MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori HUP-B14 chromosome

Total Repeats: 617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017733	ACTA	2	8	5050	5057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017733	GTTT	2	8	7332	7339	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017733	ATAA	2	8	9539	9546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017733	TATT	2	8	9738	9745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017733	AAAG	2	8	9789	9796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017733	TTAA	2	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017733	ATCA	2	8	22586	22593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017733	CTTG	2	8	22981	22988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017733	GGTT	2	8	31723	31730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017733	CTGT	2	8	44341	44348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017733	TTTA	2	8	57071	57078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017733	AAAT	2	8	57283	57290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017733	CTTT	2	8	57918	57925	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017733	AAAG	2	8	58061	58068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017733	AAAG	2	8	58904	58911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017733	GAGC	3	12	59598	59609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017733	TTTA	2	8	79129	79136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017733	AACT	2	8	79195	79202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017733	CCAA	2	8	79227	79234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017733	TTAG	2	8	79401	79408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017733	CGTT	2	8	79518	79525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017733	ATTT	2	8	82893	82900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017733	TCAA	2	8	88028	88035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017733	GGTG	2	8	90048	90055	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017733	TCCC	2	8	90118	90125	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_017733	AAAG	2	8	92456	92463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017733	TTCA	2	8	95437	95444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017733	TGAT	2	8	97075	97082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017733	ATCA	2	8	103699	103706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017733	AATA	2	8	103881	103888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017733	AAGC	2	8	109259	109266	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017733	CCGC	2	8	109282	109289	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_017733	CTTT	2	8	111184	111191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017733	AAAT	2	8	111195	111202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017733	ATTT	2	8	112726	112733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017733	AATT	2	8	112762	112769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017733	TCAT	2	8	117400	117407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017733	TTAG	2	8	124494	124501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017733	AAAG	2	8	124673	124680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017733	AAAG	2	8	127400	127407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017733	AAAG	2	8	127895	127902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017733	GAAG	2	8	127952	127959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017733	CTTT	2	8	128893	128900	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017733	CTAT	2	8	129887	129894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017733	GTTT	2	8	130124	130131	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017733	ACTT	2	8	131032	131039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017733	CTTT	2	8	131054	131061	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017733	AAAC	2	8	131504	131511	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017733	ATTT	2	8	131606	131613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017733	ATTT	2	8	134385	134392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017733	TAAG	2	8	139748	139755	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017733	CCCT	2	8	159492	159499	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_017733	TCAT	2	8	159641	159648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017733	GAAT	2	8	170908	170915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017733	GATT	2	8	173653	173660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017733	AAAC	2	8	173961	173968	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017733	GATT	2	8	176977	176984	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017733	GTTT	2	8	177075	177082	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017733	CATT	2	8	182196	182203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017733	TCTT	2	8	182627	182634	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017733	TTGC	2	8	183674	183681	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017733	CTTG	2	8	183820	183827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017733	TTTG	2	8	183838	183845	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017733	TCGT	2	8	183880	183887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017733	TTCA	2	8	184104	184111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017733	TGCA	2	8	184124	184131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017733	ACGA	2	8	192791	192798	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017733	TAAG	2	8	194473	194480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017733	CAAC	2	8	197778	197785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017733	AAAC	2	8	197980	197987	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017733	GTTT	2	8	204071	204078	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017733	GTTT	2	8	208615	208622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017733	TTGA	2	8	208630	208637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017733	ATCC	2	8	215952	215959	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017733	GTTT	2	8	216091	216098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017733	CTTT	2	8	216285	216292	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017733	ATTG	2	8	216321	216328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017733	TTAT	2	8	217463	217470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017733	GAAA	2	8	227107	227114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017733	TTTA	2	8	230023	230030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017733	AGCG	2	8	234235	234242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017733	GGGT	2	8	234819	234826	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017733	GATT	2	8	234899	234906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017733	CTTC	2	8	235984	235991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017733	TCCC	2	8	237367	237374	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_017733	ATTT	2	8	242683	242690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017733	CTTT	2	8	245220	245227	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017733	TAAT	2	8	251203	251210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017733	GCCA	2	8	261045	261052	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017733	AAAT	2	8	278801	278808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017733	GTTT	2	8	313277	313284	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017733	TTGG	2	8	323596	323603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017733	AAAT	2	8	331910	331917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017733	TAAC	2	8	334002	334009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017733	TTTA	2	8	337065	337072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017733	TTGA	2	8	350349	350356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017733	AGAA	2	8	350497	350504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017733	TAAA	2	8	351863	351870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017733	TTAA	2	8	363449	363456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017733	TAAA	2	8	363460	363467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017733	TTAT	2	8	367968	367975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017733	TTTG	2	8	368034	368041	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017733	GTTT	2	8	380345	380352	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017733	GTTT	2	8	381167	381174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017733	TTTC	2	8	384645	384652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017733	GGGT	2	8	386535	386542	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017733	GAAA	2	8	386593	386600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017733	AACA	2	8	386606	386613	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017733	GTTT	2	8	391972	391979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017733	AGGG	2	8	399391	399398	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017733	CAAA	2	8	400637	400644	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017733	CCAA	2	8	400756	400763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017733	CAAC	2	8	400864	400871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017733	CTAG	2	8	401763	401770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017733	AAAT	2	8	401825	401832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017733	GCTA	2	8	401966	401973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017733	AATA	2	8	407577	407584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017733	TCAA	2	8	419071	419078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017733	CAAT	2	8	420451	420458	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017733	AAGC	2	8	420488	420495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017733	CAAT	2	8	421344	421351	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017733	ACCC	2	8	423784	423791	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_017733	TTTA	2	8	434255	434262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017733	CACC	2	8	434346	434353	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_017733	TGTT	2	8	434449	434456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017733	TTTA	2	8	447280	447287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017733	TAAA	2	8	448703	448710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017733	AAAC	2	8	448845	448852	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017733	CGAA	2	8	448927	448934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017733	AAAC	2	8	449639	449646	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017733	TATT	2	8	461874	461881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017733	GTTT	2	8	462007	462014	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017733	GCGT	2	8	462318	462325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017733	TAAA	2	8	462479	462486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017733	TGTT	2	8	462528	462535	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017733	TTTA	2	8	467031	467038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017733	AGCG	2	8	467163	467170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017733	ATCA	2	8	468233	468240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017733	AGTG	2	8	468627	468634	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017733	CAGT	2	8	468804	468811	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017733	TTAT	2	8	469680	469687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017733	TCTT	2	8	472786	472793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017733	CATT	2	8	474590	474597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017733	TTTA	2	8	477441	477448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017733	TAAA	2	8	493878	493885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017733	CAAA	2	8	494709	494716	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017733	ATTT	2	8	508396	508403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017733	CTGA	2	8	509290	509297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017733	GCTT	2	8	516998	517005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017733	ATTG	2	8	518657	518664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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