MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 31 chromosome

Total Repeats: 257

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017730	TTATC	2	10	14079	14088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017730	CAGTA	2	10	14625	14634	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017730	TAGCG	2	10	18340	18349	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017730	TTCGC	2	10	22211	22220	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017730	TGAGG	2	10	39557	39566	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017730	CACAT	2	10	41741	41750	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017730	TGCGG	2	10	42669	42678	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017730	ATTTG	2	10	70056	70065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017730	AGGGG	2	10	73661	73670	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017730	CATGT	2	10	73684	73693	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017730	TAATT	2	10	78377	78386	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017730	AACAA	2	10	95480	95489	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017730	TGCAC	2	10	106128	106137	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017730	CAGCG	2	10	109766	109775	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017730	TGTTT	2	10	123078	123087	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017730	TCTGA	2	10	123363	123372	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017730	TTTGT	2	10	123408	123417	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017730	GGATG	2	10	134255	134264	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017730	AAAAC	2	10	148993	149002	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017730	TTGCC	2	10	157933	157942	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017730	GTACC	2	10	159892	159901	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017730	GGTTG	2	10	165213	165222	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017730	GCATA	2	10	167312	167321	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017730	TGTGC	2	10	168535	168544	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017730	GGGAC	2	10	175313	175322	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017730	CACTT	2	10	175493	175502	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017730	TAGAA	2	10	184349	184358	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017730	TTAAG	2	10	187662	187671	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017730	TAATA	2	10	189386	189395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017730	TAACG	2	10	196506	196515	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017730	CAAGG	2	10	216486	216495	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017730	GAAAA	2	10	223389	223398	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017730	CGAGA	2	10	224027	224036	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017730	CAAAA	2	10	227652	227661	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017730	ATTAG	2	10	303798	303807	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017730	TGCGA	2	10	308985	308994	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017730	AGCGG	2	10	311811	311820	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017730	TGGGG	2	10	319499	319508	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017730	TTGTG	2	10	320259	320268	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017730	CTTGC	2	10	353790	353799	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017730	AGGGG	2	10	363099	363108	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017730	TTTGG	2	10	377467	377476	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017730	AGGAG	2	10	385639	385648	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017730	CTAAA	2	10	398728	398737	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017730	CGAGC	2	10	400972	400981	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017730	GATGC	2	10	401171	401180	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017730	CTCCG	2	10	403467	403476	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_017730	TGGCT	2	10	403700	403709	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017730	AGCGC	2	10	403909	403918	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017730	GCGGA	2	10	404351	404360	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017730	GATGT	2	10	448380	448389	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017730	GGTGG	2	10	452248	452257	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017730	CGCAA	2	10	453709	453718	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017730	CTGTG	2	10	454925	454934	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017730	CGAGA	2	10	460041	460050	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017730	AAAAG	2	10	460085	460094	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017730	TGATG	2	10	461094	461103	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017730	AGGCA	2	10	469407	469416	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017730	TGCCT	2	10	469436	469445	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017730	AGGGG	2	10	501553	501562	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017730	CTTCT	2	10	512611	512620	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017730	CCCCG	2	10	523604	523613	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
63	NC_017730	TTCAA	2	10	534086	534095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017730	TCCGG	2	10	539686	539695	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017730	GGCGT	2	10	539809	539818	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017730	CTTGG	2	10	576358	576367	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017730	GGGGA	2	10	576370	576379	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017730	GCACA	2	10	576793	576802	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017730	GACTG	2	10	577820	577829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017730	AAGAA	2	10	579479	579488	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017730	ATTAG	2	10	582141	582150	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017730	CCAAG	2	10	586293	586302	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017730	CAGAC	2	10	587384	587393	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017730	ATTTG	2	10	588241	588250	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017730	TGGGG	2	10	590067	590076	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017730	CCTAG	2	10	590436	590445	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017730	CGCTA	2	10	590934	590943	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017730	TGTGG	2	10	612181	612190	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017730	TCGTG	2	10	613410	613419	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017730	CGTCA	2	10	613746	613755	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017730	GGGAG	2	10	614571	614580	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017730	TGTGT	3	15	617168	617182	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017730	CGTCT	2	10	634516	634525	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017730	GTCCT	2	10	636000	636009	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017730	AAAGG	2	10	638036	638045	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017730	GAGGT	2	10	653635	653644	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017730	TCAAA	2	10	653776	653785	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017730	CGGGG	2	10	658622	658631	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017730	TTTCA	2	10	659048	659057	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017730	GTTTT	2	10	681787	681796	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017730	TGAAT	2	10	712670	712679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017730	GGGAA	2	10	724389	724398	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017730	GCGAC	2	10	768393	768402	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017730	GCCAT	2	10	775093	775102	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017730	CAGTT	2	10	779913	779922	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017730	AACGA	2	10	784036	784045	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017730	TCGAA	2	10	786482	786491	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017730	CGATC	2	10	786659	786668	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017730	AGCTG	2	10	786941	786950	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017730	TCTCC	2	10	802792	802801	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_017730	GAATC	2	10	810310	810319	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017730	CATTA	2	10	827201	827210	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017730	TGGTT	2	10	857876	857885	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017730	ATTTT	2	10	867762	867771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017730	TGTCA	2	10	867774	867783	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017730	GGGTA	2	10	868463	868472	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017730	CGCAC	2	10	891207	891216	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_017730	CGAAA	2	10	892412	892421	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017730	ATAAA	2	10	909504	909513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017730	CCCTG	2	10	909551	909560	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_017730	AAGAA	2	10	909565	909574	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017730	TATGT	2	10	919387	919396	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017730	GCATG	2	10	919610	919619	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017730	ACTAA	2	10	927627	927636	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017730	AATAA	2	10	936158	936167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017730	CTCAT	2	10	938256	938265	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_017730	CGTAA	2	10	940642	940651	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017730	CTGCA	2	10	950986	950995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017730	TAAAA	2	10	954767	954776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017730	TACCG	2	10	956080	956089	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017730	TGATG	2	10	960659	960668	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017730	AGGGG	2	10	962930	962939	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017730	TCTAG	2	10	968856	968865	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017730	GAGAA	2	10	983920	983929	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017730	GAACA	2	10	990845	990854	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017730	AGCAC	2	10	997352	997361	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017730	CAAAA	2	10	1009808	1009817	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017730	ATTCA	2	10	1018819	1018828	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017730	TCGTG	2	10	1024775	1024784	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017730	CGTCA	2	10	1025111	1025120	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017730	TGTGT	3	15	1028613	1028627	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017730	TTTTG	2	10	1043062	1043071	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017730	AAAGC	2	10	1051191	1051200	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017730	GCAAA	2	10	1056412	1056421	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017730	TGTTC	2	10	1056451	1056460	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017730	TTTGC	2	10	1067390	1067399	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017730	CGTAA	2	10	1070509	1070518	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017730	CTTTA	2	10	1092879	1092888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017730	TAGCT	2	10	1096843	1096852	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017730	GTTGG	2	10	1096867	1096876	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017730	AATAA	2	10	1101804	1101813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017730	TAACG	2	10	1113057	1113066	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017730	CTTAC	2	10	1116212	1116221	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017730	CGGGG	2	10	1121913	1121922	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017730	ACAAT	2	10	1123555	1123564	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017730	AAGGA	2	10	1134883	1134892	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017730	CCCGG	2	10	1141358	1141367	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
148	NC_017730	TAAAG	2	10	1150205	1150214	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017730	GCCCC	2	10	1159101	1159110	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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162	NC_017730	CTTAC	2	10	1285680	1285689	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_017730	TCTAG	2	10	1441036	1441045	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_017730	AAAAT	2	10	1464450	1464459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_017730	GACGC	2	10	2205412	2205421	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
252	NC_017730	ATGCA	2	10	2207870	2207879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
253	NC_017730	AGCCT	2	10	2209853	2209862	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
254	NC_017730	AAAAT	2	10	2253169	2253178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017730	GGGCC	2	10	2260417	2260426	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
256	NC_017730	CCAGC	2	10	2260439	2260448	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
257	NC_017730	CTTTT	2	10	2278972	2278981	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.