MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 07PF0776 chromosome

Total Repeats: 392

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017728	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017728	CTTTT	2	10	16170	16179	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017728	ATTGT	2	10	17721	17730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017728	AAATG	2	10	26105	26114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017728	AAAGG	2	10	37664	37673	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017728	CTATT	2	10	38160	38169	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017728	GACTT	2	10	53457	53466	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017728	ATGGT	2	10	55709	55718	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017728	AAATA	2	10	57765	57774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017728	TAAAA	2	10	58747	58756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017728	TTATG	2	10	60954	60963	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017728	GAAAA	2	10	77744	77753	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017728	CAATA	2	10	78149	78158	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017728	CAAAA	2	10	79154	79163	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017728	GCCTT	2	10	82286	82295	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017728	CAAAA	2	10	82571	82580	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017728	ATAAA	2	10	84551	84560	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017728	GGAAG	2	10	85231	85240	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017728	GCTTT	2	10	85580	85589	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017728	GTATT	2	10	86457	86466	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017728	AGTAA	2	10	87169	87178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017728	TTATA	2	10	87384	87393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017728	ATTTG	2	10	93318	93327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017728	ATTTA	2	10	93444	93453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017728	ATTTT	2	10	96607	96616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017728	ATATC	2	10	118556	118565	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017728	AGAGA	2	10	129382	129391	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017728	TTACT	2	10	130821	130830	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017728	AAAGT	2	10	133062	133071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017728	AGTAG	2	10	154769	154778	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017728	GATAA	2	10	158075	158084	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017728	ATATG	2	10	165055	165064	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017728	TTGTA	2	10	177094	177103	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017728	ATAGA	2	10	197810	197819	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017728	TTGTC	2	10	203335	203344	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017728	ACAAA	2	10	203700	203709	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017728	ATATA	2	10	211442	211451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017728	GTGAG	2	10	215173	215182	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017728	GAGTG	2	10	219467	219476	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017728	AGCCG	2	10	227644	227653	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017728	ATCCG	2	10	228375	228384	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017728	GAAAA	2	10	235773	235782	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017728	GAAAA	2	10	236182	236191	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017728	GAATA	2	10	239270	239279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017728	AAATT	2	10	240956	240965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017728	TAATT	2	10	241157	241166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017728	TCGTG	2	10	242316	242325	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017728	AAGGT	2	10	243784	243793	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017728	TAATT	2	10	247176	247185	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017728	TCGTG	2	10	248335	248344	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017728	AAGGT	2	10	249803	249812	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017728	GGCAT	2	10	267095	267104	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017728	AGTGA	2	10	289212	289221	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017728	AATTA	2	10	291370	291379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017728	TGGCT	2	10	301511	301520	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017728	ACTAA	2	10	302887	302896	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017728	TATAA	2	10	308113	308122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017728	AAAGA	2	10	311341	311350	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017728	CGATG	2	10	317836	317845	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017728	TTATT	2	10	333898	333907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017728	TAGAT	2	10	336325	336334	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017728	TAAAT	2	10	343687	343696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017728	ACTAT	2	10	343799	343808	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017728	AAAAT	2	10	345421	345430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017728	TTTAT	2	10	346169	346178	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017728	TAAAA	2	10	349251	349260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017728	AATAA	2	10	358394	358403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017728	ATTGT	2	10	359752	359761	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017728	TTTTA	2	10	369759	369768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017728	AGGAG	2	10	373383	373392	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017728	ATAGA	2	10	373686	373695	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017728	AAATG	2	10	382564	382573	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017728	CACAC	2	10	383498	383507	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_017728	AAACT	2	10	383772	383781	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017728	AAATT	2	10	384128	384137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017728	GTGAT	2	10	398778	398787	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017728	TGGAT	2	10	404249	404258	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017728	AAAAG	2	10	404715	404724	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017728	CAAAA	2	10	419416	419425	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017728	ATAAA	2	10	425096	425105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017728	TAGAT	2	10	428642	428651	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017728	AGGTG	2	10	450694	450703	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017728	GGAAA	2	10	455819	455828	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017728	AAGAA	2	10	479001	479010	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017728	AAGAA	2	10	479449	479458	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017728	AAAGA	2	10	479553	479562	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017728	CTTAT	2	10	487083	487092	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017728	TTTAT	2	10	497411	497420	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017728	TTTCT	2	10	501784	501793	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017728	CTTTC	2	10	511602	511611	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017728	AAAAT	2	10	511668	511677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017728	AATTT	2	10	516248	516257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017728	ATAGT	2	10	516283	516292	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017728	TTATT	2	10	520375	520384	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017728	CTATG	2	10	520541	520550	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017728	ATACA	2	10	525597	525606	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017728	AAAAC	2	10	550428	550437	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017728	GTTTT	2	10	550450	550459	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017728	AAACA	2	10	552956	552965	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017728	TATAG	2	10	562759	562768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017728	GAAAA	2	10	566869	566878	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017728	TAGAC	2	10	583079	583088	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017728	TAAAA	2	10	589008	589017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017728	CTATG	2	10	596453	596462	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017728	AAAGA	2	10	601907	601916	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017728	ATAAA	2	10	616879	616888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017728	AGAAT	2	10	617749	617758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017728	TGGAA	2	10	617877	617886	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017728	AATCA	2	10	620880	620889	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017728	TATAA	2	10	628818	628827	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017728	ATTGA	2	10	628856	628865	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017728	ATTAA	2	10	642164	642173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017728	ATATA	2	10	673609	673618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017728	GATAT	2	10	674618	674627	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017728	ACATT	2	10	674949	674958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017728	GATTA	2	10	675223	675232	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017728	TTTTA	2	10	676388	676397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017728	AAATT	2	10	676990	676999	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017728	CGGAA	2	10	678519	678528	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017728	ATTTT	2	10	681332	681341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017728	TACAT	2	10	681769	681778	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017728	TATAA	2	10	682823	682832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017728	AAATA	2	10	703626	703635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017728	GAAAT	2	10	706593	706602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017728	TTACT	2	10	714616	714625	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017728	ATTTA	2	10	720267	720276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017728	GGGGA	2	10	730020	730029	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017728	TATTT	2	10	736258	736267	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017728	AGAGA	2	10	736408	736417	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017728	CTTTT	2	10	737383	737392	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017728	CTTTT	2	10	787027	787036	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017728	TAGTT	2	10	787040	787049	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017728	TGAAA	2	10	799198	799207	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017728	AATGA	2	10	816293	816302	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017728	GTATA	2	10	835810	835819	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017728	AATAA	2	10	842248	842257	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017728	ATTTT	2	10	845834	845843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017728	GTTTT	2	10	858769	858778	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017728	AAATT	2	10	859846	859855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017728	AGGAA	2	10	860369	860378	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017728	GATGA	2	10	872460	872469	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017728	ATAGA	2	10	881122	881131	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017728	ATCTT	2	10	882302	882311	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017728	TAATT	2	10	886511	886520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017728	ATTTT	2	10	886778	886787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017728	AATGT	2	10	894179	894188	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017728	TTATA	2	10	917917	917926	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017728	ATAAC	2	10	933908	933917	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.