MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p948

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017724	CCGGA	2	10	13	22	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017724	CATCT	2	10	5506	5515	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017724	GTTTG	2	10	5709	5718	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017724	GAATA	2	10	10201	10210	60 %	20 %	20 %	0 %	387610391
5	NC_017724	CAGGC	2	10	10444	10453	20 %	0 %	40 %	40 %	387610391
6	NC_017724	GGCGT	2	10	10774	10783	0 %	20 %	60 %	20 %	387610392
7	NC_017724	TGCTG	2	10	11695	11704	0 %	40 %	40 %	20 %	387610392
8	NC_017724	GCCTT	2	10	16094	16103	0 %	40 %	20 %	40 %	387610393
9	NC_017724	CACAG	2	10	16238	16247	40 %	0 %	20 %	40 %	387610393
10	NC_017724	CACCC	2	10	18138	18147	20 %	0 %	0 %	80 %	387610394
11	NC_017724	TGCCG	2	10	18291	18300	0 %	20 %	40 %	40 %	387610394
12	NC_017724	TCAGC	2	10	18935	18944	20 %	20 %	20 %	40 %	387610394
13	NC_017724	TCCTG	2	10	22817	22826	0 %	40 %	20 %	40 %	387610398
14	NC_017724	TTCAG	2	10	23082	23091	20 %	40 %	20 %	20 %	387610399
15	NC_017724	ATCCC	2	10	23296	23305	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_017724	CTTTA	2	10	25178	25187	20 %	60 %	0 %	20 %	387610402
17	NC_017724	AATGA	2	10	25582	25591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017724	TTCCC	2	10	27828	27837	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_017724	TTTGA	2	10	33296	33305	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017724	ACTGA	2	10	33987	33996	40 %	20 %	20 %	20 %	387610411
21	NC_017724	ATACT	2	10	36033	36042	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017724	ATTAA	2	10	38480	38489	60 %	40 %	0 %	0 %	387610417
23	NC_017724	ATAAA	2	10	39365	39374	80 %	20 %	0 %	0 %	387610419
24	NC_017724	TGTTA	2	10	39987	39996	20 %	60 %	20 %	0 %	387610419
25	NC_017724	TTAAA	2	10	40112	40121	60 %	40 %	0 %	0 %	387610419
26	NC_017724	CTCAT	2	10	42171	42180	20 %	40 %	0 %	40 %	387610420
27	NC_017724	GTGTT	2	10	42730	42739	0 %	60 %	40 %	0 %	387610420
28	NC_017724	GCACT	2	10	46717	46726	20 %	20 %	20 %	40 %	387610425
29	NC_017724	AGTGG	2	10	46824	46833	20 %	20 %	60 %	0 %	387610425
30	NC_017724	GAATC	2	10	48313	48322	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017724	ATCAC	2	10	48360	48369	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017724	TGGGC	2	10	51415	51424	0 %	20 %	60 %	20 %	387610432
33	NC_017724	GTGAT	2	10	54412	54421	20 %	40 %	40 %	0 %	387610435
34	NC_017724	GAATG	2	10	55760	55769	40 %	20 %	40 %	0 %	387610439
35	NC_017724	TCTGC	2	10	55818	55827	0 %	40 %	20 %	40 %	387610439
36	NC_017724	CCAGC	2	10	56664	56673	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_017724	CCCGT	2	10	57309	57318	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_017724	GCCGC	2	10	57359	57368	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_017724	CTGGC	2	10	58837	58846	0 %	20 %	40 %	40 %	387610442
40	NC_017724	TAATG	2	10	59226	59235	40 %	40 %	20 %	0 %	387610442
41	NC_017724	AGTGA	2	10	59563	59572	40 %	20 %	40 %	0 %	387610442
42	NC_017724	CTTTT	2	10	60839	60848	0 %	80 %	0 %	20 %	387610444
43	NC_017724	TGGGC	2	10	64430	64439	0 %	20 %	60 %	20 %	387610448
44	NC_017724	CCAAA	2	10	64958	64967	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017724	ATTTG	2	10	65841	65850	20 %	60 %	20 %	0 %	387610449
46	NC_017724	TCTTT	2	10	67930	67939	0 %	80 %	0 %	20 %	387610452
47	NC_017724	ATCAC	2	10	69832	69841	40 %	20 %	0 %	40 %	387610453
48	NC_017724	CAAAA	2	10	72193	72202	80 %	0 %	0 %	20 %	387610456
49	NC_017724	TGGAA	2	10	73620	73629	40 %	20 %	40 %	0 %	387610456
50	NC_017724	CCGAA	2	10	73843	73852	40 %	0 %	20 %	40 %	387610456
51	NC_017724	GATCT	2	10	74035	74044	20 %	40 %	20 %	20 %	387610456
52	NC_017724	TTAAT	2	10	75787	75796	40 %	60 %	0 %	0 %	387610457
53	NC_017724	TTTGC	2	10	83038	83047	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017724	TGATC	2	10	83080	83089	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017724	TATAA	2	10	84389	84398	60 %	40 %	0 %	0 %	387610467
56	NC_017724	AAGAA	2	10	84506	84515	80 %	0 %	20 %	0 %	387610467
57	NC_017724	AATAA	2	10	84606	84615	80 %	20 %	0 %	0 %	387610467
58	NC_017724	TCCGG	2	10	85184	85193	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017724	ACATC	2	10	85660	85669	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017724	CGTTC	2	10	86128	86137	0 %	40 %	20 %	40 %	387610468
61	NC_017724	AGCGA	2	10	87924	87933	40 %	0 %	40 %	20 %	387610469
62	NC_017724	CCTGA	2	10	88604	88613	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017724	TAATA	2	10	88817	88826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017724	TTATT	2	10	90029	90038	20 %	80 %	0 %	0 %	387610471
65	NC_017724	GCCCA	2	10	91123	91132	20 %	0 %	20 %	60 %	387610472
66	NC_017724	GTCTG	2	10	92833	92842	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017724	GAACG	2	10	93862	93871	40 %	0 %	40 %	20 %	387610476
68	NC_017724	GATGT	2	10	94334	94343	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.