MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. H9401 plasmid BAP2

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017727	TTTCT	2	10	1985	1994	0 %	80 %	0 %	20 %	386733765
2	NC_017727	CTTTT	2	10	2534	2543	0 %	80 %	0 %	20 %	386733765
3	NC_017727	TCATT	2	10	2591	2600	20 %	60 %	0 %	20 %	386733765
4	NC_017727	ACTTT	2	10	3401	3410	20 %	60 %	0 %	20 %	386733767
5	NC_017727	GAATC	2	10	5618	5627	40 %	20 %	20 %	20 %	386733769
6	NC_017727	ATCTT	2	10	8207	8216	20 %	60 %	0 %	20 %	386733774
7	NC_017727	GCTTC	2	10	8514	8523	0 %	40 %	20 %	40 %	386733774
8	NC_017727	CGCTT	2	10	8756	8765	0 %	40 %	20 %	40 %	386733774
9	NC_017727	TTCAC	2	10	8877	8886	20 %	40 %	0 %	40 %	386733774
10	NC_017727	TTTTC	2	10	9423	9432	0 %	80 %	0 %	20 %	386733774
11	NC_017727	TTCAT	2	10	11141	11150	20 %	60 %	0 %	20 %	386733775
12	NC_017727	TTTCT	2	10	11270	11279	0 %	80 %	0 %	20 %	386733775
13	NC_017727	TTCTT	2	10	13641	13650	0 %	80 %	0 %	20 %	386733776
14	NC_017727	ATTCA	2	10	15143	15152	40 %	40 %	0 %	20 %	386733777
15	NC_017727	TTTCA	2	10	17866	17875	20 %	60 %	0 %	20 %	386733783
16	NC_017727	AGAAA	2	10	18290	18299	80 %	0 %	20 %	0 %	386733783
17	NC_017727	TCTTG	2	10	19663	19672	0 %	60 %	20 %	20 %	386733784
18	NC_017727	CAAAT	2	10	22644	22653	60 %	20 %	0 %	20 %	386733789
19	NC_017727	AAAAT	2	10	25940	25949	80 %	20 %	0 %	0 %	386733792
20	NC_017727	AATTT	2	10	26259	26268	40 %	60 %	0 %	0 %	386733794
21	NC_017727	GATGT	2	10	26384	26393	20 %	40 %	40 %	0 %	386733794
22	NC_017727	TGCTT	2	10	28075	28084	0 %	60 %	20 %	20 %	386733796
23	NC_017727	CTTCT	2	10	28199	28208	0 %	60 %	0 %	40 %	386733796
24	NC_017727	TTTTC	2	10	29725	29734	0 %	80 %	0 %	20 %	386733798
25	NC_017727	TAACT	2	10	30413	30422	40 %	40 %	0 %	20 %	386733799
26	NC_017727	CAACA	2	10	31285	31294	60 %	0 %	0 %	40 %	386733801
27	NC_017727	ACTTT	2	10	33504	33513	20 %	60 %	0 %	20 %	386733802
28	NC_017727	CTTAT	2	10	34608	34617	20 %	60 %	0 %	20 %	386733804
29	NC_017727	GGGAT	2	10	35411	35420	20 %	20 %	60 %	0 %	386733805
30	NC_017727	AAACA	2	10	35592	35601	80 %	0 %	0 %	20 %	386733805
31	NC_017727	AAATC	2	10	38733	38742	60 %	20 %	0 %	20 %	386733810
32	NC_017727	TTTCC	2	10	39409	39418	0 %	60 %	0 %	40 %	386733811
33	NC_017727	TTTTG	2	10	41507	41516	0 %	80 %	20 %	0 %	386733815
34	NC_017727	ATAAG	2	10	41852	41861	60 %	20 %	20 %	0 %	386733816
35	NC_017727	GCAAA	2	10	43338	43347	60 %	0 %	20 %	20 %	386733817
36	NC_017727	TTCTT	2	10	44456	44465	0 %	80 %	0 %	20 %	386733818
37	NC_017727	CTTCT	2	10	45308	45317	0 %	60 %	0 %	40 %	386733819
38	NC_017727	GAAAA	2	10	46173	46182	80 %	0 %	20 %	0 %	386733820
39	NC_017727	ATCTT	2	10	49615	49624	20 %	60 %	0 %	20 %	386733825
40	NC_017727	ATTTC	2	10	50149	50158	20 %	60 %	0 %	20 %	386733825
41	NC_017727	TAAAA	2	10	51775	51784	80 %	20 %	0 %	0 %	386733826
42	NC_017727	TTTTA	2	10	53792	53801	20 %	80 %	0 %	0 %	386733828
43	NC_017727	ATTTT	2	10	56409	56418	20 %	80 %	0 %	0 %	386733831
44	NC_017727	GTTTT	2	10	58954	58963	0 %	80 %	20 %	0 %	386733834
45	NC_017727	TTTCA	2	10	59562	59571	20 %	60 %	0 %	20 %	386733835
46	NC_017727	TAAAA	2	10	64402	64411	80 %	20 %	0 %	0 %	386733841
47	NC_017727	TATTT	2	10	65346	65355	20 %	80 %	0 %	0 %	386733842
48	NC_017727	TAAAG	2	10	69054	69063	60 %	20 %	20 %	0 %	386733844
49	NC_017727	GAAAT	2	10	69514	69523	60 %	20 %	20 %	0 %	386733844
50	NC_017727	AAATC	2	10	72367	72376	60 %	20 %	0 %	20 %	386733849
51	NC_017727	CTTCA	2	10	73016	73025	20 %	40 %	0 %	40 %	386733850
52	NC_017727	AACAA	2	10	77792	77801	80 %	0 %	0 %	20 %	386733855
53	NC_017727	TAATA	2	10	78012	78021	60 %	40 %	0 %	0 %	386733855
54	NC_017727	ACAAT	2	10	79453	79462	60 %	20 %	0 %	20 %	386733857
55	NC_017727	CAAAA	2	10	82718	82727	80 %	0 %	0 %	20 %	386733860
56	NC_017727	CATTT	2	10	85056	85065	20 %	60 %	0 %	20 %	386733862
57	NC_017727	TAATG	2	10	86718	86727	40 %	40 %	20 %	0 %	386733864
58	NC_017727	ATGCA	2	10	89185	89194	40 %	20 %	20 %	20 %	386733866
59	NC_017727	CATTC	2	10	89960	89969	20 %	40 %	0 %	40 %	386733867
60	NC_017727	AAATA	2	10	89999	90008	80 %	20 %	0 %	0 %	386733867
61	NC_017727	TTCCG	2	10	91052	91061	0 %	40 %	20 %	40 %	386733868
62	NC_017727	ACTCA	2	10	94425	94434	40 %	20 %	0 %	40 %	386733872

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.