MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori HUP-B14 chromosome

Total Repeats: 691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017733	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	386745530
2	NC_017733	CGCTTG	2	12	6219	6230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745534
3	NC_017733	GAAACC	2	12	7614	7625	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386745535
4	NC_017733	AGCTTT	2	12	20235	20246	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386745545
5	NC_017733	GTTTGG	2	12	21115	21126	0 %	50 %	50 %	0 %	386745547
6	NC_017733	GAATGA	2	12	21907	21918	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386745547
7	NC_017733	GATAAA	2	12	22083	22094	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386745547
8	NC_017733	CAATTC	2	12	26825	26836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745551
9	NC_017733	GAGTCC	2	12	27784	27795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386745552
10	NC_017733	TATCAA	2	12	29995	30006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386745555
11	NC_017733	TCTTAT	2	12	30703	30714	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386745555
12	NC_017733	GCGTGG	2	12	32748	32759	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386745558
13	NC_017733	TTGGAT	2	12	32858	32869	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386745558
14	NC_017733	TAATGA	2	12	32893	32904	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386745558
15	NC_017733	TTGAAT	2	12	33944	33955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386745558
16	NC_017733	TAAGGA	2	12	34243	34254	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386745558
17	NC_017733	TAGGGG	2	12	35750	35761	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386745561
18	NC_017733	TTCTAC	2	12	37234	37245	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386745562
19	NC_017733	AAAGAA	2	12	37262	37273	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386745562
20	NC_017733	AAAGAA	2	12	38883	38894	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386745565
21	NC_017733	CAAAAT	2	12	41229	41240	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386745567
22	NC_017733	CGCAAA	2	12	45623	45634	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386745571
23	NC_017733	GCTTGA	2	12	48723	48734	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386745573
24	NC_017733	GGCTAG	2	12	49875	49886	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386745575
25	NC_017733	TGCCTA	2	12	51373	51384	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386745575
26	NC_017733	TAAAAA	2	12	53391	53402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386745576
27	NC_017733	ACTCCC	2	12	54324	54335	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386745577
28	NC_017733	CTAAAG	2	12	56433	56444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386745577
29	NC_017733	TTTTGT	2	12	61052	61063	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386745581
30	NC_017733	AAAGAG	2	12	61331	61342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745581
31	NC_017733	ACAGAA	2	12	63073	63084	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386745583
32	NC_017733	ACGCCC	2	12	72599	72610	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386745597
33	NC_017733	AAGGGC	2	12	75326	75337	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386745600
34	NC_017733	CGCTAA	2	12	75688	75699	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386745600
35	NC_017733	GGCATG	2	12	77888	77899	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386745602
36	NC_017733	AATATT	2	12	79797	79808	50 %	50 %	0 %	0 %	386745603
37	NC_017733	TTTTCT	2	12	80800	80811	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386745603
38	NC_017733	AAAAAT	2	12	90431	90442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386745612
39	NC_017733	ACAAGC	2	12	91634	91645	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386745613
40	NC_017733	GATTTT	2	12	93699	93710	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386745615
41	NC_017733	AAACTC	2	12	93816	93827	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386745615
42	NC_017733	TCAAAA	2	12	95104	95115	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386745616
43	NC_017733	GCGGTG	2	12	95798	95809	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386745617
44	NC_017733	TTAAGG	2	12	97342	97353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745618
45	NC_017733	CAATAT	2	12	99002	99013	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386745618
46	NC_017733	TGCATG	2	12	107422	107433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386745625
47	NC_017733	GGAGCG	2	12	109797	109808	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386745628
48	NC_017733	TTTTCT	2	12	111297	111308	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386745629
49	NC_017733	TGCAAG	2	12	111703	111714	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386745629
50	NC_017733	CGCTCG	2	12	116299	116310	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386745634
51	NC_017733	TAGGCA	2	12	118837	118848	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386745635
52	NC_017733	CTTCTA	2	12	121179	121190	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386745637
53	NC_017733	TGAATT	2	12	123267	123278	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386745638
54	NC_017733	TTTCAA	2	12	123426	123437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386745638
55	NC_017733	AGCAAA	2	12	126773	126784	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386745641
56	NC_017733	CTAAAG	2	12	127037	127048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386745641
57	NC_017733	ACGCTC	2	12	133274	133285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386745648
58	NC_017733	ATTCAA	2	12	137122	137133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386745652
59	NC_017733	TTGGCT	2	12	137330	137341	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386745652
60	NC_017733	TAGCGA	2	12	138178	138189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386745653
61	NC_017733	TTAGCG	2	12	141069	141080	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386745655
62	NC_017733	TATCGC	2	12	141281	141292	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386745655
63	NC_017733	TATCGC	2	12	142988	142999	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386745656
64	NC_017733	CCTAAA	2	12	145211	145222	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386745658
65	NC_017733	TTCTAT	2	12	146371	146382	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386745659
66	NC_017733	TTGTTT	2	12	149359	149370	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386745664
67	NC_017733	CTTGGG	2	12	150020	150031	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386745666
68	NC_017733	ATTGGA	2	12	151393	151404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745667
69	NC_017733	TTGGGT	2	12	154793	154804	0 %	50 %	50 %	0 %	386745671
70	NC_017733	GATTTT	2	12	155306	155317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386745672
71	NC_017733	GATGGC	2	12	158517	158528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386745676
72	NC_017733	CTTTCT	2	12	158769	158780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745676
73	NC_017733	CCGCTC	2	12	160675	160686	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386745678
74	NC_017733	AAAATG	2	12	162214	162225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386745679
75	NC_017733	GCTCTC	2	12	163097	163108	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386745680
76	NC_017733	TAGTGG	2	12	164868	164879	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386745683
77	NC_017733	ATCGTT	2	12	167550	167561	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386745685
78	NC_017733	AATTTC	2	12	167901	167912	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386745686
79	NC_017733	TAAAAT	2	12	169425	169436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745687
80	NC_017733	TTCTTT	2	12	170805	170816	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386745689
81	NC_017733	ATTTTG	2	12	171236	171247	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386745690
82	NC_017733	CGCTTT	2	12	171714	171725	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386745690
83	NC_017733	ACTTAT	2	12	171811	171822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386745690
84	NC_017733	GTTTAA	2	12	172495	172506	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386745691
85	NC_017733	CCGCTC	2	12	175524	175535	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386745694
86	NC_017733	AAAGCA	2	12	176720	176731	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386745695
87	NC_017733	GTGATA	2	12	176792	176803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745695
88	NC_017733	GAAAAA	2	12	179158	179169	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386745697
89	NC_017733	AGGCAT	2	12	179247	179258	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386745697
90	NC_017733	GCATTT	2	12	180960	180971	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386745699
91	NC_017733	GGTATT	2	12	185479	185490	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386745702
92	NC_017733	TCTAAA	2	12	185709	185720	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386745702
93	NC_017733	TGGGCA	2	12	186773	186784	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386745703
94	NC_017733	ATTTTC	2	12	189197	189208	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386745704
95	NC_017733	TGGGGC	2	12	196597	196608	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386745714
96	NC_017733	CTATGG	2	12	196986	196997	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386745714
97	NC_017733	AAATCC	2	12	198375	198386	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386745716
98	NC_017733	CTGTAT	2	12	200384	200395	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386745717
99	NC_017733	TTGTTT	2	12	200935	200946	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386745717
100	NC_017733	TCAATT	2	12	201123	201134	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386745717
101	NC_017733	CATAGC	2	12	210906	210917	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386745725
102	NC_017733	GTTTTG	2	12	211411	211422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745725
103	NC_017733	TAATTA	2	12	215914	215925	50 %	50 %	0 %	0 %	386745729
104	NC_017733	CCATTA	2	12	221675	221686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745734
105	NC_017733	AATGCC	2	12	223838	223849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386745737
106	NC_017733	AGGGCC	2	12	226474	226485	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386745738
107	NC_017733	TCAATA	2	12	228513	228524	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386745740
108	NC_017733	CACGCC	2	12	228993	229004	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386745740
109	NC_017733	GCTTTG	2	12	230237	230248	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386745741
110	NC_017733	GCTAGG	2	12	231613	231624	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386745742
111	NC_017733	TGGTGA	2	12	231875	231886	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386745743
112	NC_017733	TCTTTA	2	12	238239	238250	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386745749
113	NC_017733	GTTTTT	2	12	243875	243886	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386745756
114	NC_017733	TCCCGC	2	12	249208	249219	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386745761
115	NC_017733	TTTAGC	2	12	253234	253245	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386745765
116	NC_017733	AGCGCT	2	12	255181	255192	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386745766
117	NC_017733	ATGGAA	2	12	264046	264057	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386745775
118	NC_017733	GATTTT	2	12	264762	264773	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386745775
119	NC_017733	TGAGCG	2	12	268021	268032	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386745778
120	NC_017733	ATTAGA	2	12	272828	272839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386745785
121	NC_017733	TAAAGA	2	12	274144	274155	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386745786
122	NC_017733	AAATCA	2	12	275609	275620	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386745789
123	NC_017733	ATCAAA	2	12	288208	288219	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386745800
124	NC_017733	TTTTAA	2	12	289088	289099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745800
125	NC_017733	ACTTTT	2	12	289194	289205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386745800
126	NC_017733	TCACTC	2	12	289531	289542	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386745800
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129	NC_017733	TAACAT	2	12	294626	294637	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386745800
130	NC_017733	CAACTA	2	12	294748	294759	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386745800
131	NC_017733	ACGCCA	2	12	295227	295238	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386745800
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133	NC_017733	TTATCG	2	12	304060	304071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386745806
134	NC_017733	GGCATG	2	12	306201	306212	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386745809
135	NC_017733	GTGAAT	2	12	307326	307337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745809
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138	NC_017733	TTTGCG	2	12	312252	312263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386745815
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140	NC_017733	GTTTTG	2	12	317606	317617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745821
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456	NC_017733	ACGCTC	2	12	1000605	1000616	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386746445
457	NC_017733	ATCTAT	2	12	1011663	1011674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386746452
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461	NC_017733	CATTGA	2	12	1037454	1037465	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386746472
462	NC_017733	GATAAA	2	12	1037650	1037661	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386746472
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