MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 31 chromosome

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017730	GAAATT	3	18	10440	10457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017730	GCGAAG	2	12	11534	11545	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017730	AGCTTC	2	12	21344	21355	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017730	TTGTCT	2	12	25471	25482	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017730	TATTGG	2	12	112131	112142	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017730	CTCACT	2	12	123228	123239	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017730	GATGGC	2	12	179541	179552	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017730	TGCTGG	2	12	179597	179608	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017730	TGGGGC	2	12	185800	185811	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017730	TCCTGA	2	12	191198	191209	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017730	TTTGCC	2	12	319304	319315	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017730	ACGGTA	2	12	320320	320331	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017730	TTCCTC	2	12	345309	345320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017730	GCTATA	2	12	376828	376839	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017730	ACGTTG	2	12	377356	377367	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017730	ACTGTA	2	12	385831	385842	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017730	TGAGTA	2	12	391643	391654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017730	CGCCCG	2	12	402452	402463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017730	GTGCCT	2	12	481343	481354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017730	GCGCAA	2	12	525324	525335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017730	TGCTCG	2	12	578171	578182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017730	CATCCT	2	12	579504	579515	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017730	ATAAGA	2	12	589962	589973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017730	GTTTTT	2	12	613895	613906	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017730	AGCGAA	2	12	614711	614722	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017730	TGCGCG	2	12	638875	638886	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017730	CTGAGC	2	12	643869	643880	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017730	ATGAAG	2	12	748996	749007	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017730	GGCTGC	2	12	763070	763081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017730	TGACGA	2	12	768697	768708	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017730	AATTTA	2	12	784964	784975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017730	ATCTTT	2	12	848376	848387	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017730	CCTTTT	2	12	927460	927471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017730	CCGTGC	2	12	933385	933396	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017730	GTGGTT	2	12	960196	960207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017730	GTAAAG	2	12	990687	990698	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017730	GTTTTT	2	12	1025260	1025271	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017730	AGCGAA	2	12	1026156	1026167	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017730	GTGTTT	2	12	1028568	1028579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017730	TCAACT	2	12	1071961	1071972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017730	GCGTCC	2	12	1089060	1089071	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017730	TGGGGG	2	12	1096879	1096890	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017730	TTTTAT	2	12	1123641	1123652	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017730	GATCGC	2	12	1125142	1125153	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017730	ATCTTC	2	12	1131153	1131164	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017730	AGAAAA	2	12	1137492	1137503	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017730	TCTTTT	2	12	1137513	1137524	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017730	GACTTT	2	12	1161220	1161231	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017730	AAAGCT	2	12	1167546	1167557	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017730	TTCCAC	2	12	1168660	1168671	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017730	ACTATT	2	12	1168676	1168687	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017730	TCACAA	2	12	1171217	1171228	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017730	AAGTGC	2	12	1191370	1191381	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017730	AAGCTC	2	12	1194313	1194324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017730	ACCAGT	2	12	1230927	1230938	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017730	CCAATA	2	12	1271278	1271289	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017730	GTAGAA	2	12	1271359	1271370	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017730	GCCTCG	2	12	1272041	1272052	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017730	GCTTCT	2	12	1273225	1273236	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017730	CAAGAA	2	12	1276085	1276096	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017730	CCCTAT	2	12	1278121	1278132	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017730	ATGGGC	2	12	1340476	1340487	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017730	ATGCAG	2	12	1401529	1401540	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017730	AATCTA	2	12	1403418	1403429	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017730	TATTTC	2	12	1417559	1417570	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017730	GACGGT	2	12	1436436	1436447	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017730	GTCTGT	2	12	1464156	1464167	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017730	AATTTC	2	12	1497575	1497586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017730	CTGTGC	2	12	1537944	1537955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017730	TTCTGC	2	12	1547270	1547281	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017730	CAGCGA	2	12	1571498	1571509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017730	TTGTGT	2	12	1606676	1606687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017730	GGCTTA	2	12	1696353	1696364	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017730	TTAGCG	2	12	1711117	1711128	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017730	ATTTTT	2	12	1719231	1719242	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017730	AGCTTT	2	12	1781287	1781298	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017730	TCATTT	2	12	1792485	1792496	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017730	ACCTTT	2	12	1799860	1799871	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017730	AGTGGT	2	12	1804701	1804712	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017730	CCTAAC	2	12	1808982	1808993	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017730	AAGTTC	2	12	1809481	1809492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017730	CAAAGG	2	12	1810419	1810430	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017730	TTCGCT	2	12	1821392	1821403	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017730	AAAAAC	2	12	1822242	1822253	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017730	GCATAG	2	12	1880936	1880947	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017730	TTCCAT	2	12	1904087	1904098	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017730	CATTAT	2	12	1941585	1941596	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017730	TCCTTG	2	12	1994295	1994306	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017730	TACCCC	2	12	2005058	2005069	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017730	ATGTTG	2	12	2026932	2026943	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017730	GATGAG	2	12	2027392	2027403	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017730	CAAGGA	2	12	2027481	2027492	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017730	TTCAAT	2	12	2032082	2032093	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017730	TTTCAT	2	12	2037712	2037723	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017730	CTTTAA	2	12	2047507	2047518	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017730	CTTTAG	2	12	2058428	2058439	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017730	CCCCCG	2	12	2085308	2085319	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
98	NC_017730	CATAGA	2	12	2149410	2149421	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017730	TTCGCT	2	12	2190473	2190484	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017730	AAAAAC	2	12	2191378	2191389	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017730	CACACC	2	12	2193347	2193358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017730	TTACCC	2	12	2198925	2198936	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017730	GAATAG	2	12	2199917	2199928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017730	TTTTCT	2	12	2286664	2286675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.