MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus anthracis str. H9401 plasmid BAP2

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017727	TGCTTC	2	12	279	290	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017727	ACTCTG	2	12	4855	4866	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386733769
3	NC_017727	TCATCT	2	12	7349	7360	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386733770
4	NC_017727	GTTACC	2	12	7803	7814	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386733772
5	NC_017727	AATTCA	2	12	15447	15458	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386733777
6	NC_017727	GAACAT	2	12	15858	15869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386733778
7	NC_017727	TTTCTT	2	12	18409	18420	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386733783
8	NC_017727	CCTGTT	2	12	19144	19155	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386733784
9	NC_017727	TCTTTG	2	12	21190	21201	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386733788
10	NC_017727	CATTTT	2	12	27054	27065	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386733795
11	NC_017727	TAAATT	2	12	28385	28396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017727	CATTCT	2	12	29570	29581	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386733798
13	NC_017727	TTTGCA	2	12	30300	30311	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386733799
14	NC_017727	TGTGTA	2	12	30986	30997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386733800
15	NC_017727	TTTTTC	2	12	34219	34230	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017727	CTTGAC	2	12	35477	35488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386733805
17	NC_017727	CAATAT	2	12	41661	41672	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386733815
18	NC_017727	GAATTA	2	12	43574	43585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386733817
19	NC_017727	TATAAT	2	12	46547	46558	50 %	50 %	0 %	0 %	386733821
20	NC_017727	TACCAA	2	12	47353	47364	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386733822
21	NC_017727	TAAAAT	2	12	48415	48426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017727	ATGAAT	2	12	48508	48519	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017727	ACTTTC	2	12	49152	49163	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386733825
24	NC_017727	TTGTTT	2	12	50075	50086	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386733825
25	NC_017727	TCCCTT	2	12	50190	50201	0 %	50 %	0 %	50 %	386733825
26	NC_017727	TTTTAT	2	12	50202	50213	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386733825
27	NC_017727	GATTTG	2	12	50343	50354	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386733825
28	NC_017727	TATACA	2	12	50415	50426	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017727	CATTCT	2	12	52870	52881	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386733828
30	NC_017727	TCTTTA	2	12	53571	53582	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386733828
31	NC_017727	TTTTCT	2	12	53915	53926	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386733829
32	NC_017727	TCGTCA	2	12	54933	54944	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386733829
33	NC_017727	TGCTTC	2	12	56468	56479	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386733831
34	NC_017727	ATTCAT	2	12	59663	59674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386733835
35	NC_017727	ACTTTG	2	12	62131	62142	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386733837
36	NC_017727	TTATAA	2	12	63988	63999	50 %	50 %	0 %	0 %	386733841
37	NC_017727	CAAATA	2	12	65382	65393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386733842
38	NC_017727	AATATG	2	12	66184	66195	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017727	TATAAA	2	12	70145	70156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017727	TTTTAA	2	12	70286	70297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017727	ATTTTT	2	12	73715	73726	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386733850
42	NC_017727	ATTGTA	2	12	75120	75131	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386733852
43	NC_017727	TGTTTC	2	12	75225	75236	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386733852
44	NC_017727	TTAAAT	2	12	79156	79167	50 %	50 %	0 %	0 %	386733857
45	NC_017727	TCCAAA	2	12	84791	84802	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017727	TTCCTA	2	12	85802	85813	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386733863
47	NC_017727	TACTTT	2	12	86672	86683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386733864
48	NC_017727	TCATAA	2	12	89282	89293	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386733866
49	NC_017727	TATTTA	2	12	89674	89685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017727	CATATC	2	12	90679	90690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386733868
51	NC_017727	CATCTT	2	12	91393	91404	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386733869
52	NC_017727	TCTCTT	2	12	92100	92111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386733869
53	NC_017727	TTTAAT	2	12	92510	92521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386733869
54	NC_017727	TTTCTT	2	12	94044	94055	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386733872
55	NC_017727	GTTTTC	2	12	94493	94504	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386733872

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.