MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 31 chromosome

Total Repeats: 1287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017730	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	386739354
2	NC_017730	CACGC	2	10	5733	5742	20 %	0 %	20 %	60 %	386739358
3	NC_017730	GTGGA	2	10	5770	5779	20 %	20 %	60 %	0 %	386739358
4	NC_017730	TTATC	2	10	14079	14088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017730	CAGTA	2	10	14625	14634	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017730	CAGTG	2	10	15496	15505	20 %	20 %	40 %	20 %	386739367
7	NC_017730	AAAAT	2	10	16773	16782	80 %	20 %	0 %	0 %	386739369
8	NC_017730	TAGCG	2	10	18340	18349	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017730	CTTTT	2	10	19247	19256	0 %	80 %	0 %	20 %	386739372
10	NC_017730	GCTCT	2	10	19284	19293	0 %	40 %	20 %	40 %	386739372
11	NC_017730	CACAC	2	10	21446	21455	40 %	0 %	0 %	60 %	386739377
12	NC_017730	TTCGC	2	10	22211	22220	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017730	TGGAT	2	10	23664	23673	20 %	40 %	40 %	0 %	386739378
14	NC_017730	TGCGT	2	10	26658	26667	0 %	40 %	40 %	20 %	386739380
15	NC_017730	CTGAT	2	10	30686	30695	20 %	40 %	20 %	20 %	386739384
16	NC_017730	GGAGC	2	10	31638	31647	20 %	0 %	60 %	20 %	386739385
17	NC_017730	TTGCT	2	10	32725	32734	0 %	60 %	20 %	20 %	386739386
18	NC_017730	TGAGG	2	10	39557	39566	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017730	CACAT	2	10	41741	41750	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017730	TGCGG	2	10	42669	42678	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017730	GCCTC	2	10	48506	48515	0 %	20 %	20 %	60 %	386739403
22	NC_017730	GAAGG	2	10	48520	48529	40 %	0 %	60 %	0 %	386739403
23	NC_017730	CAGTG	2	10	50449	50458	20 %	20 %	40 %	20 %	386739405
24	NC_017730	TGAGA	2	10	50791	50800	40 %	20 %	40 %	0 %	386739405
25	NC_017730	AGTGA	2	10	50841	50850	40 %	20 %	40 %	0 %	386739405
26	NC_017730	TTGGA	2	10	53871	53880	20 %	40 %	40 %	0 %	386739411
27	NC_017730	TTGAT	2	10	53906	53915	20 %	60 %	20 %	0 %	386739411
28	NC_017730	TGCAC	2	10	54000	54009	20 %	20 %	20 %	40 %	386739412
29	NC_017730	CTGGC	2	10	54259	54268	0 %	20 %	40 %	40 %	386739413
30	NC_017730	GCAGC	2	10	54758	54767	20 %	0 %	40 %	40 %	386739413
31	NC_017730	GACTG	2	10	54774	54783	20 %	20 %	40 %	20 %	386739413
32	NC_017730	AAGGC	2	10	57015	57024	40 %	0 %	40 %	20 %	386739415
33	NC_017730	ATGGC	2	10	60539	60548	20 %	20 %	40 %	20 %	386739420
34	NC_017730	ATGTG	2	10	64709	64718	20 %	40 %	40 %	0 %	386739424
35	NC_017730	GCTGG	2	10	66870	66879	0 %	20 %	60 %	20 %	386739427
36	NC_017730	AGGGA	2	10	69481	69490	40 %	0 %	60 %	0 %	386739429
37	NC_017730	ATTTG	2	10	70056	70065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017730	AAGAT	2	10	71288	71297	60 %	20 %	20 %	0 %	386739431
39	NC_017730	GGAGC	2	10	71395	71404	20 %	0 %	60 %	20 %	386739431
40	NC_017730	GGTCT	2	10	73108	73117	0 %	40 %	40 %	20 %	386739433
41	NC_017730	AGGGG	2	10	73661	73670	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017730	CATGT	2	10	73684	73693	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017730	CAGCG	2	10	74560	74569	20 %	0 %	40 %	40 %	386739435
44	NC_017730	ACTGA	2	10	74737	74746	40 %	20 %	20 %	20 %	386739435
45	NC_017730	CAGGC	2	10	74966	74975	20 %	0 %	40 %	40 %	386739435
46	NC_017730	ATGGC	2	10	75811	75820	20 %	20 %	40 %	20 %	386739436
47	NC_017730	AGGCA	2	10	77131	77140	40 %	0 %	40 %	20 %	386739437
48	NC_017730	TAATT	2	10	78377	78386	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017730	CGGTC	2	10	79368	79377	0 %	20 %	40 %	40 %	386739440
50	NC_017730	GCTTT	2	10	82971	82980	0 %	60 %	20 %	20 %	386739444
51	NC_017730	TGACC	2	10	83227	83236	20 %	20 %	20 %	40 %	386739444
52	NC_017730	CGTTA	2	10	83968	83977	20 %	40 %	20 %	20 %	386739445
53	NC_017730	TGCTG	2	10	84602	84611	0 %	40 %	40 %	20 %	386739445
54	NC_017730	TGGCC	2	10	86593	86602	0 %	20 %	40 %	40 %	386739446
55	NC_017730	GCGAC	2	10	87397	87406	20 %	0 %	40 %	40 %	386739446
56	NC_017730	TGGGA	2	10	90810	90819	20 %	20 %	60 %	0 %	386739452
57	NC_017730	GATCG	2	10	91910	91919	20 %	20 %	40 %	20 %	386739454
58	NC_017730	CAAAA	2	10	92641	92650	80 %	0 %	0 %	20 %	386739455
59	NC_017730	AACAA	2	10	95480	95489	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017730	TGCAA	2	10	98536	98545	40 %	20 %	20 %	20 %	386739460
61	NC_017730	TGCAG	2	10	98756	98765	20 %	20 %	40 %	20 %	386739460
62	NC_017730	AGGTC	2	10	101192	101201	20 %	20 %	40 %	20 %	386739463
63	NC_017730	ACCAA	2	10	103051	103060	60 %	0 %	0 %	40 %	386739463
64	NC_017730	TGGAG	2	10	104143	104152	20 %	20 %	60 %	0 %	386739464
65	NC_017730	TCATC	2	10	104313	104322	20 %	40 %	0 %	40 %	386739464
66	NC_017730	TGCAC	2	10	106128	106137	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017730	CCTGG	2	10	106344	106353	0 %	20 %	40 %	40 %	386739465
68	NC_017730	CGGTG	2	10	106552	106561	0 %	20 %	60 %	20 %	386739465
69	NC_017730	CGGCG	2	10	109170	109179	0 %	0 %	60 %	40 %	386739468
70	NC_017730	CGCGG	2	10	109230	109239	0 %	0 %	60 %	40 %	386739469
71	NC_017730	CAGCG	2	10	109766	109775	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017730	GGATC	2	10	120492	120501	20 %	20 %	40 %	20 %	386739481
73	NC_017730	TGTTT	2	10	123078	123087	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017730	TCTGA	2	10	123363	123372	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017730	TTTGT	2	10	123408	123417	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017730	TCGGA	2	10	123965	123974	20 %	20 %	40 %	20 %	386739484
77	NC_017730	CCTTC	2	10	124023	124032	0 %	40 %	0 %	60 %	386739484
78	NC_017730	ATGCA	2	10	124987	124996	40 %	20 %	20 %	20 %	386739484
79	NC_017730	GTAAC	2	10	125009	125018	40 %	20 %	20 %	20 %	386739484
80	NC_017730	CGGGA	2	10	129717	129726	20 %	0 %	60 %	20 %	386739487
81	NC_017730	GACTG	2	10	131968	131977	20 %	20 %	40 %	20 %	386739490
82	NC_017730	GGATG	2	10	134255	134264	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017730	GTGGC	2	10	137271	137280	0 %	20 %	60 %	20 %	386739493
84	NC_017730	GGGGC	2	10	137716	137725	0 %	0 %	80 %	20 %	386739494
85	NC_017730	AGACG	2	10	139520	139529	40 %	0 %	40 %	20 %	386739496
86	NC_017730	ACGGT	2	10	140903	140912	20 %	20 %	40 %	20 %	386739498
87	NC_017730	CGATC	2	10	141176	141185	20 %	20 %	20 %	40 %	386739498
88	NC_017730	TGGCC	2	10	141383	141392	0 %	20 %	40 %	40 %	386739498
89	NC_017730	TGGTG	2	10	141761	141770	0 %	40 %	60 %	0 %	386739498
90	NC_017730	GGAGT	2	10	142233	142242	20 %	20 %	60 %	0 %	386739498
91	NC_017730	ATTGC	2	10	146167	146176	20 %	40 %	20 %	20 %	386739502
92	NC_017730	AAAAC	2	10	148993	149002	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017730	TCACT	2	10	150034	150043	20 %	40 %	0 %	40 %	386739507
94	NC_017730	ATTTC	2	10	150651	150660	20 %	60 %	0 %	20 %	386739507
95	NC_017730	AATGG	2	10	154350	154359	40 %	20 %	40 %	0 %	386739510
96	NC_017730	GTGAG	2	10	155333	155342	20 %	20 %	60 %	0 %	386739512
97	NC_017730	CTGAA	2	10	156131	156140	40 %	20 %	20 %	20 %	386739512
98	NC_017730	CCAGC	2	10	157423	157432	20 %	0 %	20 %	60 %	386739513
99	NC_017730	TTGCC	2	10	157933	157942	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017730	GTACC	2	10	159892	159901	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017730	TACGC	2	10	160449	160458	20 %	20 %	20 %	40 %	386739515
102	NC_017730	GGTTG	2	10	165213	165222	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017730	CCTTG	2	10	165589	165598	0 %	40 %	20 %	40 %	386739521
104	NC_017730	GCATA	2	10	167312	167321	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017730	TGTGC	2	10	168535	168544	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017730	CGGTG	2	10	169558	169567	0 %	20 %	60 %	20 %	386739524
107	NC_017730	CATGG	2	10	171691	171700	20 %	20 %	40 %	20 %	386739526
108	NC_017730	CAGAT	2	10	172047	172056	40 %	20 %	20 %	20 %	386739526
109	NC_017730	GGATG	2	10	172945	172954	20 %	20 %	60 %	0 %	386739526
110	NC_017730	GGGAC	2	10	175313	175322	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017730	CACTT	2	10	175493	175502	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017730	AAACT	2	10	176370	176379	60 %	20 %	0 %	20 %	386739527
113	NC_017730	ACCGG	2	10	176765	176774	20 %	0 %	40 %	40 %	386739527
114	NC_017730	TAGAA	2	10	184349	184358	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017730	TTAAG	2	10	187662	187671	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017730	TGACC	2	10	188580	188589	20 %	20 %	20 %	40 %	386739532
117	NC_017730	TAATA	2	10	189386	189395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017730	TTGCA	2	10	189864	189873	20 %	40 %	20 %	20 %	386739533
119	NC_017730	GTTTG	2	10	191677	191686	0 %	60 %	40 %	0 %	386739534
120	NC_017730	CGGAT	2	10	192616	192625	20 %	20 %	40 %	20 %	386739535
121	NC_017730	AGCGC	2	10	193774	193783	20 %	0 %	40 %	40 %	386739536
122	NC_017730	GCAGT	2	10	195261	195270	20 %	20 %	40 %	20 %	386739537
123	NC_017730	CAATG	2	10	195532	195541	40 %	20 %	20 %	20 %	386739537
124	NC_017730	TAACG	2	10	196506	196515	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017730	AAGCC	2	10	197833	197842	40 %	0 %	20 %	40 %	386739540
126	NC_017730	GGCCC	2	10	199906	199915	0 %	0 %	40 %	60 %	386739543
127	NC_017730	GAATT	2	10	203471	203480	40 %	40 %	20 %	0 %	386739548
128	NC_017730	CAAGG	2	10	204360	204369	40 %	0 %	40 %	20 %	386739548
129	NC_017730	GATGG	2	10	206807	206816	20 %	20 %	60 %	0 %	386739549
130	NC_017730	TGGCG	2	10	207541	207550	0 %	20 %	60 %	20 %	386739550
131	NC_017730	CAGGC	2	10	210624	210633	20 %	0 %	40 %	40 %	386739552
132	NC_017730	TTGTA	2	10	211034	211043	20 %	60 %	20 %	0 %	386739553
133	NC_017730	GCGAC	2	10	215549	215558	20 %	0 %	40 %	40 %	386739558
134	NC_017730	AGATC	2	10	215574	215583	40 %	20 %	20 %	20 %	386739558
135	NC_017730	CAAGG	2	10	216486	216495	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017730	AGAAA	2	10	217215	217224	80 %	0 %	20 %	0 %	386739560
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