MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid cp26

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017725	TA	3	6	756	761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017725	AT	3	6	762	767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017725	TC	4	8	1504	1511	0 %	50 %	0 %	50 %	386854246
4	NC_017725	AT	3	6	1959	1964	50 %	50 %	0 %	0 %	386854246
5	NC_017725	TA	3	6	2258	2263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017725	CT	3	6	2419	2424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017725	AT	3	6	2879	2884	50 %	50 %	0 %	0 %	386854247
8	NC_017725	AT	3	6	3835	3840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017725	AT	4	8	3875	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017725	AT	3	6	3907	3912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017725	AT	3	6	3919	3924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017725	AT	3	6	3936	3941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017725	AT	3	6	4351	4356	50 %	50 %	0 %	0 %	386854249
14	NC_017725	CA	3	6	5286	5291	50 %	0 %	0 %	50 %	386854250
15	NC_017725	AT	3	6	5714	5719	50 %	50 %	0 %	0 %	386854250
16	NC_017725	AT	3	6	5887	5892	50 %	50 %	0 %	0 %	386854251
17	NC_017725	TA	3	6	6306	6311	50 %	50 %	0 %	0 %	386854251
18	NC_017725	TA	3	6	6540	6545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017725	AT	3	6	6735	6740	50 %	50 %	0 %	0 %	386854252
20	NC_017725	AT	3	6	7081	7086	50 %	50 %	0 %	0 %	386854252
21	NC_017725	AC	3	6	7210	7215	50 %	0 %	0 %	50 %	386854252
22	NC_017725	AT	3	6	7521	7526	50 %	50 %	0 %	0 %	386854252
23	NC_017725	TA	3	6	8958	8963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017725	AG	3	6	9065	9070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017725	AT	4	8	9343	9350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017725	AT	3	6	10227	10232	50 %	50 %	0 %	0 %	386854258
27	NC_017725	AT	3	6	10294	10299	50 %	50 %	0 %	0 %	386854258
28	NC_017725	TA	3	6	10590	10595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017725	TA	3	6	10602	10607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017725	TA	3	6	10708	10713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017725	TA	3	6	10719	10724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017725	TA	3	6	11093	11098	50 %	50 %	0 %	0 %	386854259
33	NC_017725	AT	3	6	11169	11174	50 %	50 %	0 %	0 %	386854259
34	NC_017725	AT	3	6	11713	11718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017725	AT	3	6	12454	12459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017725	AG	3	6	13471	13476	50 %	0 %	50 %	0 %	386854262
37	NC_017725	AT	3	6	13744	13749	50 %	50 %	0 %	0 %	386854262
38	NC_017725	CT	3	6	16611	16616	0 %	50 %	0 %	50 %	386854265
39	NC_017725	TG	3	6	18438	18443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017725	GA	3	6	18620	18625	50 %	0 %	50 %	0 %	386854267
41	NC_017725	AT	3	6	18816	18821	50 %	50 %	0 %	0 %	386854267
42	NC_017725	AT	3	6	18958	18963	50 %	50 %	0 %	0 %	386854267
43	NC_017725	AT	3	6	19284	19289	50 %	50 %	0 %	0 %	386854267
44	NC_017725	CT	3	6	20257	20262	0 %	50 %	0 %	50 %	386854268
45	NC_017725	AT	3	6	20281	20286	50 %	50 %	0 %	0 %	386854268
46	NC_017725	CT	3	6	21010	21015	0 %	50 %	0 %	50 %	386854268
47	NC_017725	AT	3	6	21278	21283	50 %	50 %	0 %	0 %	386854268
48	NC_017725	AT	3	6	22193	22198	50 %	50 %	0 %	0 %	386854270
49	NC_017725	AT	3	6	22671	22676	50 %	50 %	0 %	0 %	386854271
50	NC_017725	TA	4	8	22697	22704	50 %	50 %	0 %	0 %	386854271
51	NC_017725	AT	3	6	22853	22858	50 %	50 %	0 %	0 %	386854271
52	NC_017725	TA	3	6	23224	23229	50 %	50 %	0 %	0 %	386854272
53	NC_017725	TA	3	6	23580	23585	50 %	50 %	0 %	0 %	386854272
54	NC_017725	TA	3	6	23810	23815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017725	AT	3	6	24189	24194	50 %	50 %	0 %	0 %	386854273
56	NC_017725	AT	3	6	25310	25315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017725	TC	3	6	25905	25910	0 %	50 %	0 %	50 %	386854274
58	NC_017725	AT	3	6	26202	26207	50 %	50 %	0 %	0 %	386854274
59	NC_017725	AT	3	6	26283	26288	50 %	50 %	0 %	0 %	386854274
60	NC_017725	TA	3	6	26544	26549	50 %	50 %	0 %	0 %	386854275
61	NC_017725	AC	3	6	26581	26586	50 %	0 %	0 %	50 %	386854275
62	NC_017725	AT	3	6	26880	26885	50 %	50 %	0 %	0 %	386854275

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.