MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes 07PF0776 chromosome

Total Repeats: 41516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017728	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730762
2	NC_017728	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730762
3	NC_017728	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730762
4	NC_017728	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730762
5	NC_017728	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730762
6	NC_017728	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730762
7	NC_017728	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730762
8	NC_017728	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730762
9	NC_017728	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730762
10	NC_017728	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730762
11	NC_017728	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730762
12	NC_017728	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730762
13	NC_017728	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730762
14	NC_017728	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730762
15	NC_017728	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730762
16	NC_017728	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730762
17	NC_017728	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730762
18	NC_017728	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730762
19	NC_017728	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730762
20	NC_017728	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730762
21	NC_017728	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730762
22	NC_017728	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730762
23	NC_017728	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730762
24	NC_017728	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730762
25	NC_017728	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730762
26	NC_017728	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730762
27	NC_017728	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730763
28	NC_017728	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730763
29	NC_017728	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730763
30	NC_017728	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730763
31	NC_017728	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730763
32	NC_017728	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730763
33	NC_017728	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730763
34	NC_017728	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730763
35	NC_017728	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730763
36	NC_017728	CAA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730763
37	NC_017728	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730763
38	NC_017728	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730763
39	NC_017728	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730763
40	NC_017728	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730763
41	NC_017728	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730763
42	NC_017728	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730763
43	NC_017728	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730764
44	NC_017728	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730764
45	NC_017728	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730764
46	NC_017728	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730764
47	NC_017728	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730764
48	NC_017728	GTA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730764
49	NC_017728	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730764
50	NC_017728	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730764
51	NC_017728	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730764
52	NC_017728	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730764
53	NC_017728	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730764
54	NC_017728	GCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730764
55	NC_017728	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730764
56	NC_017728	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730764
57	NC_017728	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730764
58	NC_017728	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730764
59	NC_017728	TTC	2	6	3996	4001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730764
60	NC_017728	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730764
61	NC_017728	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730764
62	NC_017728	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730764
63	NC_017728	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730764
64	NC_017728	GTA	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730764
65	NC_017728	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730764
66	NC_017728	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730764
67	NC_017728	TTA	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730764
68	NC_017728	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017728	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730765
70	NC_017728	CCG	2	6	4784	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730765
71	NC_017728	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730766
72	NC_017728	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730766
73	NC_017728	AGA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730766
74	NC_017728	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730766
75	NC_017728	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730766
76	NC_017728	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730766
77	NC_017728	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730766
78	NC_017728	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730766
79	NC_017728	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730766
80	NC_017728	TTC	3	9	5800	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730766
81	NC_017728	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730766
82	NC_017728	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730766
83	NC_017728	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730766
84	NC_017728	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730766
85	NC_017728	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017728	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017728	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730767
88	NC_017728	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730767
89	NC_017728	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730767
90	NC_017728	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730767
91	NC_017728	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730767
92	NC_017728	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730767
93	NC_017728	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730767
94	NC_017728	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730767
95	NC_017728	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730767
96	NC_017728	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730767
97	NC_017728	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730767
98	NC_017728	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730767
99	NC_017728	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730767
100	NC_017728	TTA	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730767
101	NC_017728	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730767
102	NC_017728	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730767
103	NC_017728	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730767
104	NC_017728	GCT	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730767
105	NC_017728	TTC	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730767
106	NC_017728	TGG	2	6	7349	7354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730767
107	NC_017728	GAA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730767
108	NC_017728	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730767
109	NC_017728	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730767
110	NC_017728	ACC	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730767
111	NC_017728	AGA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730767
112	NC_017728	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730767
113	NC_017728	ACT	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730767
114	NC_017728	TCG	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730767
115	NC_017728	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730767
116	NC_017728	ATT	2	6	7988	7993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017728	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017728	CAT	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730768
119	NC_017728	TTG	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730768
120	NC_017728	TCG	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730768
121	NC_017728	GGC	2	6	8415	8420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730768
122	NC_017728	CTT	2	6	8467	8472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730768
123	NC_017728	TAA	2	6	8481	8486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730768
124	NC_017728	CAA	2	6	8603	8608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730768
125	NC_017728	CCA	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730768
126	NC_017728	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730768
127	NC_017728	GAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730768
128	NC_017728	GAA	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730768
129	NC_017728	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730768
130	NC_017728	GAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730768
131	NC_017728	TCG	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730768
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252	NC_017728	TAT	2	6	17029	17034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017728	ATA	2	6	17048	17053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_017728	ATT	2	6	17082	17087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017728	ATA	2	6	17297	17302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_017728	AAT	2	6	17641	17646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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