MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes 07PF0776 chromosome

Total Repeats: 1189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017728	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017728	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386730766
3	NC_017728	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386730767
4	NC_017728	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386730767
5	NC_017728	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386730767
6	NC_017728	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386730768
7	NC_017728	AAAAGC	2	12	11269	11280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386730769
8	NC_017728	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386730773
9	NC_017728	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386730773
10	NC_017728	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017728	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017728	ATTTTC	2	12	21960	21971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386730778
13	NC_017728	CTTCAT	2	12	22976	22987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386730780
14	NC_017728	TTTTGG	2	12	23340	23351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730780
15	NC_017728	ATTGAA	2	12	26989	27000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386730783
16	NC_017728	CCAAAA	2	12	37140	37151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730796
17	NC_017728	AATTAT	2	12	37754	37765	50 %	50 %	0 %	0 %	386730797
18	NC_017728	TCACCA	2	12	38901	38912	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386730799
19	NC_017728	CGATTA	2	12	44331	44342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386730803
20	NC_017728	TTATGT	2	12	48820	48831	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386730806
21	NC_017728	AAAGAT	2	12	52472	52483	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386730809
22	NC_017728	TGAAAT	2	12	53309	53320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386730810
23	NC_017728	TGGCGG	2	12	56442	56453	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386730814
24	NC_017728	TCAAAA	2	12	56562	56573	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386730814
25	NC_017728	AAAAAT	2	12	59009	59020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386730819
26	NC_017728	GCAGAA	2	12	62934	62945	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386730821
27	NC_017728	AGGTAA	2	12	63025	63036	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386730822
28	NC_017728	TGATTG	2	12	64413	64424	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386730823
29	NC_017728	TGATTT	2	12	69744	69755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386730828
30	NC_017728	TTTTGC	2	12	70349	70360	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386730829
31	NC_017728	AAATAA	2	12	83182	83193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386730843
32	NC_017728	TAAATT	2	12	86072	86083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017728	ATTTAT	2	12	86245	86256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017728	CTTTTT	2	12	95158	95169	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386730856
35	NC_017728	ATCACT	2	12	98218	98229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730859
36	NC_017728	GATATT	2	12	98277	98288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386730859
37	NC_017728	CAGATT	2	12	101794	101805	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386730859
38	NC_017728	AACTAT	2	12	104570	104581	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386730860
39	NC_017728	AACCAG	2	12	109808	109819	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386730865
40	NC_017728	TATTAG	2	12	114101	114112	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386730870
41	NC_017728	TAGCAG	2	12	114164	114175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386730870
42	NC_017728	TTATTT	2	12	117627	117638	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386730874
43	NC_017728	ATTACA	2	12	121821	121832	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386730879
44	NC_017728	TAAAAT	2	12	125545	125556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730882
45	NC_017728	CAAAAT	2	12	125686	125697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386730882
46	NC_017728	CAAGCG	2	12	126687	126698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730882
47	NC_017728	GTTTTA	2	12	132453	132464	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386730890
48	NC_017728	TGATTT	2	12	134469	134480	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386730894
49	NC_017728	AAGTAA	2	12	138440	138451	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017728	CCGTTA	2	12	141947	141958	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386730903
51	NC_017728	CAGGTT	2	12	149272	149283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017728	CAACTG	2	12	151693	151704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386730912
53	NC_017728	TCTGAA	2	12	154675	154686	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386730917
54	NC_017728	GTTGCA	2	12	160339	160350	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386730924
55	NC_017728	GATTGC	2	12	160401	160412	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386730924
56	NC_017728	AGGCGG	2	12	166049	166060	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386730928
57	NC_017728	CGTAAC	2	12	168870	168881	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386730929
58	NC_017728	AGTACC	2	12	168915	168926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386730929
59	NC_017728	GTTTTC	2	12	169892	169903	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386730930
60	NC_017728	GTTGAT	2	12	171508	171519	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386730932
61	NC_017728	GTAAAA	2	12	171871	171882	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386730932
62	NC_017728	TTTTAC	2	12	173915	173926	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386730936
63	NC_017728	TTTTTA	2	12	174952	174963	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386730938
64	NC_017728	GCATTA	2	12	175182	175193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386730938
65	NC_017728	AAAGTA	2	12	176164	176175	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386730939
66	NC_017728	ACACTT	2	12	177081	177092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017728	TTGCAC	2	12	179058	179069	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386730941
68	NC_017728	AGAAGT	2	12	181206	181217	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386730942
69	NC_017728	CAATCC	2	12	183122	183133	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386730944
70	NC_017728	AAAGAT	2	12	185133	185144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386730946
71	NC_017728	TGAAGT	2	12	189378	189389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730947
72	NC_017728	CATTGA	2	12	197511	197522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386730954
73	NC_017728	TGCAGC	2	12	198166	198177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386730955
74	NC_017728	TAAAAA	2	12	200404	200415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386730957
75	NC_017728	AATAAA	2	12	203410	203421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017728	AAAGCA	2	12	213616	213627	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386730969
77	NC_017728	TTCTTT	2	12	218315	218326	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386730975
78	NC_017728	GAAAAA	2	12	220404	220415	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386730977
79	NC_017728	GAAAAA	2	12	221628	221639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386730979
80	NC_017728	GCAAGT	2	12	227455	227466	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386730982
81	NC_017728	GAAAAC	2	12	230325	230336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017728	TGTCGG	2	12	231375	231386	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386730985
83	NC_017728	AAAAAC	2	12	232860	232871	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386730986
84	NC_017728	GCAGAA	2	12	234404	234415	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386730987
85	NC_017728	TAAAAT	2	12	237717	237728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730991
86	NC_017728	CCAGAA	2	12	238930	238941	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386730992
87	NC_017728	ATTCAA	2	12	241219	241230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017728	AAGGAA	2	12	242790	242801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017728	TAGGCG	2	12	244443	244454	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017728	ATTCAA	2	12	247238	247249	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017728	AAGGAA	2	12	248809	248820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017728	TAGGCG	2	12	250462	250473	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017728	AGTCAA	2	12	252276	252287	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017728	TTTACC	2	12	252705	252716	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386730994
95	NC_017728	AGTAAA	2	12	259962	259973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386731000
96	NC_017728	GTACGT	2	12	260768	260779	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386731002
97	NC_017728	TTATAT	2	12	267061	267072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017728	ACAGTA	2	12	267390	267401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386731010
99	NC_017728	AAAACA	2	12	267765	267776	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386731011
100	NC_017728	GCATGG	2	12	267946	267957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386731011
101	NC_017728	CTGTAG	2	12	270890	270901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386731016
102	NC_017728	GACAAT	2	12	272402	272413	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386731019
103	NC_017728	GTGAGC	2	12	272857	272868	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386731019
104	NC_017728	ATTGAT	2	12	273051	273062	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386731019
105	NC_017728	TAAAAA	2	12	274121	274132	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386731020
106	NC_017728	TGAATC	2	12	274907	274918	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386731021
107	NC_017728	GCTACT	2	12	276599	276610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386731022
108	NC_017728	TTCTGA	2	12	279673	279684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386731024
109	NC_017728	AAGAAA	2	12	282889	282900	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386731026
110	NC_017728	TTCGTG	2	12	288645	288656	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386731027
111	NC_017728	TAACAA	2	12	291951	291962	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386731030
112	NC_017728	TTTAAC	2	12	293024	293035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386731031
113	NC_017728	GTTGAG	2	12	294878	294889	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386731032
114	NC_017728	ATTTTT	2	12	295151	295162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386731032
115	NC_017728	TTTATA	2	12	295695	295706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386731033
116	NC_017728	CCAAAT	2	12	297684	297695	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386731034
117	NC_017728	AGAACT	2	12	300298	300309	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386731036
118	NC_017728	AACTTT	2	12	302778	302789	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017728	TACAAG	2	12	304542	304553	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386731040
120	NC_017728	CGAAAT	2	12	304596	304607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386731040
121	NC_017728	TAAAAA	2	12	308147	308158	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017728	CATTAT	2	12	308326	308337	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386731043
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228	NC_017728	GACGGC	2	12	575526	575537	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386731301
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233	NC_017728	AATCAC	2	12	589274	589285	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386731314
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236	NC_017728	AGAATT	2	12	595124	595135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386731319
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