MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 31 chromosome

Total Repeats: 943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017730	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017730	AGTT	2	8	9009	9016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017730	ACTC	2	8	9473	9480	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017730	CAAC	2	8	9631	9638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017730	GCAT	2	8	9726	9733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017730	GATC	2	8	10334	10341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017730	CACG	2	8	10757	10764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017730	TCGC	2	8	12458	12465	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017730	GGAT	2	8	12468	12475	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017730	GAAA	2	8	20235	20242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017730	ACTC	2	8	21702	21709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017730	ATTT	2	8	22066	22073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017730	TTCC	2	8	22108	22115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017730	GTCG	2	8	22124	22131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017730	GGCT	2	8	22764	22771	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017730	CAAA	2	8	22928	22935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017730	AGGA	2	8	25042	25049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017730	AGCG	2	8	25209	25216	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017730	TTGA	2	8	25397	25404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017730	TCAT	2	8	25978	25985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017730	TGAT	2	8	25996	26003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017730	GGTG	2	8	27133	27140	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017730	GCTA	2	8	31286	31293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017730	AAGA	2	8	41270	41277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017730	TGCG	2	8	41722	41729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017730	CAAG	2	8	42657	42664	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017730	GCTG	2	8	43604	43611	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017730	TCGG	2	8	44556	44563	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017730	TGCT	2	8	45221	45228	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017730	AATG	2	8	45661	45668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017730	AAAT	2	8	47304	47311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017730	TTGC	2	8	49033	49040	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017730	GTTT	2	8	52102	52109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017730	TTGG	2	8	59011	59018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017730	GCAC	2	8	61547	61554	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017730	CTTT	2	8	63309	63316	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017730	GCGG	2	8	64960	64967	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017730	AGTG	2	8	71091	71098	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017730	ATGA	2	8	73706	73713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017730	TGCC	2	8	76616	76623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017730	GGAA	2	8	76649	76656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017730	TAAT	2	8	78397	78404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017730	TCCT	2	8	81123	81130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017730	TCTT	2	8	92127	92134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017730	TTGC	2	8	92790	92797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017730	TCTT	2	8	106923	106930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017730	GCAG	2	8	114154	114161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017730	GAGG	2	8	115722	115729	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017730	TACC	2	8	119387	119394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017730	GAAT	2	8	119413	119420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017730	GGCA	2	8	119423	119430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017730	TCCT	2	8	125483	125490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017730	TCTT	2	8	125687	125694	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017730	ATTT	2	8	131663	131670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017730	GGTG	2	8	136509	136516	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017730	TGGA	2	8	136610	136617	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017730	TGCG	2	8	145166	145173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017730	CAAA	2	8	154183	154190	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017730	GCCC	2	8	158105	158112	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_017730	CTGC	2	8	158242	158249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017730	TTCC	2	8	159863	159870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017730	ATGC	2	8	161356	161363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017730	ATAC	2	8	164912	164919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017730	CAGG	2	8	164932	164939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017730	GTAG	2	8	165046	165053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017730	CTAC	2	8	165063	165070	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017730	CGGC	2	8	167213	167220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017730	TTTG	2	8	168377	168384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017730	TGTT	2	8	173365	173372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017730	TCCC	2	8	173633	173640	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_017730	CGGT	2	8	173863	173870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017730	TCAC	2	8	173917	173924	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017730	GAAT	2	8	173928	173935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017730	GCTA	2	8	174146	174153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017730	AAGG	2	8	174404	174411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017730	GTTG	2	8	174970	174977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017730	GAGG	2	8	175053	175060	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017730	TGCT	2	8	175067	175074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017730	AAAT	2	8	175344	175351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017730	GGAC	2	8	175605	175612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017730	ATAG	2	8	179069	179076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017730	CTGG	2	8	179710	179717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017730	ATTA	2	8	182807	182814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017730	TGCG	2	8	182936	182943	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017730	ATCG	2	8	183039	183046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017730	TGAC	2	8	183382	183389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017730	TCTT	2	8	183452	183459	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017730	AAAG	2	8	184175	184182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017730	GTAA	2	8	184571	184578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017730	TTTG	2	8	184661	184668	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017730	AGAT	2	8	184997	185004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017730	GCAC	2	8	185554	185561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017730	AGCC	2	8	187683	187690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017730	ATCT	2	8	189559	189566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017730	TGGG	2	8	196493	196500	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017730	CAGT	2	8	198231	198238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017730	ATGG	2	8	199817	199824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017730	TCAC	2	8	205854	205861	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017730	CGAA	2	8	209189	209196	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017730	TTCC	2	8	213236	213243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017730	GTCC	2	8	214470	214477	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017730	CTCA	2	8	214647	214654	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017730	ATCC	2	8	216463	216470	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017730	TAGA	2	8	221663	221670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017730	GCCC	2	8	223493	223500	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_017730	GTCT	2	8	223849	223856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017730	TTCA	2	8	234630	234637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017730	TCCT	2	8	236636	236643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017730	GATA	2	8	236751	236758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017730	GTAG	2	8	236765	236772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017730	CCTA	2	8	236793	236800	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017730	AGCC	2	8	239710	239717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017730	TTTA	2	8	241992	241999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017730	CGCC	2	8	249828	249835	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_017730	AGTT	2	8	250991	250998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017730	ACTC	2	8	258729	258736	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017730	ATGA	2	8	259201	259208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017730	ATTA	2	8	259264	259271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017730	GAAT	2	8	263879	263886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017730	TATT	2	8	266427	266434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017730	AGTC	2	8	266436	266443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017730	AACT	2	8	276497	276504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017730	CCTT	2	8	276586	276593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017730	AAAT	2	8	279122	279129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017730	CGTG	2	8	279181	279188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017730	TCCC	2	8	285422	285429	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_017730	GCTT	2	8	291712	291719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017730	CTCG	2	8	292805	292812	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017730	AAGG	2	8	292851	292858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017730	CTGA	2	8	303764	303771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017730	GCTG	2	8	308966	308973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017730	ATCG	2	8	310570	310577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017730	TGCC	2	8	311792	311799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017730	CGGT	2	8	313533	313540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017730	GCTT	2	8	313691	313698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017730	CCTT	2	8	318128	318135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017730	GCTT	2	8	320277	320284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017730	TTAT	2	8	326076	326083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017730	AGGA	2	8	327495	327502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017730	AGCG	2	8	331446	331453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017730	TGCC	2	8	331530	331537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017730	GTAT	2	8	337276	337283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017730	GGAT	2	8	345249	345256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017730	CTGG	2	8	345272	345279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017730	AGTA	2	8	347203	347210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017730	TTTC	2	8	347431	347438	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017730	GAAT	2	8	353973	353980	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017730	TGGT	2	8	354580	354587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017730	AGTG	2	8	355852	355859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017730	TCCT	2	8	358082	358089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017730	GCCG	2	8	358163	358170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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