MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus anthracis str. H9401 plasmid BAP1

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017726	ATTAT	2	10	560	569	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017726	ATGAT	2	10	2234	2243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017726	ATTTA	2	10	11733	11742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017726	TGTTA	2	10	13783	13792	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017726	CACAA	2	10	13956	13965	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017726	CTACT	2	10	24109	24118	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017726	TATAA	2	10	26761	26770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017726	TTTTC	2	10	31129	31138	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017726	CTAAG	2	10	50766	50775	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017726	TTAAC	2	10	50952	50961	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017726	TGATT	2	10	55957	55966	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017726	AAAAT	2	10	59489	59498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017726	GTATA	2	10	60786	60795	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017726	CTATG	2	10	63594	63603	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017726	ATATA	2	10	68970	68979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017726	TTTCA	2	10	71735	71744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017726	ACATG	2	10	71766	71775	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017726	AAATC	2	10	72345	72354	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017726	TAACA	2	10	83305	83314	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017726	TTGTG	2	10	83394	83403	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017726	GATTT	2	10	87347	87356	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017726	AGTAA	2	10	103010	103019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017726	TTTAA	2	10	104275	104284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017726	ATTTT	2	10	104325	104334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017726	GAATA	2	10	105906	105915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017726	TTGGT	2	10	110649	110658	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017726	AATAA	2	10	110796	110805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017726	ATTCA	2	10	110833	110842	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017726	TATAA	2	10	115173	115182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017726	TCATT	2	10	115187	115196	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017726	TAATA	2	10	115591	115600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017726	ATTTA	2	10	116073	116082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017726	ATTGG	2	10	121695	121704	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017726	TAAAA	2	10	122560	122569	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017726	TAAAA	2	10	125700	125709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017726	CTTTC	2	10	126607	126616	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017726	AATTC	2	10	130158	130167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017726	TATTT	2	10	130168	130177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017726	TTAAA	2	10	130925	130934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017726	ATTAA	2	10	131451	131460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017726	ATCTT	2	10	142067	142076	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017726	AAATT	2	10	143274	143283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017726	TATAT	2	10	143728	143737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017726	AATAT	2	10	143761	143770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017726	AATTT	2	10	143772	143781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017726	TAAGG	2	10	146444	146453	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017726	TAATT	2	10	146807	146816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017726	TACTT	2	10	147481	147490	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017726	TCTTT	2	10	147686	147695	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017726	TTCAA	2	10	148668	148677	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017726	AGTAA	2	10	151944	151953	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017726	AGTAG	2	10	154295	154304	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017726	ATTCT	2	10	159084	159093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017726	TAAAT	2	10	163314	163323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017726	TTTAG	2	10	166579	166588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017726	GTTTA	2	10	167944	167953	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017726	TATAA	2	10	174062	174071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017726	AAACA	2	10	174076	174085	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017726	AAATA	2	10	174169	174178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017726	TTATT	2	10	174202	174211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017726	CCTAT	2	10	180514	180523	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017726	TCACC	2	10	181370	181379	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_017726	AAAGA	2	10	181524	181533	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.