MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid cp26

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017725	CTTT	2	8	175	182	0 %	75 %	0 %	25 %	386854244
2	NC_017725	AAAT	2	8	619	626	75 %	25 %	0 %	0 %	386854245
3	NC_017725	AATA	2	8	1288	1295	75 %	25 %	0 %	0 %	386854246
4	NC_017725	AATT	2	8	1444	1451	50 %	50 %	0 %	0 %	386854246
5	NC_017725	AATT	2	8	1684	1691	50 %	50 %	0 %	0 %	386854246
6	NC_017725	TAAG	2	8	2985	2992	50 %	25 %	25 %	0 %	386854247
7	NC_017725	CTGC	2	8	3131	3138	0 %	25 %	25 %	50 %	386854247
8	NC_017725	GCGG	2	8	3224	3231	0 %	0 %	75 %	25 %	386854247
9	NC_017725	AATG	2	8	4601	4608	50 %	25 %	25 %	0 %	386854249
10	NC_017725	GAAA	2	8	4678	4685	75 %	0 %	25 %	0 %	386854250
11	NC_017725	ATAA	2	8	5057	5064	75 %	25 %	0 %	0 %	386854250
12	NC_017725	CTTT	2	8	5160	5167	0 %	75 %	0 %	25 %	386854250
13	NC_017725	TAAA	2	8	5767	5774	75 %	25 %	0 %	0 %	386854250
14	NC_017725	TTTA	2	8	5789	5796	25 %	75 %	0 %	0 %	386854251
15	NC_017725	ACTT	2	8	6151	6158	25 %	50 %	0 %	25 %	386854251
16	NC_017725	AAAT	2	8	6802	6809	75 %	25 %	0 %	0 %	386854252
17	NC_017725	AGAA	2	8	8263	8270	75 %	0 %	25 %	0 %	386854254
18	NC_017725	GAAA	2	8	8285	8292	75 %	0 %	25 %	0 %	386854254
19	NC_017725	CAAG	2	8	9277	9284	50 %	0 %	25 %	25 %	386854256
20	NC_017725	GAAA	2	8	10128	10135	75 %	0 %	25 %	0 %	386854258
21	NC_017725	AATT	2	8	10274	10281	50 %	50 %	0 %	0 %	386854258
22	NC_017725	TTTA	2	8	12562	12569	25 %	75 %	0 %	0 %	386854262
23	NC_017725	TGAA	2	8	12954	12961	50 %	25 %	25 %	0 %	386854262
24	NC_017725	GAAA	2	8	13916	13923	75 %	0 %	25 %	0 %	386854262
25	NC_017725	ATTT	2	8	14508	14515	25 %	75 %	0 %	0 %	386854263
26	NC_017725	TGCT	2	8	14531	14538	0 %	50 %	25 %	25 %	386854263
27	NC_017725	ATTA	2	8	15746	15753	50 %	50 %	0 %	0 %	386854265
28	NC_017725	TTCA	2	8	16118	16125	25 %	50 %	0 %	25 %	386854265
29	NC_017725	ATTT	2	8	16834	16841	25 %	75 %	0 %	0 %	386854265
30	NC_017725	AATT	2	8	16946	16953	50 %	50 %	0 %	0 %	386854265
31	NC_017725	AAGT	2	8	17597	17604	50 %	25 %	25 %	0 %	386854266
32	NC_017725	TTAA	2	8	18102	18109	50 %	50 %	0 %	0 %	386854266
33	NC_017725	AATA	2	8	18855	18862	75 %	25 %	0 %	0 %	386854267
34	NC_017725	AAAT	2	8	19110	19117	75 %	25 %	0 %	0 %	386854267
35	NC_017725	TAAA	2	8	19385	19392	75 %	25 %	0 %	0 %	386854267
36	NC_017725	AATG	2	8	19404	19411	50 %	25 %	25 %	0 %	386854267
37	NC_017725	CCAA	2	8	19420	19427	50 %	0 %	0 %	50 %	386854267
38	NC_017725	AATA	2	8	19479	19486	75 %	25 %	0 %	0 %	386854267
39	NC_017725	ATTC	2	8	19626	19633	25 %	50 %	0 %	25 %	386854267
40	NC_017725	GATT	2	8	19909	19916	25 %	50 %	25 %	0 %	386854267
41	NC_017725	ATAA	2	8	20038	20045	75 %	25 %	0 %	0 %	386854268
42	NC_017725	AAAT	2	8	20575	20582	75 %	25 %	0 %	0 %	386854268
43	NC_017725	TAAA	2	8	20850	20857	75 %	25 %	0 %	0 %	386854268
44	NC_017725	AATG	2	8	20869	20876	50 %	25 %	25 %	0 %	386854268
45	NC_017725	CCAA	2	8	20885	20892	50 %	0 %	0 %	50 %	386854268
46	NC_017725	CCTT	2	8	21389	21396	0 %	50 %	0 %	50 %	386854268
47	NC_017725	AATT	2	8	21792	21799	50 %	50 %	0 %	0 %	386854269
48	NC_017725	TAAA	2	8	21876	21883	75 %	25 %	0 %	0 %	386854269
49	NC_017725	ACTA	2	8	22162	22169	50 %	25 %	0 %	25 %	386854270
50	NC_017725	AATT	2	8	22210	22217	50 %	50 %	0 %	0 %	386854270
51	NC_017725	ATGA	2	8	22498	22505	50 %	25 %	25 %	0 %	386854271
52	NC_017725	ATCT	2	8	22790	22797	25 %	50 %	0 %	25 %	386854271
53	NC_017725	ATTT	2	8	22975	22982	25 %	75 %	0 %	0 %	386854271
54	NC_017725	ATTT	2	8	23347	23354	25 %	75 %	0 %	0 %	386854272
55	NC_017725	ATTT	2	8	23662	23669	25 %	75 %	0 %	0 %	386854272
56	NC_017725	CAAA	2	8	24258	24265	75 %	0 %	0 %	25 %	386854273
57	NC_017725	ACCT	2	8	25668	25675	25 %	25 %	0 %	50 %	386854274
58	NC_017725	TACA	2	8	25790	25797	50 %	25 %	0 %	25 %	386854274
59	NC_017725	TCTT	2	8	25956	25963	0 %	75 %	0 %	25 %	386854274
60	NC_017725	TGTT	2	8	26052	26059	0 %	75 %	25 %	0 %	386854274
61	NC_017725	ATTT	2	8	26077	26084	25 %	75 %	0 %	0 %	386854274
62	NC_017725	AAAT	2	8	26250	26257	75 %	25 %	0 %	0 %	386854274

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.