MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori HUP-B14 chromosome

Total Repeats: 4524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017733	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	386745527
2	NC_017733	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	386745527
3	NC_017733	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386745528
4	NC_017733	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386745529
5	NC_017733	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	386745530
6	NC_017733	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	386745530
7	NC_017733	TTAT	2	8	1856	1863	25 %	75 %	0 %	0 %	386745530
8	NC_017733	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	386745530
9	NC_017733	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	386745530
10	NC_017733	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	386745531
11	NC_017733	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	386745532
12	NC_017733	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	386745532
13	NC_017733	AGAA	2	8	3779	3786	75 %	0 %	25 %	0 %	386745532
14	NC_017733	ATAG	2	8	3834	3841	50 %	25 %	25 %	0 %	386745532
15	NC_017733	TAAA	2	8	4694	4701	75 %	25 %	0 %	0 %	386745533
16	NC_017733	ACTA	2	8	5050	5057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017733	TCGC	2	8	5326	5333	0 %	25 %	25 %	50 %	386745534
18	NC_017733	ATTC	2	8	5355	5362	25 %	50 %	0 %	25 %	386745534
19	NC_017733	CATT	2	8	5399	5406	25 %	50 %	0 %	25 %	386745534
20	NC_017733	CTGG	2	8	6776	6783	0 %	25 %	50 %	25 %	386745534
21	NC_017733	ATCG	2	8	6951	6958	25 %	25 %	25 %	25 %	386745534
22	NC_017733	CGTT	2	8	6986	6993	0 %	50 %	25 %	25 %	386745534
23	NC_017733	GTTT	2	8	7332	7339	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017733	TTCA	2	8	7742	7749	25 %	50 %	0 %	25 %	386745535
25	NC_017733	TCGC	2	8	7983	7990	0 %	25 %	25 %	50 %	386745535
26	NC_017733	TCTT	2	8	8036	8043	0 %	75 %	0 %	25 %	386745535
27	NC_017733	ATAA	2	8	9539	9546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017733	TATT	2	8	9738	9745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017733	AAAG	2	8	9789	9796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017733	GATA	2	8	9842	9849	50 %	25 %	25 %	0 %	386745537
31	NC_017733	TCAA	2	8	9949	9956	50 %	25 %	0 %	25 %	386745537
32	NC_017733	TTTG	2	8	10769	10776	0 %	75 %	25 %	0 %	386745537
33	NC_017733	CTTT	2	8	11397	11404	0 %	75 %	0 %	25 %	386745537
34	NC_017733	TGCT	2	8	12140	12147	0 %	50 %	25 %	25 %	386745538
35	NC_017733	GCCG	2	8	12404	12411	0 %	0 %	50 %	50 %	386745538
36	NC_017733	TGCA	2	8	12619	12626	25 %	25 %	25 %	25 %	386745539
37	NC_017733	AGCA	2	8	12674	12681	50 %	0 %	25 %	25 %	386745539
38	NC_017733	GTTT	2	8	13032	13039	0 %	75 %	25 %	0 %	386745539
39	NC_017733	TCTT	2	8	13419	13426	0 %	75 %	0 %	25 %	386745539
40	NC_017733	TTAA	2	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017733	AGCG	2	8	13889	13896	25 %	0 %	50 %	25 %	386745541
42	NC_017733	GATT	2	8	13997	14004	25 %	50 %	25 %	0 %	386745541
43	NC_017733	GCAC	2	8	14534	14541	25 %	0 %	25 %	50 %	386745542
44	NC_017733	ATGC	2	8	14581	14588	25 %	25 %	25 %	25 %	386745542
45	NC_017733	TTTA	2	8	15168	15175	25 %	75 %	0 %	0 %	386745542
46	NC_017733	CAGG	2	8	16326	16333	25 %	0 %	50 %	25 %	386745542
47	NC_017733	TGAT	2	8	16370	16377	25 %	50 %	25 %	0 %	386745542
48	NC_017733	AGTT	2	8	16498	16505	25 %	50 %	25 %	0 %	386745542
49	NC_017733	GCTT	2	8	17342	17349	0 %	50 %	25 %	25 %	386745543
50	NC_017733	ATCT	2	8	17899	17906	25 %	50 %	0 %	25 %	386745543
51	NC_017733	GTTT	2	8	18117	18124	0 %	75 %	25 %	0 %	386745543
52	NC_017733	TTGA	2	8	18463	18470	25 %	50 %	25 %	0 %	386745544
53	NC_017733	AGCG	2	8	19011	19018	25 %	0 %	50 %	25 %	386745544
54	NC_017733	TAAA	2	8	20504	20511	75 %	25 %	0 %	0 %	386745546
55	NC_017733	GCGA	2	8	20513	20520	25 %	0 %	50 %	25 %	386745546
56	NC_017733	TGAT	2	8	20670	20677	25 %	50 %	25 %	0 %	386745546
57	NC_017733	AGGC	2	8	20945	20952	25 %	0 %	50 %	25 %	386745546
58	NC_017733	CTTT	2	8	21370	21377	0 %	75 %	0 %	25 %	386745547
59	NC_017733	AAGT	2	8	21682	21689	50 %	25 %	25 %	0 %	386745547
60	NC_017733	AACT	2	8	22433	22440	50 %	25 %	0 %	25 %	386745547
61	NC_017733	CTTT	2	8	22447	22454	0 %	75 %	0 %	25 %	386745547
62	NC_017733	ATCA	2	8	22586	22593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017733	CTTG	2	8	22981	22988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017733	GTTT	2	8	23706	23713	0 %	75 %	25 %	0 %	386745549
65	NC_017733	TCAT	2	8	27900	27907	25 %	50 %	0 %	25 %	386745552
66	NC_017733	GATG	2	8	28564	28571	25 %	25 %	50 %	0 %	386745552
67	NC_017733	GAAT	2	8	28821	28828	50 %	25 %	25 %	0 %	386745553
68	NC_017733	TGGC	2	8	29044	29051	0 %	25 %	50 %	25 %	386745553
69	NC_017733	GCGT	2	8	29178	29185	0 %	25 %	50 %	25 %	386745553
70	NC_017733	TCTG	2	8	29186	29193	0 %	50 %	25 %	25 %	386745553
71	NC_017733	TTTA	2	8	29197	29204	25 %	75 %	0 %	0 %	386745553
72	NC_017733	TGGT	2	8	29715	29722	0 %	50 %	50 %	0 %	386745554
73	NC_017733	GAGT	2	8	30029	30036	25 %	25 %	50 %	0 %	386745555
74	NC_017733	TCAA	2	8	30051	30058	50 %	25 %	0 %	25 %	386745555
75	NC_017733	TGCT	2	8	30083	30090	0 %	50 %	25 %	25 %	386745555
76	NC_017733	AGCA	2	8	30194	30201	50 %	0 %	25 %	25 %	386745555
77	NC_017733	CAAT	2	8	30208	30215	50 %	25 %	0 %	25 %	386745555
78	NC_017733	GGTT	2	8	31723	31730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017733	TTTA	2	8	31857	31864	25 %	75 %	0 %	0 %	386745556
80	NC_017733	CAGA	2	8	31893	31900	50 %	0 %	25 %	25 %	386745556
81	NC_017733	ATTG	2	8	32045	32052	25 %	50 %	25 %	0 %	386745556
82	NC_017733	GCGA	2	8	32055	32062	25 %	0 %	50 %	25 %	386745556
83	NC_017733	ACCC	2	8	32195	32202	25 %	0 %	0 %	75 %	386745557
84	NC_017733	CATC	2	8	32321	32328	25 %	25 %	0 %	50 %	386745557
85	NC_017733	TCAA	2	8	32463	32470	50 %	25 %	0 %	25 %	386745558
86	NC_017733	CATG	2	8	33586	33593	25 %	25 %	25 %	25 %	386745558
87	NC_017733	CGCT	2	8	33702	33709	0 %	25 %	25 %	50 %	386745558
88	NC_017733	GCTT	2	8	34601	34608	0 %	50 %	25 %	25 %	386745558
89	NC_017733	GAAA	2	8	34660	34667	75 %	0 %	25 %	0 %	386745558
90	NC_017733	ATGA	2	8	34941	34948	50 %	25 %	25 %	0 %	386745559
91	NC_017733	TTCT	2	8	36354	36361	0 %	75 %	0 %	25 %	386745562
92	NC_017733	CTTT	2	8	36683	36690	0 %	75 %	0 %	25 %	386745562
93	NC_017733	AATA	2	8	37360	37367	75 %	25 %	0 %	0 %	386745562
94	NC_017733	TAAA	2	8	37382	37389	75 %	25 %	0 %	0 %	386745562
95	NC_017733	TGAT	2	8	38247	38254	25 %	50 %	25 %	0 %	386745564
96	NC_017733	CGAA	2	8	38332	38339	50 %	0 %	25 %	25 %	386745565
97	NC_017733	TGAT	2	8	38632	38639	25 %	50 %	25 %	0 %	386745565
98	NC_017733	CAAA	2	8	39657	39664	75 %	0 %	0 %	25 %	386745566
99	NC_017733	ATTG	2	8	40071	40078	25 %	50 %	25 %	0 %	386745566
100	NC_017733	ATCA	2	8	40246	40253	50 %	25 %	0 %	25 %	386745566
101	NC_017733	TCAA	2	8	40259	40266	50 %	25 %	0 %	25 %	386745566
102	NC_017733	TGTT	2	8	41033	41040	0 %	75 %	25 %	0 %	386745567
103	NC_017733	CTTT	2	8	41626	41633	0 %	75 %	0 %	25 %	386745567
104	NC_017733	GATC	2	8	42056	42063	25 %	25 %	25 %	25 %	386745568
105	NC_017733	ATGA	2	8	43063	43070	50 %	25 %	25 %	0 %	386745568
106	NC_017733	TATT	2	8	43180	43187	25 %	75 %	0 %	0 %	386745569
107	NC_017733	AACG	2	8	43455	43462	50 %	0 %	25 %	25 %	386745569
108	NC_017733	CAAA	2	8	43902	43909	75 %	0 %	0 %	25 %	386745569
109	NC_017733	CTGT	2	8	44341	44348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017733	TGAT	2	8	44525	44532	25 %	50 %	25 %	0 %	386745570
111	NC_017733	TTGA	2	8	45015	45022	25 %	50 %	25 %	0 %	386745571
112	NC_017733	AAAC	2	8	45029	45036	75 %	0 %	0 %	25 %	386745571
113	NC_017733	CGCT	2	8	45170	45177	0 %	25 %	25 %	50 %	386745571
114	NC_017733	GTTT	2	8	45792	45799	0 %	75 %	25 %	0 %	386745571
115	NC_017733	CAAA	2	8	46297	46304	75 %	0 %	0 %	25 %	386745572
116	NC_017733	TCGC	2	8	47112	47119	0 %	25 %	25 %	50 %	386745572
117	NC_017733	AGGG	2	8	47123	47130	25 %	0 %	75 %	0 %	386745572
118	NC_017733	GCAA	2	8	47776	47783	50 %	0 %	25 %	25 %	386745572
119	NC_017733	TAAA	2	8	48045	48052	75 %	25 %	0 %	0 %	386745572
120	NC_017733	CGAG	2	8	48470	48477	25 %	0 %	50 %	25 %	386745573
121	NC_017733	CTTT	2	8	49434	49441	0 %	75 %	0 %	25 %	386745574
122	NC_017733	GATT	2	8	49620	49627	25 %	50 %	25 %	0 %	386745574
123	NC_017733	TTGC	2	8	49911	49918	0 %	50 %	25 %	25 %	386745575
124	NC_017733	AGGC	2	8	50130	50137	25 %	0 %	50 %	25 %	386745575
125	NC_017733	TGGT	2	8	50194	50201	0 %	50 %	50 %	0 %	386745575
126	NC_017733	CTTT	2	8	50488	50495	0 %	75 %	0 %	25 %	386745575
127	NC_017733	ATAA	2	8	51111	51118	75 %	25 %	0 %	0 %	386745575
128	NC_017733	AAAT	2	8	51196	51203	75 %	25 %	0 %	0 %	386745575
129	NC_017733	AAAC	2	8	52058	52065	75 %	0 %	0 %	25 %	386745576
130	NC_017733	AGCC	2	8	52258	52265	25 %	0 %	25 %	50 %	386745576
131	NC_017733	CAAG	2	8	52737	52744	50 %	0 %	25 %	25 %	386745576
132	NC_017733	AAGA	2	8	52779	52786	75 %	0 %	25 %	0 %	386745576
133	NC_017733	CACT	2	8	53026	53033	25 %	25 %	0 %	50 %	386745576
134	NC_017733	ATTT	2	8	53501	53508	25 %	75 %	0 %	0 %	386745577
135	NC_017733	GTTC	3	12	53830	53841	0 %	50 %	25 %	25 %	386745577
136	NC_017733	TCTG	2	8	54796	54803	0 %	50 %	25 %	25 %	386745577
137	NC_017733	GTTT	2	8	55664	55671	0 %	75 %	25 %	0 %	386745577
138	NC_017733	AAAG	2	8	55786	55793	75 %	0 %	25 %	0 %	386745577
139	NC_017733	TTGT	2	8	56122	56129	0 %	75 %	25 %	0 %	386745577
140	NC_017733	CTTT	2	8	56240	56247	0 %	75 %	0 %	25 %	386745577
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