MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori HUP-B14 plasmid pHPB14

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017734	GTT	2	6	148	153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017734	ATT	2	6	203	208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017734	CTT	2	6	347	352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017734	TCT	2	6	532	537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017734	TTG	2	6	643	648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745518
6	NC_017734	CAA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745519
7	NC_017734	ATG	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745519
8	NC_017734	ATG	2	6	1271	1276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745519
9	NC_017734	TTG	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745519
10	NC_017734	TCA	2	6	1409	1414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745519
11	NC_017734	TTC	2	6	1769	1774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745520
12	NC_017734	TTA	2	6	1928	1933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745520
13	NC_017734	ATG	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745520
14	NC_017734	TTG	2	6	2078	2083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
15	NC_017734	CGT	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745520
16	NC_017734	TTG	2	6	2180	2185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
17	NC_017734	CTT	2	6	2252	2257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745520
18	NC_017734	TTG	2	6	2332	2337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
19	NC_017734	AAG	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745520
20	NC_017734	TTG	2	6	2675	2680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
21	NC_017734	AAT	2	6	2824	2829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745520
22	NC_017734	CAC	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386745520
23	NC_017734	TGT	2	6	2850	2855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
24	NC_017734	AAT	2	6	2879	2884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745520
25	NC_017734	TTA	2	6	3035	3040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745520
26	NC_017734	GTT	2	6	3043	3048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
27	NC_017734	GGT	2	6	3055	3060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745520
28	NC_017734	GGT	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745520
29	NC_017734	TTG	2	6	3129	3134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
30	NC_017734	TTC	2	6	3295	3300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745520
31	NC_017734	TAA	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745520
32	NC_017734	GTT	2	6	3336	3341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
33	NC_017734	TTA	2	6	3451	3456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017734	ACT	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017734	CCT	2	6	3536	3541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017734	TAA	2	6	3669	3674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017734	AAG	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017734	AAG	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017734	AAG	2	6	3735	3740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017734	AAG	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017734	AAG	2	6	3779	3784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017734	GTT	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017734	ATT	2	6	4325	4330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017734	CTT	2	6	4469	4474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017734	TCT	2	6	4654	4659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017734	TTG	2	6	4765	4770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745522
47	NC_017734	CAA	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745523
48	NC_017734	ATG	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745523
49	NC_017734	ATG	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745523
50	NC_017734	TTG	2	6	5475	5480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745523
51	NC_017734	TCA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745523
52	NC_017734	TTC	2	6	5891	5896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745524
53	NC_017734	TTA	2	6	6050	6055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745524
54	NC_017734	ATG	2	6	6059	6064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745524
55	NC_017734	TTG	2	6	6200	6205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
56	NC_017734	CGT	2	6	6276	6281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745524
57	NC_017734	TTG	2	6	6302	6307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
58	NC_017734	CTT	2	6	6374	6379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745524
59	NC_017734	TTG	2	6	6454	6459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
60	NC_017734	AAG	2	6	6768	6773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745524
61	NC_017734	TTG	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
62	NC_017734	TTA	2	6	7151	7156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745524
63	NC_017734	GTT	2	6	7159	7164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
64	NC_017734	GGT	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745524
65	NC_017734	GGT	2	6	7228	7233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745524
66	NC_017734	TTG	2	6	7245	7250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
67	NC_017734	TTC	2	6	7282	7287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745524
68	NC_017734	ATT	2	6	7322	7327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745524
69	NC_017734	TTG	2	6	7340	7345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
70	NC_017734	TAA	2	6	7490	7495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017734	CCT	2	6	7631	7636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017734	TCC	2	6	7658	7663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017734	TAT	2	6	7799	7804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017734	ACA	2	6	7828	7833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017734	AAG	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017734	AAG	2	6	7917	7922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017734	AAG	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017734	AAG	2	6	7961	7966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.