MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p948

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017724	CCGGA	2	10	13	22	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017724	CATCT	2	10	5506	5515	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017724	GTTTG	2	10	5709	5718	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017724	ATCCC	2	10	23296	23305	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_017724	AATGA	2	10	25582	25591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017724	TTCCC	2	10	27828	27837	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_017724	TTTGA	2	10	33296	33305	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017724	ATACT	2	10	36033	36042	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017724	GAATC	2	10	48313	48322	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017724	ATCAC	2	10	48360	48369	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017724	CCAGC	2	10	56664	56673	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_017724	CCCGT	2	10	57309	57318	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_017724	GCCGC	2	10	57359	57368	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_017724	CCAAA	2	10	64958	64967	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017724	TTTGC	2	10	83038	83047	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017724	TGATC	2	10	83080	83089	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017724	TCCGG	2	10	85184	85193	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017724	ACATC	2	10	85660	85669	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017724	CCTGA	2	10	88604	88613	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017724	TAATA	2	10	88817	88826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017724	GTCTG	2	10	92833	92842	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017724	GATGT	2	10	94334	94343	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.