MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus anthracis str. H9401 plasmid BAP2

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017727	CTTC	2	8	86	93	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017727	TAAC	2	8	214	221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017727	CTTT	2	8	308	315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017727	ATGT	2	8	404	411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017727	TTTG	2	8	471	478	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017727	AACT	2	8	1468	1475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017727	TTAA	2	8	1532	1539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017727	TCCT	2	8	2875	2882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017727	ATTT	2	8	2888	2895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017727	TTTC	2	8	16849	16856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017727	CCCT	2	8	16857	16864	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_017727	CAAA	2	8	20231	20238	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017727	AAAC	2	8	26017	26024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017727	ATGA	2	8	26910	26917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017727	CATT	2	8	26918	26925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017727	ATCT	2	8	26940	26947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017727	AAAT	2	8	26979	26986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017727	TCGG	2	8	27637	27644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017727	CATT	2	8	30645	30652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017727	CTGT	2	8	33964	33971	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017727	AAGA	2	8	36425	36432	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017727	AGTA	2	8	36465	36472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017727	CTTT	2	8	39905	39912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017727	ATAA	2	8	40421	40428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017727	ACAA	2	8	42652	42659	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017727	AAAT	2	8	43666	43673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017727	TTCA	2	8	44595	44602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017727	AATA	2	8	44623	44630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017727	ATGA	2	8	47068	47075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017727	ATTA	2	8	47223	47230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017727	TACT	2	8	47498	47505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017727	TCCT	2	8	47924	47931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017727	AATA	2	8	48059	48066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017727	TTCA	2	8	48482	48489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017727	CTAA	2	8	48559	48566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017727	CCCA	2	8	48623	48630	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_017727	TAAA	2	8	48863	48870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017727	AATT	2	8	50453	50460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017727	TTTG	2	8	50473	50480	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017727	ATTA	2	8	50577	50584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017727	ATAA	2	8	50698	50705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017727	TCTT	2	8	50877	50884	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017727	TTTC	2	8	51032	51039	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017727	AAAT	2	8	51963	51970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017727	TTCT	2	8	57260	57267	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017727	TGTT	2	8	57381	57388	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017727	TCAA	2	8	58067	58074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017727	TATT	2	8	58182	58189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017727	AATT	2	8	58302	58309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017727	AAAG	2	8	58423	58430	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017727	CTAT	2	8	59779	59786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017727	TAAA	2	8	59910	59917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017727	CTTT	2	8	59991	59998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017727	ACCA	2	8	60131	60138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017727	CATT	2	8	61246	61253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017727	AATT	2	8	62289	62296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017727	AAAC	2	8	64491	64498	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017727	ATAA	2	8	64594	64601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017727	TGGT	2	8	64678	64685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017727	CTAC	2	8	65610	65617	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017727	AAAC	2	8	66029	66036	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017727	AAAT	2	8	66112	66119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017727	AGTA	2	8	66176	66183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017727	TAGA	2	8	66268	66275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017727	ATGT	2	8	66599	66606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017727	CAAA	2	8	66839	66846	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017727	AATA	2	8	66935	66942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017727	GGAA	2	8	67393	67400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017727	TTTA	2	8	67470	67477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017727	GTTT	2	8	67725	67732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017727	AAAT	2	8	68394	68401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017727	ATAA	2	8	70052	70059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017727	CCTT	2	8	70112	70119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017727	TTAA	2	8	70304	70311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017727	TTAT	2	8	71446	71453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017727	ATTA	2	8	71490	71497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017727	GATG	2	8	72589	72596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017727	TAAA	2	8	72622	72629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017727	GTTT	2	8	72725	72732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017727	AATA	2	8	76304	76311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017727	AACA	2	8	80727	80734	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017727	TCTT	2	8	80768	80775	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017727	ATAA	2	8	81410	81417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017727	AGCA	2	8	81762	81769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017727	TTGT	2	8	83497	83504	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017727	TTAT	2	8	83653	83660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017727	TAAA	2	8	83661	83668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017727	ATTT	2	8	85529	85536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017727	AATC	2	8	86161	86168	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017727	TTGA	2	8	89689	89696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.