MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 07PF0776 chromosome

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017728	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017728	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017728	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017728	TAAATT	2	12	86072	86083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017728	ATTTAT	2	12	86245	86256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017728	AAGTAA	2	12	138440	138451	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017728	CAGGTT	2	12	149272	149283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017728	ACACTT	2	12	177081	177092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017728	AATAAA	2	12	203410	203421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017728	GAAAAC	2	12	230325	230336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017728	ATTCAA	2	12	241219	241230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017728	AAGGAA	2	12	242790	242801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017728	TAGGCG	2	12	244443	244454	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017728	ATTCAA	2	12	247238	247249	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017728	AAGGAA	2	12	248809	248820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017728	TAGGCG	2	12	250462	250473	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017728	AGTCAA	2	12	252276	252287	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017728	TTATAT	2	12	267061	267072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017728	AACTTT	2	12	302778	302789	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017728	TAAAAA	2	12	308147	308158	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017728	AATACA	2	12	312596	312607	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017728	GAAAAC	2	12	318206	318217	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017728	TTTCTG	2	12	343050	343061	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017728	CATAGA	2	12	360454	360465	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017728	AAATTT	2	12	384023	384034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017728	TAGTTT	2	12	403954	403965	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017728	TTGTTT	2	12	419444	419455	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017728	TAATTA	2	12	465273	465284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017728	AAGTCA	2	12	473790	473801	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017728	CAGAAG	2	12	475472	475483	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017728	TTAAAT	2	12	516401	516412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017728	CTATAA	2	12	518171	518182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017728	AAATGT	2	12	566950	566961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017728	AGATTT	2	12	575081	575092	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017728	AAATAA	2	12	615385	615396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017728	ATCATT	2	12	643740	643751	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017728	TGTAAA	2	12	665676	665687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017728	ATCATT	2	12	684988	684999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017728	AATTAA	2	12	703557	703568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017728	GAATAA	2	12	714654	714665	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017728	TATAGG	2	12	737563	737574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017728	AATTAG	2	12	765010	765021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017728	TGTTGA	2	12	776067	776078	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017728	TTACTT	2	12	850988	850999	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017728	AAATAG	2	12	887392	887403	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017728	GTAATC	2	12	894195	894206	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017728	TTACAA	2	12	894213	894224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017728	ATGAAA	2	12	902817	902828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017728	TTGACT	2	12	1026755	1026766	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017728	AGGAAG	2	12	1036945	1036956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017728	AACAAT	2	12	1075947	1075958	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017728	CTTTTT	2	12	1092248	1092259	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017728	TATATT	2	12	1105104	1105115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017728	CATGTA	2	12	1123847	1123858	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017728	GTGCAT	2	12	1123943	1123954	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017728	AATCCC	2	12	1131489	1131500	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017728	TTAATT	2	12	1132680	1132691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017728	TGAATA	2	12	1133597	1133608	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017728	AAATAA	2	12	1135531	1135542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017728	TTTAGT	2	12	1139400	1139411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017728	CTTTTT	2	12	1177750	1177761	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017728	AAGCAG	2	12	1204908	1204919	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017728	CTTTTT	2	12	1210553	1210564	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017728	GAAAAA	2	12	1240518	1240529	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017728	TAAGTA	2	12	1256012	1256023	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017728	TACCAG	2	12	1263118	1263129	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017728	AAGACG	2	12	1263585	1263596	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017728	TATTAA	2	12	1272203	1272214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017728	GTACAA	2	12	1385499	1385510	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017728	TAATCA	2	12	1418864	1418875	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017728	TACCAA	2	12	1436798	1436809	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017728	TTTCAT	2	12	1462958	1462969	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017728	TAAAAT	2	12	1507004	1507015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017728	TTTATC	2	12	1513591	1513602	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017728	CTCTTC	2	12	1565638	1565649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017728	TAAAAA	2	12	1581099	1581110	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017728	TCATTA	2	12	1601961	1601972	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017728	GGTTGT	2	12	1616285	1616296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017728	GAATAA	2	12	1617838	1617849	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017728	GTAAAC	2	12	1618989	1619000	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017728	ACAAAA	2	12	1627613	1627624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017728	AAAATA	2	12	1631933	1631944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017728	TAAAAA	2	12	1632843	1632854	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017728	AAATAA	2	12	1676855	1676866	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017728	CTTATT	2	12	1718837	1718848	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017728	CGCCTA	2	12	1722347	1722358	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017728	TTTCCT	2	12	1723999	1724010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017728	TTGAAT	2	12	1725571	1725582	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017728	CGCCTA	2	12	1827025	1827036	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017728	TTTCCT	2	12	1828677	1828688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017728	TTGAAT	2	12	1830249	1830260	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017728	AAATGG	2	12	1831233	1831244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017728	GTTTTG	2	12	1838201	1838212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017728	AAAAGA	2	12	1921062	1921073	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017728	CTCTAT	2	12	1940386	1940397	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017728	TCATTT	2	12	1941584	1941595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017728	GTTTTC	2	12	1968753	1968764	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017728	CAAAAA	2	12	1986477	1986488	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017728	GAAAAA	2	12	1990337	1990348	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017728	AGAAAA	2	12	1997188	1997199	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017728	TTCACT	2	12	2140504	2140515	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017728	ATTCAA	2	12	2151234	2151245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017728	TTTAAT	2	12	2187065	2187076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017728	TATATT	2	12	2214152	2214163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017728	AATTTT	2	12	2272113	2272124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017728	AAATTG	2	12	2278289	2278300	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017728	CTCTGT	2	12	2285133	2285144	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017728	TTATTT	2	12	2340149	2340160	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017728	TAATAC	2	12	2368893	2368904	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017728	CGCCTA	2	12	2389689	2389700	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017728	TTTCCT	2	12	2391592	2391603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017728	TTGAAT	2	12	2393164	2393175	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017728	CTTTTT	2	12	2544387	2544398	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017728	ATCCCA	2	12	2564300	2564311	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017728	TTTTTA	2	12	2576127	2576138	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017728	CGCCTA	2	12	2620116	2620127	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017728	TTTCCT	2	12	2622019	2622030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017728	TTGAAT	2	12	2623591	2623602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017728	CCTCTT	2	12	2666063	2666074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017728	AGCTAG	2	12	2681058	2681069	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017728	TAAATC	2	12	2693098	2693109	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017728	AATTTT	2	12	2745990	2746001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017728	ATTAAT	2	12	2749581	2749592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017728	TATCAA	2	12	2840414	2840425	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017728	AAATGA	2	12	2840428	2840439	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017728	TAAAAA	2	12	2840498	2840509	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017728	AAGTAT	2	12	2841365	2841376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017728	AAGACC	2	12	2848633	2848644	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.