MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus anthracis str. H9401 chromosome

Total Repeats: 372

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017729	CTATTA	2	12	1854	1865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017729	TTTCGT	2	12	10905	10916	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017729	TTTCGT	2	12	30699	30710	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017729	TTTAAA	2	12	41436	41447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017729	CTTTTT	2	12	74465	74476	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017729	GTATCT	2	12	79253	79264	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017729	TTATAT	2	12	82129	82140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017729	TATATT	2	12	82224	82235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017729	AGTCAA	2	12	87387	87398	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017729	AAATAC	2	12	163598	163609	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017729	GTATGT	2	12	177272	177283	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017729	GTATGT	2	12	183111	183122	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017729	TAAATT	2	12	191751	191762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017729	AAAATA	2	12	210680	210691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017729	AAGGGG	2	12	210764	210775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017729	GTTTTG	2	12	212247	212258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017729	AGAGGT	2	12	214148	214159	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017729	TTTCAT	2	12	228450	228461	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017729	ATAAAA	2	12	241499	241510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017729	AAAAGA	2	12	254834	254845	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017729	AGTAAT	2	12	285429	285440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017729	TATATT	2	12	309853	309864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017729	TATAAA	2	12	316639	316650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017729	CTTTTA	2	12	327413	327424	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017729	AAAAAT	2	12	332657	332668	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017729	AATAGA	2	12	332903	332914	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017729	AAAAAG	2	12	337195	337206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017729	AATGAT	2	12	353756	353767	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017729	TTATTT	2	12	366857	366868	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017729	AAAAAT	2	12	372925	372936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017729	TTTATA	2	12	394884	394895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017729	AAAAAT	2	12	402793	402804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017729	ATTTTT	2	12	427210	427221	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017729	CCAATT	2	12	433045	433056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017729	TAAAAT	2	12	443917	443928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017729	AGTGCG	2	12	449544	449555	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017729	TAAAAA	2	12	452448	452459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017729	CTTTTT	2	12	453504	453515	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017729	TTTTTG	2	12	454049	454060	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017729	AATGAT	2	12	470868	470879	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017729	AAGTAT	2	12	476709	476720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017729	TTTTCT	2	12	486824	486835	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017729	GAAGTT	2	12	504266	504277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017729	TAAAAA	2	12	537008	537019	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017729	ATCATT	2	12	543152	543163	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017729	TGTATA	2	12	595177	595188	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017729	CTTTTT	2	12	608115	608126	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017729	ACTTAA	2	12	705329	705340	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017729	TTTTTA	2	12	715425	715436	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017729	TTAAAA	2	12	725195	725206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017729	TTAATT	2	12	731993	732004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017729	TTTTAT	2	12	769264	769275	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017729	GTATAT	2	12	785111	785122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017729	ATAAAA	2	12	787853	787864	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017729	ACATTT	2	12	791074	791085	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017729	ATAAGT	2	12	791148	791159	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017729	ATGTAA	2	12	807472	807483	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017729	TTAAAG	2	12	822524	822535	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017729	AATGTA	2	12	850843	850854	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017729	ACGAGA	2	12	850891	850902	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017729	GTTTTT	2	12	856447	856458	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017729	TCATAT	2	12	863862	863873	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017729	GTATAT	3	18	867509	867526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017729	AAGTAG	2	12	884154	884165	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017729	TTGAAA	2	12	890365	890376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017729	TGTACA	2	12	893645	893656	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017729	TTACAA	2	12	910753	910764	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017729	ATATTT	2	12	911399	911410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017729	AACAAA	3	18	935641	935658	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017729	CAAAAA	2	12	945438	945449	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017729	TGATGG	2	12	952661	952672	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017729	AATGGA	2	12	964977	964988	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017729	AAACAA	2	12	973160	973171	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017729	TACTTT	2	12	983924	983935	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017729	AATTAA	2	12	1001713	1001724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017729	TCTTTT	2	12	1005575	1005586	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017729	AAAATA	2	12	1033640	1033651	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017729	CCTTTT	2	12	1053505	1053516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017729	TAATAT	2	12	1058931	1058942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017729	TTGATA	2	12	1064885	1064896	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017729	AATAAA	2	12	1078991	1079002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017729	TTTATT	2	12	1099750	1099761	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017729	ATTTTT	2	12	1100836	1100847	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017729	TGTTTC	2	12	1137995	1138006	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017729	TCCAGC	2	12	1142288	1142299	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017729	TCCAGC	2	12	1142410	1142421	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017729	AATATA	2	12	1152147	1152158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017729	CTTTTC	2	12	1163587	1163598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017729	AAGTAT	2	12	1181119	1181130	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017729	AAATAA	2	12	1229433	1229444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017729	AAAATT	2	12	1235301	1235312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017729	AATGAT	2	12	1277822	1277833	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017729	GGATAA	2	12	1283298	1283309	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017729	GAATTT	2	12	1284792	1284803	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017729	AATGAA	2	12	1294243	1294254	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017729	AAAAGT	2	12	1295226	1295237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017729	AAAAGA	2	12	1296569	1296580	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017729	TGCTCA	2	12	1298928	1298939	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017729	TTTACT	2	12	1303897	1303908	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017729	GAAAGG	2	12	1339294	1339305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017729	ATACAA	2	12	1353491	1353502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017729	GTTTTT	2	12	1374983	1374994	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017729	ATTTCT	2	12	1379997	1380008	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017729	TTATCA	2	12	1389822	1389833	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017729	TTTTTA	2	12	1501024	1501035	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017729	ATTTTT	2	12	1543352	1543363	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017729	TTTCTA	2	12	1584895	1584906	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017729	AAAACT	2	12	1586957	1586968	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017729	TAAAAA	2	12	1586992	1587003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017729	TGTTTT	2	12	1593694	1593705	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017729	CATATA	2	12	1594544	1594555	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017729	TATAAC	2	12	1608762	1608773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017729	TTTATT	2	12	1631027	1631038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017729	GAATAG	2	12	1641425	1641436	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017729	AATCAT	2	12	1643414	1643425	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017729	GAAAAT	2	12	1682667	1682678	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017729	TGTTTT	2	12	1694634	1694645	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017729	GGTGTT	2	12	1745187	1745198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017729	AAATTG	2	12	1752953	1752964	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017729	TATTCT	2	12	1754321	1754332	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017729	AAATAA	2	12	1780518	1780529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017729	AAGTTA	2	12	1789586	1789597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017729	ATATTT	2	12	1795534	1795545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017729	TTTTTA	2	12	1827288	1827299	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017729	GAAAGA	2	12	1847320	1847331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017729	AATTAT	2	12	1855065	1855076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017729	TATGAA	2	12	1870346	1870357	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017729	AAAAAT	2	12	1876805	1876816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017729	TTTGTA	2	12	1879605	1879616	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017729	TATAAT	2	12	1881919	1881930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.