MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus anthracis str. H9401 plasmid BAP1

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017726	ATTAT	2	10	560	569	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017726	TTTCC	2	10	1674	1683	0 %	60 %	0 %	40 %	386733563
3	NC_017726	TAAAA	2	10	1833	1842	80 %	20 %	0 %	0 %	386733564
4	NC_017726	ATGAT	2	10	2234	2243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017726	CGGAA	2	10	2482	2491	40 %	0 %	40 %	20 %	386733565
6	NC_017726	AAGAA	2	10	2886	2895	80 %	0 %	20 %	0 %	386733566
7	NC_017726	CATAC	2	10	2904	2913	40 %	20 %	0 %	40 %	386733566
8	NC_017726	TTTAA	2	10	4193	4202	40 %	60 %	0 %	0 %	386733568
9	NC_017726	GCATT	2	10	6351	6360	20 %	40 %	20 %	20 %	386733570
10	NC_017726	TCTTT	2	10	7400	7409	0 %	80 %	0 %	20 %	386733571
11	NC_017726	TCCAT	2	10	7720	7729	20 %	40 %	0 %	40 %	386733571
12	NC_017726	TCTTT	2	10	8112	8121	0 %	80 %	0 %	20 %	386733571
13	NC_017726	CATTC	2	10	9842	9851	20 %	40 %	0 %	40 %	386733572
14	NC_017726	CTTTT	2	10	11109	11118	0 %	80 %	0 %	20 %	386733572
15	NC_017726	AGCAA	2	10	11571	11580	60 %	0 %	20 %	20 %	386733572
16	NC_017726	TAAAA	2	10	11688	11697	80 %	20 %	0 %	0 %	386733572
17	NC_017726	ATTTA	2	10	11733	11742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017726	TTCGG	2	10	13419	13428	0 %	40 %	40 %	20 %	386733576
19	NC_017726	TGTTA	2	10	13783	13792	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017726	CACAA	2	10	13956	13965	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017726	TTTAA	2	10	15925	15934	40 %	60 %	0 %	0 %	386733578
22	NC_017726	TTCTG	2	10	16374	16383	0 %	60 %	20 %	20 %	386733578
23	NC_017726	AATTA	2	10	18239	18248	60 %	40 %	0 %	0 %	386733579
24	NC_017726	CTCTG	2	10	18666	18675	0 %	40 %	20 %	40 %	386733579
25	NC_017726	CTCTT	2	10	20360	20369	0 %	60 %	0 %	40 %	386733580
26	NC_017726	AAATA	2	10	24020	24029	80 %	20 %	0 %	0 %	386733584
27	NC_017726	CTACT	2	10	24109	24118	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017726	TATAA	2	10	26761	26770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017726	ACACT	2	10	26908	26917	40 %	20 %	0 %	40 %	386733588
30	NC_017726	ATTGC	2	10	26975	26984	20 %	40 %	20 %	20 %	386733588
31	NC_017726	TCCAA	2	10	27910	27919	40 %	20 %	0 %	40 %	386733588
32	NC_017726	GAAAA	2	10	28071	28080	80 %	0 %	20 %	0 %	386733588
33	NC_017726	TTTTC	2	10	31129	31138	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017726	TTGTT	2	10	31989	31998	0 %	80 %	20 %	0 %	386733593
35	NC_017726	TATCC	2	10	32763	32772	20 %	40 %	0 %	40 %	386733593
36	NC_017726	CCTTC	2	10	33931	33940	0 %	40 %	0 %	60 %	386733594
37	NC_017726	ATTTA	2	10	34539	34548	40 %	60 %	0 %	0 %	386733595
38	NC_017726	TTTCC	2	10	36374	36383	0 %	60 %	0 %	40 %	386733599
39	NC_017726	AATTA	2	10	37139	37148	60 %	40 %	0 %	0 %	386733600
40	NC_017726	AAATT	2	10	38679	38688	60 %	40 %	0 %	0 %	386733602
41	NC_017726	AGTAA	2	10	38992	39001	60 %	20 %	20 %	0 %	386733602
42	NC_017726	CTTGG	2	10	40728	40737	0 %	40 %	40 %	20 %	386733604
43	NC_017726	ATTTC	2	10	44636	44645	20 %	60 %	0 %	20 %	386733608
44	NC_017726	CATCA	2	10	44906	44915	40 %	20 %	0 %	40 %	386733609
45	NC_017726	TCTTT	2	10	45475	45484	0 %	80 %	0 %	20 %	386733609
46	NC_017726	GAAAT	2	10	46772	46781	60 %	20 %	20 %	0 %	386733611
47	NC_017726	AAAAC	2	10	47817	47826	80 %	0 %	0 %	20 %	386733612
48	NC_017726	GAAAA	2	10	48015	48024	80 %	0 %	20 %	0 %	386733612
49	NC_017726	ATTTT	2	10	49922	49931	20 %	80 %	0 %	0 %	386733613
50	NC_017726	CTAAG	2	10	50766	50775	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017726	TTAAC	2	10	50952	50961	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017726	TCATC	2	10	53224	53233	20 %	40 %	0 %	40 %	386733618
53	NC_017726	TACGA	2	10	53453	53462	40 %	20 %	20 %	20 %	386733618
54	NC_017726	AGTAA	2	10	53694	53703	60 %	20 %	20 %	0 %	386733618
55	NC_017726	TGATT	2	10	55957	55966	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017726	CTTCT	2	10	56257	56266	0 %	60 %	0 %	40 %	386733620
57	NC_017726	CTCTT	2	10	58221	58230	0 %	60 %	0 %	40 %	386733621
58	NC_017726	TTGAT	2	10	58308	58317	20 %	60 %	20 %	0 %	386733621
59	NC_017726	AAAAT	2	10	59489	59498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017726	AACAA	2	10	60449	60458	80 %	0 %	0 %	20 %	386733623
61	NC_017726	GTATA	2	10	60786	60795	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017726	TGAAT	2	10	61262	61271	40 %	40 %	20 %	0 %	386733624
63	NC_017726	CTATG	2	10	63594	63603	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017726	AGTAA	2	10	64812	64821	60 %	20 %	20 %	0 %	386733626
65	NC_017726	GTGAT	2	10	65228	65237	20 %	40 %	40 %	0 %	386733627
66	NC_017726	AAAAG	2	10	66560	66569	80 %	0 %	20 %	0 %	386733627
67	NC_017726	TAAAT	2	10	68832	68841	60 %	40 %	0 %	0 %	386733630
68	NC_017726	ATATA	2	10	68970	68979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017726	TAGAT	2	10	70423	70432	40 %	40 %	20 %	0 %	386733631
70	NC_017726	GAAAA	2	10	70601	70610	80 %	0 %	20 %	0 %	386733631
71	NC_017726	AAAAG	2	10	70744	70753	80 %	0 %	20 %	0 %	386733631
72	NC_017726	TTTCA	2	10	71735	71744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017726	ACATG	2	10	71766	71775	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017726	AAATC	2	10	72345	72354	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017726	AAGAA	2	10	73540	73549	80 %	0 %	20 %	0 %	386733635
76	NC_017726	AAAGA	2	10	74380	74389	80 %	0 %	20 %	0 %	386733637
77	NC_017726	GAAAG	2	10	74958	74967	60 %	0 %	40 %	0 %	386733637
78	NC_017726	TAGTA	2	10	75649	75658	40 %	40 %	20 %	0 %	386733638
79	NC_017726	AAAGA	2	10	76931	76940	80 %	0 %	20 %	0 %	386733639
80	NC_017726	ATTGC	2	10	77181	77190	20 %	40 %	20 %	20 %	386733639
81	NC_017726	AAATG	2	10	77699	77708	60 %	20 %	20 %	0 %	386733642
82	NC_017726	TCAAA	2	10	79629	79638	60 %	20 %	0 %	20 %	386733644
83	NC_017726	TAACA	2	10	83305	83314	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017726	TTGTG	2	10	83394	83403	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017726	TAATT	2	10	86653	86662	40 %	60 %	0 %	0 %	386733651
86	NC_017726	AATGG	2	10	86943	86952	40 %	20 %	40 %	0 %	386733652
87	NC_017726	GATTT	2	10	87347	87356	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017726	TATAA	2	10	87590	87599	60 %	40 %	0 %	0 %	386733654
89	NC_017726	ATTTA	2	10	89057	89066	40 %	60 %	0 %	0 %	386733656
90	NC_017726	GAAAA	2	10	89445	89454	80 %	0 %	20 %	0 %	386733657
91	NC_017726	TTTAA	2	10	91320	91329	40 %	60 %	0 %	0 %	386733657
92	NC_017726	AAAGA	2	10	92529	92538	80 %	0 %	20 %	0 %	386733658
93	NC_017726	GTTTT	2	10	98725	98734	0 %	80 %	20 %	0 %	386733663
94	NC_017726	TAAAG	2	10	102477	102486	60 %	20 %	20 %	0 %	386733668
95	NC_017726	AGTAA	2	10	103010	103019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017726	TTTAA	2	10	104275	104284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017726	ATTTT	2	10	104325	104334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017726	ACAGT	2	10	104861	104870	40 %	20 %	20 %	20 %	386733671
99	NC_017726	GAATA	2	10	105906	105915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017726	TATTT	2	10	106898	106907	20 %	80 %	0 %	0 %	386733673
101	NC_017726	TGAAT	2	10	107537	107546	40 %	40 %	20 %	0 %	386733673
102	NC_017726	AAAAG	2	10	109220	109229	80 %	0 %	20 %	0 %	386733674
103	NC_017726	GTGAT	2	10	109509	109518	20 %	40 %	40 %	0 %	386733674
104	NC_017726	TTGGT	2	10	110649	110658	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017726	AATAA	2	10	110796	110805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017726	ATTCA	2	10	110833	110842	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017726	ATTAT	2	10	111031	111040	40 %	60 %	0 %	0 %	386733676
108	NC_017726	AAAAT	3	15	111242	111256	80 %	20 %	0 %	0 %	386733677
109	NC_017726	TATAA	2	10	115173	115182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017726	TCATT	2	10	115187	115196	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017726	TAATA	2	10	115591	115600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017726	ATTTA	2	10	116073	116082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017726	CCTTG	2	10	118792	118801	0 %	40 %	20 %	40 %	386733687
114	NC_017726	ATGAA	2	10	120201	120210	60 %	20 %	20 %	0 %	386733689
115	NC_017726	ATTGG	2	10	121695	121704	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017726	TAAAA	2	10	122560	122569	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017726	GAAAA	2	10	123062	123071	80 %	0 %	20 %	0 %	386733693
118	NC_017726	TACAA	2	10	123990	123999	60 %	20 %	0 %	20 %	386733693
119	NC_017726	AAAGG	2	10	124888	124897	60 %	0 %	40 %	0 %	386733693
120	NC_017726	TAAAA	2	10	125700	125709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017726	CTTTC	2	10	126607	126616	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017726	CTTTT	2	10	126695	126704	0 %	80 %	0 %	20 %	386733698
123	NC_017726	ATGTA	2	10	128459	128468	40 %	40 %	20 %	0 %	386733699
124	NC_017726	ATTTA	2	10	129939	129948	40 %	60 %	0 %	0 %	386733700
125	NC_017726	AATTC	2	10	130158	130167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017726	TATTT	2	10	130168	130177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017726	TTAAA	2	10	130925	130934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017726	ATTAA	2	10	131451	131460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017726	AATTC	2	10	133196	133205	40 %	40 %	0 %	20 %	386733704
130	NC_017726	TTAAT	2	10	134383	134392	40 %	60 %	0 %	0 %	386733705
131	NC_017726	TATTT	2	10	135797	135806	20 %	80 %	0 %	0 %	386733705
132	NC_017726	CAATT	2	10	136475	136484	40 %	40 %	0 %	20 %	386733706
133	NC_017726	CAAAA	2	10	136655	136664	80 %	0 %	0 %	20 %	386733706
134	NC_017726	AAATT	2	10	137799	137808	60 %	40 %	0 %	0 %	386733707
135	NC_017726	ATTAT	2	10	139895	139904	40 %	60 %	0 %	0 %	386733709
136	NC_017726	ATCTT	2	10	142067	142076	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017726	TAAAA	2	10	142858	142867	80 %	20 %	0 %	0 %	386733713
138	NC_017726	AAATT	2	10	143274	143283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017726	ACAAA	2	10	143394	143403	80 %	0 %	0 %	20 %	386733714
140	NC_017726	TATAT	2	10	143728	143737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017726	AATAT	2	10	143761	143770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017726	TCTTT	2	10	180934	180943	0 %	80 %	0 %	20 %	386733761
184	NC_017726	TCACC	2	10	181370	181379	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
185	NC_017726	AAAGA	2	10	181524	181533	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.