MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus anthracis str. H9401 plasmid BAP2

Total Repeats: 304

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017727	CTTC	2	8	86	93	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017727	TAAC	2	8	214	221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017727	CTTT	2	8	308	315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017727	ATGT	2	8	404	411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017727	TTTG	2	8	471	478	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017727	TTAA	2	8	895	902	50 %	50 %	0 %	0 %	386733763
7	NC_017727	TCTA	2	8	1229	1236	25 %	50 %	0 %	25 %	386733764
8	NC_017727	TTTC	2	8	1393	1400	0 %	75 %	0 %	25 %	386733764
9	NC_017727	AACT	2	8	1468	1475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017727	TTAA	2	8	1532	1539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017727	TTTC	2	8	1787	1794	0 %	75 %	0 %	25 %	386733765
12	NC_017727	ATTG	2	8	1860	1867	25 %	50 %	25 %	0 %	386733765
13	NC_017727	TAAA	2	8	2522	2529	75 %	25 %	0 %	0 %	386733765
14	NC_017727	TTTC	2	8	2668	2675	0 %	75 %	0 %	25 %	386733766
15	NC_017727	TCCT	2	8	2875	2882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017727	ATTT	2	8	2888	2895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017727	TCTT	2	8	3463	3470	0 %	75 %	0 %	25 %	386733767
18	NC_017727	ATTT	2	8	3562	3569	25 %	75 %	0 %	0 %	386733767
19	NC_017727	TGAC	2	8	3713	3720	25 %	25 %	25 %	25 %	386733768
20	NC_017727	CATC	2	8	3942	3949	25 %	25 %	0 %	50 %	386733768
21	NC_017727	AAAT	2	8	5962	5969	75 %	25 %	0 %	0 %	386733769
22	NC_017727	TTTC	2	8	6187	6194	0 %	75 %	0 %	25 %	386733769
23	NC_017727	CCAC	2	8	6866	6873	25 %	0 %	0 %	75 %	386733770
24	NC_017727	AAGT	2	8	7119	7126	50 %	25 %	25 %	0 %	386733770
25	NC_017727	TAAT	2	8	7730	7737	50 %	50 %	0 %	0 %	386733771
26	NC_017727	ATTG	2	8	8831	8838	25 %	50 %	25 %	0 %	386733774
27	NC_017727	ATTT	2	8	8953	8960	25 %	75 %	0 %	0 %	386733774
28	NC_017727	GTTT	2	8	9043	9050	0 %	75 %	25 %	0 %	386733774
29	NC_017727	GTTT	2	8	9133	9140	0 %	75 %	25 %	0 %	386733774
30	NC_017727	AGAT	2	8	9811	9818	50 %	25 %	25 %	0 %	386733774
31	NC_017727	ATTA	2	8	9827	9834	50 %	50 %	0 %	0 %	386733774
32	NC_017727	AAAC	2	8	9846	9853	75 %	0 %	0 %	25 %	386733774
33	NC_017727	TAAA	2	8	10087	10094	75 %	25 %	0 %	0 %	386733774
34	NC_017727	ATTT	2	8	10202	10209	25 %	75 %	0 %	0 %	386733774
35	NC_017727	TCGT	2	8	10233	10240	0 %	50 %	25 %	25 %	386733774
36	NC_017727	CTGT	2	8	10377	10384	0 %	50 %	25 %	25 %	386733774
37	NC_017727	TAAA	2	8	10445	10452	75 %	25 %	0 %	0 %	386733774
38	NC_017727	CCCT	2	8	10826	10833	0 %	25 %	0 %	75 %	386733774
39	NC_017727	ATTG	2	8	10836	10843	25 %	50 %	25 %	0 %	386733774
40	NC_017727	CATT	2	8	10878	10885	25 %	50 %	0 %	25 %	386733774
41	NC_017727	CTTT	3	12	11562	11573	0 %	75 %	0 %	25 %	386733775
42	NC_017727	CTTT	2	8	12208	12215	0 %	75 %	0 %	25 %	386733776
43	NC_017727	TTTA	2	8	12449	12456	25 %	75 %	0 %	0 %	386733776
44	NC_017727	TTGA	2	8	13099	13106	25 %	50 %	25 %	0 %	386733776
45	NC_017727	ATCA	2	8	13127	13134	50 %	25 %	0 %	25 %	386733776
46	NC_017727	GTCT	2	8	13265	13272	0 %	50 %	25 %	25 %	386733776
47	NC_017727	ATTC	2	8	13537	13544	25 %	50 %	0 %	25 %	386733776
48	NC_017727	CTTT	2	8	13977	13984	0 %	75 %	0 %	25 %	386733777
49	NC_017727	TCTT	2	8	13986	13993	0 %	75 %	0 %	25 %	386733777
50	NC_017727	TCTT	2	8	14325	14332	0 %	75 %	0 %	25 %	386733777
51	NC_017727	TGAT	2	8	14384	14391	25 %	50 %	25 %	0 %	386733777
52	NC_017727	AATT	2	8	14462	14469	50 %	50 %	0 %	0 %	386733777
53	NC_017727	CTCA	2	8	14750	14757	25 %	25 %	0 %	50 %	386733777
54	NC_017727	TTTC	2	8	16849	16856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017727	CCCT	2	8	16857	16864	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_017727	ATTA	2	8	17048	17055	50 %	50 %	0 %	0 %	386733782
57	NC_017727	GCGA	2	8	18081	18088	25 %	0 %	50 %	25 %	386733783
58	NC_017727	TTTC	2	8	18167	18174	0 %	75 %	0 %	25 %	386733783
59	NC_017727	AATC	2	8	19407	19414	50 %	25 %	0 %	25 %	386733784
60	NC_017727	TAAT	2	8	19535	19542	50 %	50 %	0 %	0 %	386733784
61	NC_017727	CTTT	2	8	19824	19831	0 %	75 %	0 %	25 %	386733784
62	NC_017727	TACT	2	8	19845	19852	25 %	50 %	0 %	25 %	386733785
63	NC_017727	CTCG	2	8	20081	20088	0 %	25 %	25 %	50 %	386733785
64	NC_017727	CAAA	2	8	20231	20238	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017727	ATTG	2	8	20310	20317	25 %	50 %	25 %	0 %	386733786
66	NC_017727	TAAA	2	8	21215	21222	75 %	25 %	0 %	0 %	386733788
67	NC_017727	AATC	2	8	21362	21369	50 %	25 %	0 %	25 %	386733788
68	NC_017727	TTTA	2	8	21672	21679	25 %	75 %	0 %	0 %	386733788
69	NC_017727	CTTG	2	8	21840	21847	0 %	50 %	25 %	25 %	386733788
70	NC_017727	ACCA	2	8	22169	22176	50 %	0 %	0 %	50 %	386733788
71	NC_017727	TCAC	2	8	22437	22444	25 %	25 %	0 %	50 %	386733789
72	NC_017727	ACCA	2	8	22445	22452	50 %	0 %	0 %	50 %	386733789
73	NC_017727	ATTT	2	8	22598	22605	25 %	75 %	0 %	0 %	386733789
74	NC_017727	GTAA	2	8	22778	22785	50 %	25 %	25 %	0 %	386733789
75	NC_017727	CAAG	2	8	23335	23342	50 %	0 %	25 %	25 %	386733789
76	NC_017727	GAAT	2	8	23405	23412	50 %	25 %	25 %	0 %	386733789
77	NC_017727	GCAT	2	8	23475	23482	25 %	25 %	25 %	25 %	386733789
78	NC_017727	TTTC	2	8	23616	23623	0 %	75 %	0 %	25 %	386733789
79	NC_017727	GTTT	2	8	24685	24692	0 %	75 %	25 %	0 %	386733789
80	NC_017727	AAGT	2	8	24911	24918	50 %	25 %	25 %	0 %	386733789
81	NC_017727	TTTG	2	8	25264	25271	0 %	75 %	25 %	0 %	386733790
82	NC_017727	TTCC	2	8	25440	25447	0 %	50 %	0 %	50 %	386733790
83	NC_017727	ACCT	2	8	25664	25671	25 %	25 %	0 %	50 %	386733791
84	NC_017727	GTTT	2	8	25926	25933	0 %	75 %	25 %	0 %	386733792
85	NC_017727	AAAC	2	8	26017	26024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017727	GAAA	2	8	26098	26105	75 %	0 %	25 %	0 %	386733793
87	NC_017727	ATTT	2	8	26481	26488	25 %	75 %	0 %	0 %	386733794
88	NC_017727	CATT	2	8	26590	26597	25 %	50 %	0 %	25 %	386733794
89	NC_017727	ATGA	2	8	26910	26917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017727	CATT	2	8	26918	26925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017727	ATCT	2	8	26940	26947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017727	AAAT	2	8	26979	26986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017727	ACTA	2	8	27187	27194	50 %	25 %	0 %	25 %	386733795
94	NC_017727	AGAA	2	8	27280	27287	75 %	0 %	25 %	0 %	386733795
95	NC_017727	TCGG	2	8	27637	27644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017727	TGAT	2	8	29312	29319	25 %	50 %	25 %	0 %	386733797
97	NC_017727	TTAT	2	8	29782	29789	25 %	75 %	0 %	0 %	386733798
98	NC_017727	CTTG	2	8	30338	30345	0 %	50 %	25 %	25 %	386733799
99	NC_017727	TAGT	2	8	30559	30566	25 %	50 %	25 %	0 %	386733799
100	NC_017727	CATT	2	8	30645	30652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017727	TCTT	2	8	31633	31640	0 %	75 %	0 %	25 %	386733801
102	NC_017727	AAAG	2	8	32733	32740	75 %	0 %	25 %	0 %	386733802
103	NC_017727	TGTT	2	8	32771	32778	0 %	75 %	25 %	0 %	386733802
104	NC_017727	CTGT	2	8	33964	33971	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017727	AAAT	2	8	34153	34160	75 %	25 %	0 %	0 %	386733803
106	NC_017727	ACTT	2	8	34931	34938	25 %	50 %	0 %	25 %	386733804
107	NC_017727	ATTT	2	8	35228	35235	25 %	75 %	0 %	0 %	386733804
108	NC_017727	AAAG	2	8	35452	35459	75 %	0 %	25 %	0 %	386733805
109	NC_017727	TACA	2	8	36047	36054	50 %	25 %	0 %	25 %	386733806
110	NC_017727	AAGA	2	8	36425	36432	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017727	AGTA	2	8	36465	36472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017727	AGAA	2	8	36715	36722	75 %	0 %	25 %	0 %	386733808
113	NC_017727	CTTC	2	8	37277	37284	0 %	50 %	0 %	50 %	386733809
114	NC_017727	AACA	2	8	37674	37681	75 %	0 %	0 %	25 %	386733810
115	NC_017727	ATGA	2	8	38481	38488	50 %	25 %	25 %	0 %	386733810
116	NC_017727	TTTG	2	8	39443	39450	0 %	75 %	25 %	0 %	386733811
117	NC_017727	CTTT	2	8	39905	39912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017727	ATAA	2	8	40421	40428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017727	AGTA	2	8	41866	41873	50 %	25 %	25 %	0 %	386733816
120	NC_017727	ATAG	2	8	41890	41897	50 %	25 %	25 %	0 %	386733816
121	NC_017727	TAAA	2	8	42159	42166	75 %	25 %	0 %	0 %	386733816
122	NC_017727	TACT	2	8	42180	42187	25 %	50 %	0 %	25 %	386733816
123	NC_017727	GTTA	2	8	42322	42329	25 %	50 %	25 %	0 %	386733816
124	NC_017727	ACAA	2	8	42652	42659	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017727	TAGT	2	8	43152	43159	25 %	50 %	25 %	0 %	386733817
126	NC_017727	AAAG	2	8	43237	43244	75 %	0 %	25 %	0 %	386733817
127	NC_017727	AATT	2	8	43590	43597	50 %	50 %	0 %	0 %	386733817
128	NC_017727	AAAT	2	8	43666	43673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017727	TATT	2	8	44034	44041	25 %	75 %	0 %	0 %	386733818
130	NC_017727	AGGA	2	8	44401	44408	50 %	0 %	50 %	0 %	386733818
131	NC_017727	TCGC	2	8	44448	44455	0 %	25 %	25 %	50 %	386733818
132	NC_017727	GGAG	2	8	44477	44484	25 %	0 %	75 %	0 %	386733818
133	NC_017727	TTCA	2	8	44595	44602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017727	AATA	2	8	44623	44630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017727	CAAA	2	8	45318	45325	75 %	0 %	0 %	25 %	386733819
136	NC_017727	ATCA	2	8	45338	45345	50 %	25 %	0 %	25 %	386733819
137	NC_017727	AGGC	2	8	45461	45468	25 %	0 %	50 %	25 %	386733819
138	NC_017727	ATGA	2	8	47068	47075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017727	ATTA	2	8	47223	47230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017727	TATT	2	8	47409	47416	25 %	75 %	0 %	0 %	386733822
141	NC_017727	TACT	2	8	47498	47505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017727	TCCT	2	8	47924	47931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017727	AATA	2	8	48059	48066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.