TCA	2	6	9224	9229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747045
78	NC_017735	CTA	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747045
79	NC_017735	CTG	2	6	9329	9334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386747045
80	NC_017735	GTT	2	6	9370	9375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747045
81	NC_017735	ACA	2	6	9447	9452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747045
82	NC_017735	ACT	2	6	9527	9532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747045
83	NC_017735	ACC	2	6	9544	9549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386747045
84	NC_017735	TAT	2	6	9577	9582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747045
85	NC_017735	CAA	2	6	9628	9633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747045
86	NC_017735	AAG	2	6	9638	9643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747045
87	NC_017735	TAT	2	6	9645	9650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747045
88	NC_017735	TGA	2	6	9845	9850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747045
89	NC_017735	CAA	2	6	9893	9898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747045
90	NC_017735	TAT	2	6	9916	9921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747045
91	NC_017735	CTT	2	6	10008	10013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747045
92	NC_017735	CTA	2	6	10292	10297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747045
93	NC_017735	CTA	2	6	10308	10313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747045
94	NC_017735	TAG	2	6	11413	11418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747046
95	NC_017735	AAG	2	6	11713	11718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747046
96	NC_017735	ATA	2	6	11805	11810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747046
97	NC_017735	TTG	2	6	11828	11833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747046
98	NC_017735	TCA	2	6	11876	11881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747046
99	NC_017735	ATA	2	6	12076	12081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747046
100	NC_017735	CTT	2	6	12083	12088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747046
101	NC_017735	TTG	2	6	12093	12098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747046
102	NC_017735	ATA	2	6	12144	12149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747046
103	NC_017735	GGT	2	6	12177	12182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747046
104	NC_017735	TGT	2	6	12263	12268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747046
105	NC_017735	TAT	2	6	12320	12325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747046
106	NC_017735	TGT	2	6	12361	12366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747046
107	NC_017735	TCA	2	6	12472	12477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747046
108	NC_017735	GCG	2	6	12490	12495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386747046
109	NC_017735	AAG	2	6	12521	12526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747046
110	NC_017735	CAC	2	6	12626	12631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386747046
111	NC_017735	TAT	2	6	12638	12643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747046
112	NC_017735	TCT	2	6	12709	12714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747046
113	NC_017735	TTC	2	6	12744	12749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747046
114	NC_017735	TTG	2	6	12806	12811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747046
115	NC_017735	TTG	2	6	12919	12924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747046
116	NC_017735	GTT	2	6	13026	13031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747046
117	NC_017735	ATA	2	6	13624	13629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747047
118	NC_017735	CTT	2	6	13638	13643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747047
119	NC_017735	TTG	2	6	13714	13719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747047
120	NC_017735	CTT	2	6	14010	14015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747047
121	NC_017735	TAA	2	6	14410	14415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747047
122	NC_017735	CAC	2	6	14732	14737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386747048
123	NC_017735	CAT	2	6	14957	14962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747048
124	NC_017735	AGA	2	6	15461	15466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747048
125	NC_017735	AGA	2	6	15560	15565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747048
126	NC_017735	TCA	2	6	17300	17305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747049
127	NC_017735	GTT	2	6	17338	17343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747049
128	NC_017735	TTG	2	6	17350	17355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747049
129	NC_017735	TTA	3	9	17581	17589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747049
130	NC_017735	AGA	2	6	17817	17822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747049
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