MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori HUP-B14 chromosome

Total Repeats: 1080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017733	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386745529
2	NC_017733	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	386745530
3	NC_017733	GTCGT	2	10	6622	6631	0 %	40 %	40 %	20 %	386745534
4	NC_017733	TTTCT	2	10	8278	8287	0 %	80 %	0 %	20 %	386745535
5	NC_017733	AATTT	2	10	9117	9126	40 %	60 %	0 %	0 %	386745535
6	NC_017733	AAAGG	2	10	10750	10759	60 %	0 %	40 %	0 %	386745537
7	NC_017733	TGCCA	2	10	11750	11759	20 %	20 %	20 %	40 %	386745538
8	NC_017733	TTGAA	2	10	11790	11799	40 %	40 %	20 %	0 %	386745538
9	NC_017733	TTTTG	2	10	11806	11815	0 %	80 %	20 %	0 %	386745538
10	NC_017733	TGGTG	2	10	12642	12651	0 %	40 %	60 %	0 %	386745539
11	NC_017733	CAAAA	2	10	18499	18508	80 %	0 %	0 %	20 %	386745544
12	NC_017733	TGAAA	2	10	20830	20839	60 %	20 %	20 %	0 %	386745546
13	NC_017733	CCATG	2	10	23349	23358	20 %	20 %	20 %	40 %	386745549
14	NC_017733	TTGAT	2	10	24865	24874	20 %	60 %	20 %	0 %	386745549
15	NC_017733	CAAGC	2	10	28039	28048	40 %	0 %	20 %	40 %	386745552
16	NC_017733	GCTGG	2	10	28412	28421	0 %	20 %	60 %	20 %	386745552
17	NC_017733	TTTTA	2	10	28964	28973	20 %	80 %	0 %	0 %	386745553
18	NC_017733	TCAAA	2	10	30787	30796	60 %	20 %	0 %	20 %	386745555
19	NC_017733	TTTTC	2	10	30957	30966	0 %	80 %	0 %	20 %	386745555
20	NC_017733	TGATT	2	10	31997	32006	20 %	60 %	20 %	0 %	386745556
21	NC_017733	GTGGG	2	10	33906	33915	0 %	20 %	80 %	0 %	386745558
22	NC_017733	TGGGG	2	10	35161	35170	0 %	20 %	80 %	0 %	386745560
23	NC_017733	AGCCT	2	10	39371	39380	20 %	20 %	20 %	40 %	386745566
24	NC_017733	CAAAC	2	10	41610	41619	60 %	0 %	0 %	40 %	386745567
25	NC_017733	TTACT	2	10	43148	43157	20 %	60 %	0 %	20 %	386745569
26	NC_017733	TAAAA	2	10	45558	45567	80 %	20 %	0 %	0 %	386745571
27	NC_017733	GCTCC	2	10	46900	46909	0 %	20 %	20 %	60 %	386745572
28	NC_017733	AAAAT	2	10	47079	47088	80 %	20 %	0 %	0 %	386745572
29	NC_017733	TCGCA	2	10	47437	47446	20 %	20 %	20 %	40 %	386745572
30	NC_017733	CAATA	2	10	49005	49014	60 %	20 %	0 %	20 %	386745573
31	NC_017733	AGGCT	2	10	49317	49326	20 %	20 %	40 %	20 %	386745574
32	NC_017733	TAAAA	2	10	51543	51552	80 %	20 %	0 %	0 %	386745575
33	NC_017733	GATTG	2	10	51587	51596	20 %	40 %	40 %	0 %	386745575
34	NC_017733	TTTGA	2	10	51714	51723	20 %	60 %	20 %	0 %	386745575
35	NC_017733	TGAAA	2	10	52310	52319	60 %	20 %	20 %	0 %	386745576
36	NC_017733	TCAAA	2	10	52564	52573	60 %	20 %	0 %	20 %	386745576
37	NC_017733	CAGCA	2	10	53511	53520	40 %	0 %	20 %	40 %	386745577
38	NC_017733	TCAAA	2	10	56319	56328	60 %	20 %	0 %	20 %	386745577
39	NC_017733	ATCGC	2	10	58274	58283	20 %	20 %	20 %	40 %	386745580
40	NC_017733	TGCGT	2	10	62782	62791	0 %	40 %	40 %	20 %	386745583
41	NC_017733	GGTGG	2	10	64748	64757	0 %	20 %	80 %	0 %	386745586
42	NC_017733	TTTCT	2	10	68466	68475	0 %	80 %	0 %	20 %	386745591
43	NC_017733	CTTGG	2	10	68729	68738	0 %	40 %	40 %	20 %	386745591
44	NC_017733	CTTCT	2	10	68783	68792	0 %	60 %	0 %	40 %	386745591
45	NC_017733	TCCAA	2	10	69272	69281	40 %	20 %	0 %	40 %	386745592
46	NC_017733	TTTTG	2	10	72555	72564	0 %	80 %	20 %	0 %	386745597
47	NC_017733	ATGGC	2	10	72749	72758	20 %	20 %	40 %	20 %	386745597
48	NC_017733	ACGCC	2	10	72861	72870	20 %	0 %	20 %	60 %	386745597
49	NC_017733	AAAGC	2	10	73627	73636	60 %	0 %	20 %	20 %	386745598
50	NC_017733	ATCTT	2	10	80953	80962	20 %	60 %	0 %	20 %	386745603
51	NC_017733	TGGCT	2	10	81494	81503	0 %	40 %	40 %	20 %	386745603
52	NC_017733	ATTTC	2	10	81611	81620	20 %	60 %	0 %	20 %	386745603
53	NC_017733	ATGCC	2	10	81940	81949	20 %	20 %	20 %	40 %	386745604
54	NC_017733	TTGAT	2	10	83027	83036	20 %	60 %	20 %	0 %	386745606
55	NC_017733	TGATT	2	10	91281	91290	20 %	60 %	20 %	0 %	386745613
56	NC_017733	GAATT	2	10	99384	99393	40 %	40 %	20 %	0 %	386745619
57	NC_017733	TCGTT	2	10	101188	101197	0 %	60 %	20 %	20 %	386745620
58	NC_017733	TCTTT	2	10	104500	104509	0 %	80 %	0 %	20 %	386745623
59	NC_017733	TAGGC	2	10	106091	106100	20 %	20 %	40 %	20 %	386745624
60	NC_017733	AAAGC	2	10	107269	107278	60 %	0 %	20 %	20 %	386745625
61	NC_017733	AATGG	2	10	108291	108300	40 %	20 %	40 %	0 %	386745626
62	NC_017733	GAATG	2	10	108501	108510	40 %	20 %	40 %	0 %	386745627
63	NC_017733	CAAAT	2	10	109817	109826	60 %	20 %	0 %	20 %	386745628
64	NC_017733	ACCCT	2	10	111246	111255	20 %	20 %	0 %	60 %	386745629
65	NC_017733	ATGCC	2	10	111378	111387	20 %	20 %	20 %	40 %	386745629
66	NC_017733	TGATT	2	10	113373	113382	20 %	60 %	20 %	0 %	386745631
67	NC_017733	AGCAG	2	10	113573	113582	40 %	0 %	40 %	20 %	386745632
68	NC_017733	AGCAA	2	10	113590	113599	60 %	0 %	20 %	20 %	386745632
69	NC_017733	CTAAA	2	10	113843	113852	60 %	20 %	0 %	20 %	386745633
70	NC_017733	GAATT	2	10	113992	114001	40 %	40 %	20 %	0 %	386745633
71	NC_017733	CAAAG	2	10	114753	114762	60 %	0 %	20 %	20 %	386745633
72	NC_017733	TCTGA	2	10	115853	115862	20 %	40 %	20 %	20 %	386745634
73	NC_017733	GATCG	2	10	117867	117876	20 %	20 %	40 %	20 %	386745635
74	NC_017733	AAGCC	2	10	119774	119783	40 %	0 %	20 %	40 %	386745636
75	NC_017733	TTGAT	2	10	121508	121517	20 %	60 %	20 %	0 %	386745637
76	NC_017733	TTTGA	2	10	122752	122761	20 %	60 %	20 %	0 %	386745638
77	NC_017733	ATCTC	2	10	124037	124046	20 %	40 %	0 %	40 %	386745638
78	NC_017733	TTTGT	2	10	124552	124561	0 %	80 %	20 %	0 %	386745639
79	NC_017733	TGCGT	2	10	126584	126593	0 %	40 %	40 %	20 %	386745641
80	NC_017733	GAAAA	2	10	126745	126754	80 %	0 %	20 %	0 %	386745641
81	NC_017733	GAAAA	2	10	127063	127072	80 %	0 %	20 %	0 %	386745641
82	NC_017733	ATTTT	2	10	129304	129313	20 %	80 %	0 %	0 %	386745645
83	NC_017733	ATTTT	2	10	130171	130180	20 %	80 %	0 %	0 %	386745646
84	NC_017733	ATGTT	2	10	130253	130262	20 %	60 %	20 %	0 %	386745646
85	NC_017733	AAAAG	2	10	130665	130674	80 %	0 %	20 %	0 %	386745646
86	NC_017733	AAATC	2	10	132703	132712	60 %	20 %	0 %	20 %	386745647
87	NC_017733	AAAAT	2	10	134175	134184	80 %	20 %	0 %	0 %	386745648
88	NC_017733	TTTTC	2	10	136542	136551	0 %	80 %	0 %	20 %	386745651
89	NC_017733	TTCTT	2	10	138498	138507	0 %	80 %	0 %	20 %	386745653
90	NC_017733	TCTTT	2	10	138992	139001	0 %	80 %	0 %	20 %	386745654
91	NC_017733	ACTTG	2	10	139205	139214	20 %	40 %	20 %	20 %	386745654
92	NC_017733	TTTTG	2	10	140154	140163	0 %	80 %	20 %	0 %	386745655
93	NC_017733	GCGAT	2	10	140947	140956	20 %	20 %	40 %	20 %	386745655
94	NC_017733	GCTTG	2	10	141203	141212	0 %	40 %	40 %	20 %	386745655
95	NC_017733	GTCCA	2	10	141807	141816	20 %	20 %	20 %	40 %	386745656
96	NC_017733	TTTTG	2	10	141855	141864	0 %	80 %	20 %	0 %	386745656
97	NC_017733	CCAAA	2	10	143694	143703	60 %	0 %	0 %	40 %	386745657
98	NC_017733	ACGCC	2	10	147216	147225	20 %	0 %	20 %	60 %	386745659
99	NC_017733	TTATT	2	10	149112	149121	20 %	80 %	0 %	0 %	386745663
100	NC_017733	GCGTT	2	10	149470	149479	0 %	40 %	40 %	20 %	386745665
101	NC_017733	ATTTG	2	10	150445	150454	20 %	60 %	20 %	0 %	386745666
102	NC_017733	GGATT	2	10	152504	152513	20 %	40 %	40 %	0 %	386745669
103	NC_017733	AAAAC	2	10	153064	153073	80 %	0 %	0 %	20 %	386745669
104	NC_017733	GGGGA	2	10	153164	153173	20 %	0 %	80 %	0 %	386745669
105	NC_017733	AGATT	2	10	154962	154971	40 %	40 %	20 %	0 %	386745671
106	NC_017733	GTTTT	2	10	158052	158061	0 %	80 %	20 %	0 %	386745675
107	NC_017733	ATTTT	2	10	158337	158346	20 %	80 %	0 %	0 %	386745676
108	NC_017733	ATTCA	2	10	159983	159992	40 %	40 %	0 %	20 %	386745677
109	NC_017733	CACTT	2	10	160187	160196	20 %	40 %	0 %	40 %	386745677
110	NC_017733	CCCAA	2	10	161821	161830	40 %	0 %	0 %	60 %	386745679
111	NC_017733	ATCTT	2	10	163380	163389	20 %	60 %	0 %	20 %	386745680
112	NC_017733	AATAT	2	10	170757	170766	60 %	40 %	0 %	0 %	386745689
113	NC_017733	GCACT	2	10	171296	171305	20 %	20 %	20 %	40 %	386745690
114	NC_017733	ATTTG	2	10	172777	172786	20 %	60 %	20 %	0 %	386745691
115	NC_017733	AATTG	2	10	172933	172942	40 %	40 %	20 %	0 %	386745692
116	NC_017733	AAATC	2	10	173016	173025	60 %	20 %	0 %	20 %	386745692
117	NC_017733	GGTGA	2	10	173402	173411	20 %	20 %	60 %	0 %	386745692
118	NC_017733	AAATG	2	10	174310	174319	60 %	20 %	20 %	0 %	386745693
119	NC_017733	TGTAA	2	10	175100	175109	40 %	40 %	20 %	0 %	386745694
120	NC_017733	AGCTT	2	10	176138	176147	20 %	40 %	20 %	20 %	386745695
121	NC_017733	ATAAA	2	10	176596	176605	80 %	20 %	0 %	0 %	386745695
122	NC_017733	AAAAG	2	10	177746	177755	80 %	0 %	20 %	0 %	386745696
123	NC_017733	ACCCC	2	10	177820	177829	20 %	0 %	0 %	80 %	386745696
124	NC_017733	TTCAA	2	10	185277	185286	40 %	40 %	0 %	20 %	386745702
125	NC_017733	GAGAG	2	10	190467	190476	40 %	0 %	60 %	0 %	386745706
126	NC_017733	TCATT	2	10	190882	190891	20 %	60 %	0 %	20 %	386745706
127	NC_017733	CATAA	2	10	191442	191451	60 %	20 %	0 %	20 %	386745707
128	NC_017733	CTATT	2	10	191771	191780	20 %	60 %	0 %	20 %	386745708
129	NC_017733	TTTTC	2	10	192830	192839	0 %	80 %	0 %	20 %	386745709
130	NC_017733	ATTAG	2	10	194809	194818	40 %	40 %	20 %	0 %	386745711
131	NC_017733	TATTT	2	10	196582	196591	20 %	80 %	0 %	0 %	386745714
132	NC_017733	TTTCA	2	10	197239	197248	20 %	60 %	0 %	20 %	386745715
133	NC_017733	TTGAT	2	10	199082	199091	20 %	60 %	20 %	0 %	386745717
134	NC_017733	TGAAT	2	10	200407	200416	40 %	40 %	20 %	0 %	386745717
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