MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid cp26

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017725	TAAAA	2	10	3658	3667	80 %	20 %	0 %	0 %	386854247
2	NC_017725	TAAAA	2	10	3884	3893	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017725	TTTTA	2	10	4230	4239	20 %	80 %	0 %	0 %	386854248
4	NC_017725	AAAAT	2	10	4719	4728	80 %	20 %	0 %	0 %	386854250
5	NC_017725	ATTAG	2	10	4967	4976	40 %	40 %	20 %	0 %	386854250
6	NC_017725	GAAAA	2	10	5253	5262	80 %	0 %	20 %	0 %	386854250
7	NC_017725	AAATA	2	10	6121	6130	80 %	20 %	0 %	0 %	386854251
8	NC_017725	TAAAA	2	10	6208	6217	80 %	20 %	0 %	0 %	386854251
9	NC_017725	ATTTT	2	10	7275	7284	20 %	80 %	0 %	0 %	386854252
10	NC_017725	ACTTT	2	10	7647	7656	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017725	TATTG	2	10	8579	8588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017725	GAAAT	2	10	10019	10028	60 %	20 %	20 %	0 %	386854258
13	NC_017725	TAAAA	2	10	10368	10377	80 %	20 %	0 %	0 %	386854258
14	NC_017725	ATTTA	2	10	11988	11997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017725	ATCTA	2	10	12076	12085	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017725	TTTAG	2	10	12289	12298	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017725	ATCTT	2	10	12856	12865	20 %	60 %	0 %	20 %	386854262
18	NC_017725	ATATT	2	10	13227	13236	40 %	60 %	0 %	0 %	386854262
19	NC_017725	GATTT	2	10	14070	14079	20 %	60 %	20 %	0 %	386854262
20	NC_017725	TTTAT	2	10	14112	14121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017725	AAAAT	2	10	14131	14140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017725	TAAAA	2	10	14209	14218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017725	TTTAA	2	10	16986	16995	40 %	60 %	0 %	0 %	386854265
24	NC_017725	GAAAA	2	10	17421	17430	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017725	ATCAA	2	10	18111	18120	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017725	ATTTA	2	10	18306	18315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017725	ACAAT	2	10	19565	19574	60 %	20 %	0 %	20 %	386854267
28	NC_017725	TTTTA	2	10	19938	19947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017725	TAAAT	2	10	20007	20016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017725	TCTTT	2	10	20097	20106	0 %	80 %	0 %	20 %	386854268
31	NC_017725	TAAAT	2	10	20734	20743	60 %	40 %	0 %	0 %	386854268
32	NC_017725	ATTTT	2	10	21947	21956	20 %	80 %	0 %	0 %	386854269
33	NC_017725	TTATA	2	10	22459	22468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017725	AAGAT	2	10	23389	23398	60 %	20 %	20 %	0 %	386854272
35	NC_017725	TTTTA	2	10	23599	23608	20 %	80 %	0 %	0 %	386854272
36	NC_017725	TAAAG	2	10	23786	23795	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017725	ATAAA	2	10	24103	24112	80 %	20 %	0 %	0 %	386854273
38	NC_017725	AAATT	2	10	25246	25255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017725	GAAGA	2	10	26771	26780	60 %	0 %	40 %	0 %	386854275

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.