MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid cp26

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017725	ATTTTT	2	12	2064	2075	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386854246
2	NC_017725	AATTTA	2	12	6104	6115	50 %	50 %	0 %	0 %	386854251
3	NC_017725	AAAATT	2	12	6406	6417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854251
4	NC_017725	AGAAAA	2	12	6752	6763	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386854252
5	NC_017725	ATTGAA	2	12	7113	7124	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386854252
6	NC_017725	TAAAAT	2	12	7477	7488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854252
7	NC_017725	TTAAAA	2	12	10054	10065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854258
8	NC_017725	TAATTT	2	12	10883	10894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386854259
9	NC_017725	TTTTAT	2	12	11532	11543	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386854260
10	NC_017725	AATTTA	2	12	13547	13558	50 %	50 %	0 %	0 %	386854262
11	NC_017725	ATTCCT	2	12	15441	15452	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386854264
12	NC_017725	CCTGGG	2	12	16032	16043	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386854265
13	NC_017725	TTTATT	2	12	17508	17519	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386854266
14	NC_017725	CAATAC	2	12	19128	19139	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386854267
15	NC_017725	AAATAA	2	12	20347	20358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386854268
16	NC_017725	AAATTT	2	12	22235	22246	50 %	50 %	0 %	0 %	386854270
17	NC_017725	ATTAAA	2	12	22890	22901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386854271
18	NC_017725	AAAATA	2	12	24538	24549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386854273
19	NC_017725	ATCTAT	2	12	25450	25461	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386854274

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.