MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 31 chromosome

Total Repeats: 26744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017730	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739354
2	NC_017730	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
3	NC_017730	ACT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739354
4	NC_017730	TGC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
5	NC_017730	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386739354
6	NC_017730	TTC	3	9	456	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739354
7	NC_017730	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739354
8	NC_017730	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
9	NC_017730	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
10	NC_017730	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386739354
11	NC_017730	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739354
12	NC_017730	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739354
13	NC_017730	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386739354
14	NC_017730	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739354
15	NC_017730	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739354
16	NC_017730	ACT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739354
17	NC_017730	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739354
18	NC_017730	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739354
19	NC_017730	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739354
20	NC_017730	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739354
21	NC_017730	CGA	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739354
22	NC_017730	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
23	NC_017730	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739354
24	NC_017730	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739354
25	NC_017730	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
26	NC_017730	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739354
27	NC_017730	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739354
28	NC_017730	TAC	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739355
29	NC_017730	TCA	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739355
30	NC_017730	GAT	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739355
31	NC_017730	GCT	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739355
32	NC_017730	CAT	2	6	2638	2643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739355
33	NC_017730	GCA	3	9	2828	2836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739355
34	NC_017730	GCT	2	6	3169	3174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739355
35	NC_017730	CGG	2	6	3306	3311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739355
36	NC_017730	AGA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739355
37	NC_017730	GAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739355
38	NC_017730	TTG	2	6	3764	3769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739356
39	NC_017730	CTG	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739356
40	NC_017730	TTG	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739356
41	NC_017730	GAT	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739356
42	NC_017730	GAG	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739356
43	NC_017730	TCA	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739356
44	NC_017730	GAC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739356
45	NC_017730	CGA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739356
46	NC_017730	GCC	2	6	4732	4737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386739356
47	NC_017730	CTG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739357
48	NC_017730	AGA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739357
49	NC_017730	GCG	2	6	4930	4935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739357
50	NC_017730	TGG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739357
51	NC_017730	AGC	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739357
52	NC_017730	ATG	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739357
53	NC_017730	TGG	2	6	5867	5872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739358
54	NC_017730	TGG	2	6	5903	5908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739358
55	NC_017730	ACC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739358
56	NC_017730	ACC	3	9	6096	6104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739358
57	NC_017730	CAT	2	6	6116	6121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739358
58	NC_017730	CGT	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739358
59	NC_017730	TGA	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
60	NC_017730	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739358
61	NC_017730	GAA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739358
62	NC_017730	GAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739358
63	NC_017730	TTA	2	6	6335	6340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386739358
64	NC_017730	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
65	NC_017730	GAA	2	6	6531	6536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739358
66	NC_017730	TGA	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
67	NC_017730	TCT	2	6	6816	6821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739358
68	NC_017730	GGC	2	6	6836	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739358
69	NC_017730	TGG	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739358
70	NC_017730	ATT	2	6	7095	7100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386739358
71	NC_017730	ATG	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
72	NC_017730	CAA	2	6	7139	7144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386739358
73	NC_017730	GCT	3	9	7208	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739358
74	NC_017730	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739358
75	NC_017730	CCG	2	6	7278	7283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386739358
76	NC_017730	GAA	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739358
77	NC_017730	CAA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386739358
78	NC_017730	GAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
79	NC_017730	ATG	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
80	NC_017730	TGA	2	6	7514	7519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
81	NC_017730	TCG	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739358
82	NC_017730	CAG	2	6	7748	7753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739359
83	NC_017730	TTC	2	6	7896	7901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739359
84	NC_017730	GAG	2	6	7944	7949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739359
85	NC_017730	AGC	2	6	7956	7961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739359
86	NC_017730	TGC	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739359
87	NC_017730	GAG	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739359
88	NC_017730	ATT	2	6	8301	8306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386739360
89	NC_017730	CTG	2	6	8544	8549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739361
90	NC_017730	TGT	2	6	8589	8594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739361
91	NC_017730	CTG	2	6	8597	8602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739361
92	NC_017730	TGC	2	6	8648	8653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739361
93	NC_017730	GTC	2	6	8658	8663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739361
94	NC_017730	GCG	2	6	8720	8725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739362
95	NC_017730	TGA	2	6	8806	8811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739362
96	NC_017730	GCT	2	6	8823	8828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739362
97	NC_017730	TGT	2	6	11657	11662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739363
98	NC_017730	TGG	2	6	11807	11812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739363
99	NC_017730	TGG	2	6	11816	11821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739363
100	NC_017730	CAT	2	6	11885	11890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739363
101	NC_017730	GGT	2	6	11949	11954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739363
102	NC_017730	GAA	2	6	11973	11978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739363
103	NC_017730	CAT	2	6	12518	12523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739364
104	NC_017730	TGT	3	9	12565	12573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739364
105	NC_017730	GGT	2	6	12574	12579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739364
106	NC_017730	GCG	2	6	12600	12605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739364
107	NC_017730	TGG	2	6	12715	12720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739364
108	NC_017730	GGC	2	6	12772	12777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739364
109	NC_017730	CTG	3	9	12897	12905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739364
110	NC_017730	ATC	2	6	13005	13010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739364
111	NC_017730	GCT	2	6	13020	13025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739364
112	NC_017730	TTC	2	6	13069	13074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739364
113	NC_017730	TTG	2	6	13171	13176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739364
114	NC_017730	TCC	2	6	13193	13198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386739364
115	NC_017730	GCT	2	6	13575	13580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739365
116	NC_017730	CTG	2	6	13618	13623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739365
117	NC_017730	TGA	2	6	13640	13645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739365
118	NC_017730	CCA	2	6	13656	13661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739365
119	NC_017730	GAT	2	6	13764	13769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739365
120	NC_017730	TGA	2	6	13772	13777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739365
121	NC_017730	ACC	2	6	13797	13802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739365
122	NC_017730	TGA	2	6	13847	13852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739365
123	NC_017730	GAA	2	6	13914	13919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739365
124	NC_017730	AGT	2	6	13988	13993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739365
125	NC_017730	GAA	2	6	14360	14365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739366
126	NC_017730	ACC	2	6	14367	14372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739366
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128	NC_017730	CTT	2	6	14393	14398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739366
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