MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p948

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017724	ATCC	2	8	28	35	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017724	TGCA	2	8	167	174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017724	TAAA	2	8	1016	1023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017724	AATT	2	8	1027	1034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017724	CTAC	2	8	1470	1477	25 %	25 %	0 %	50 %	387610387
6	NC_017724	TCTG	2	8	1898	1905	0 %	50 %	25 %	25 %	387610387
7	NC_017724	GGCT	2	8	2701	2708	0 %	25 %	50 %	25 %	387610387
8	NC_017724	AGTA	2	8	3580	3587	50 %	25 %	25 %	0 %	387610387
9	NC_017724	GCTT	2	8	3900	3907	0 %	50 %	25 %	25 %	387610387
10	NC_017724	AGCC	2	8	4150	4157	25 %	0 %	25 %	50 %	387610387
11	NC_017724	CATG	2	8	4249	4256	25 %	25 %	25 %	25 %	387610387
12	NC_017724	TTTA	2	8	4505	4512	25 %	75 %	0 %	0 %	387610387
13	NC_017724	ATAG	2	8	5376	5383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017724	TAAA	2	8	5903	5910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017724	ACGT	2	8	6011	6018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017724	CCAC	2	8	6696	6703	25 %	0 %	0 %	75 %	387610388
17	NC_017724	ATAC	2	8	6876	6883	50 %	25 %	0 %	25 %	387610388
18	NC_017724	GTAA	2	8	7063	7070	50 %	25 %	25 %	0 %	387610388
19	NC_017724	CCAC	2	8	7077	7084	25 %	0 %	0 %	75 %	387610388
20	NC_017724	TTCC	2	8	7242	7249	0 %	50 %	0 %	50 %	387610388
21	NC_017724	TCTT	2	8	7319	7326	0 %	75 %	0 %	25 %	387610388
22	NC_017724	ATGG	2	8	8065	8072	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017724	GTCT	2	8	8219	8226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017724	GAAA	2	8	8229	8236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017724	AATA	2	8	8420	8427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017724	CCTA	2	8	8531	8538	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017724	TCAG	2	8	8893	8900	25 %	25 %	25 %	25 %	387610390
28	NC_017724	GGAT	2	8	9130	9137	25 %	25 %	50 %	0 %	387610390
29	NC_017724	AGAA	2	8	9406	9413	75 %	0 %	25 %	0 %	387610390
30	NC_017724	TGGC	2	8	9426	9433	0 %	25 %	50 %	25 %	387610390
31	NC_017724	CTGA	2	8	9468	9475	25 %	25 %	25 %	25 %	387610390
32	NC_017724	TGGC	2	8	9921	9928	0 %	25 %	50 %	25 %	387610390
33	NC_017724	TAAA	2	8	10411	10418	75 %	25 %	0 %	0 %	387610391
34	NC_017724	ACGG	2	8	11496	11503	25 %	0 %	50 %	25 %	387610392
35	NC_017724	CTCA	2	8	11528	11535	25 %	25 %	0 %	50 %	387610392
36	NC_017724	CGTC	2	8	11611	11618	0 %	25 %	25 %	50 %	387610392
37	NC_017724	AATC	2	8	11917	11924	50 %	25 %	0 %	25 %	387610392
38	NC_017724	GCCA	2	8	12222	12229	25 %	0 %	25 %	50 %	387610392
39	NC_017724	CCTG	2	8	12501	12508	0 %	25 %	25 %	50 %	387610392
40	NC_017724	GGTG	2	8	15988	15995	0 %	25 %	75 %	0 %	387610393
41	NC_017724	CCAC	2	8	17057	17064	25 %	0 %	0 %	75 %	387610393
42	NC_017724	TCAC	2	8	17387	17394	25 %	25 %	0 %	50 %	387610393
43	NC_017724	CCGA	2	8	17776	17783	25 %	0 %	25 %	50 %	387610394
44	NC_017724	CCGG	2	8	17812	17819	0 %	0 %	50 %	50 %	387610394
45	NC_017724	GCCC	2	8	17909	17916	0 %	0 %	25 %	75 %	387610394
46	NC_017724	CGCT	2	8	18125	18132	0 %	25 %	25 %	50 %	387610394
47	NC_017724	AGGA	2	8	18253	18260	50 %	0 %	50 %	0 %	387610394
48	NC_017724	GACC	2	8	18263	18270	25 %	0 %	25 %	50 %	387610394
49	NC_017724	TCCG	2	8	18557	18564	0 %	25 %	25 %	50 %	387610394
50	NC_017724	GCAG	2	8	19229	19236	25 %	0 %	50 %	25 %	387610394
51	NC_017724	AATT	2	8	19412	19419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017724	GCGA	2	8	19617	19624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017724	TTCT	2	8	19928	19935	0 %	75 %	0 %	25 %	387610395
54	NC_017724	CTGG	2	8	20169	20176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017724	CCAC	2	8	20701	20708	25 %	0 %	0 %	75 %	387610396
56	NC_017724	ATAC	2	8	20881	20888	50 %	25 %	0 %	25 %	387610396
57	NC_017724	GTAA	2	8	21068	21075	50 %	25 %	25 %	0 %	387610396
58	NC_017724	CCAC	2	8	21082	21089	25 %	0 %	0 %	75 %	387610396
59	NC_017724	TTCC	2	8	21247	21254	0 %	50 %	0 %	50 %	387610396
60	NC_017724	TCTT	2	8	21324	21331	0 %	75 %	0 %	25 %	387610396
61	NC_017724	ATCA	2	8	22535	22542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017724	TTCG	2	8	22754	22761	0 %	50 %	25 %	25 %	387610398
63	NC_017724	CCAG	2	8	23452	23459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017724	CGGG	2	8	23526	23533	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017724	TCTG	2	8	23668	23675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017724	CTGT	2	8	24351	24358	0 %	50 %	25 %	25 %	387610400
67	NC_017724	GTCG	2	8	24447	24454	0 %	25 %	50 %	25 %	387610400
68	NC_017724	GGTA	2	8	24491	24498	25 %	25 %	50 %	0 %	387610400
69	NC_017724	AGAA	2	8	24926	24933	75 %	0 %	25 %	0 %	387610401
70	NC_017724	GCCA	2	8	25118	25125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017724	TCTG	2	8	25427	25434	0 %	50 %	25 %	25 %	387610402
72	NC_017724	CGGG	2	8	25630	25637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017724	CCCG	2	8	25711	25718	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_017724	GGAA	2	8	26446	26453	50 %	0 %	50 %	0 %	387610404
75	NC_017724	TTAC	2	8	26625	26632	25 %	50 %	0 %	25 %	387610404
76	NC_017724	GTAT	2	8	26812	26819	25 %	50 %	25 %	0 %	387610404
77	NC_017724	GTGG	2	8	26992	26999	0 %	25 %	75 %	0 %	387610404
78	NC_017724	CCAG	2	8	27917	27924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017724	TGGA	2	8	29054	29061	25 %	25 %	50 %	0 %	387610406
80	NC_017724	ACTG	2	8	29571	29578	25 %	25 %	25 %	25 %	387610407
81	NC_017724	GAAT	2	8	29796	29803	50 %	25 %	25 %	0 %	387610407
82	NC_017724	GCTG	2	8	29823	29830	0 %	25 %	50 %	25 %	387610407
83	NC_017724	GCTG	2	8	31253	31260	0 %	25 %	50 %	25 %	387610408
84	NC_017724	TTCA	2	8	31666	31673	25 %	50 %	0 %	25 %	387610408
85	NC_017724	CCAC	2	8	31881	31888	25 %	0 %	0 %	75 %	387610409
86	NC_017724	ATAC	2	8	32061	32068	50 %	25 %	0 %	25 %	387610409
87	NC_017724	GTAA	2	8	32248	32255	50 %	25 %	25 %	0 %	387610409
88	NC_017724	CCAC	2	8	32262	32269	25 %	0 %	0 %	75 %	387610409
89	NC_017724	TTCC	2	8	32427	32434	0 %	50 %	0 %	50 %	387610409
90	NC_017724	TCTT	2	8	32504	32511	0 %	75 %	0 %	25 %	387610409
91	NC_017724	ATTG	2	8	33146	33153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017724	TCTG	2	8	33271	33278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017724	CTGA	2	8	33470	33477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017724	CTGA	2	8	34230	34237	25 %	25 %	25 %	25 %	387610411
95	NC_017724	TCAG	2	8	34371	34378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017724	GCCT	2	8	35017	35024	0 %	25 %	25 %	50 %	387610413
97	NC_017724	GGCT	2	8	35115	35122	0 %	25 %	50 %	25 %	387610413
98	NC_017724	GCCA	2	8	35673	35680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017724	AGAA	2	8	35913	35920	75 %	0 %	25 %	0 %	387610414
100	NC_017724	AAAT	2	8	35921	35928	75 %	25 %	0 %	0 %	387610414
101	NC_017724	TAAA	2	8	36107	36114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017724	GGAA	2	8	36781	36788	50 %	0 %	50 %	0 %	387610416
103	NC_017724	TCTG	2	8	37575	37582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017724	ATTC	2	8	37640	37647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017724	AGTG	2	8	37692	37699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017724	TTTG	2	8	37749	37756	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017724	AGTT	2	8	37932	37939	25 %	50 %	25 %	0 %	387610417
108	NC_017724	TCCT	2	8	38079	38086	0 %	50 %	0 %	50 %	387610417
109	NC_017724	ATTT	2	8	38360	38367	25 %	75 %	0 %	0 %	387610417
110	NC_017724	AGTG	2	8	38624	38631	25 %	25 %	50 %	0 %	387610418
111	NC_017724	CAAT	2	8	39782	39789	50 %	25 %	0 %	25 %	387610419
112	NC_017724	ACTT	2	8	39893	39900	25 %	50 %	0 %	25 %	387610419
113	NC_017724	AGGG	2	8	40217	40224	25 %	0 %	75 %	0 %	387610419
114	NC_017724	GAAG	2	8	40366	40373	50 %	0 %	50 %	0 %	387610419
115	NC_017724	TTCT	2	8	40661	40668	0 %	75 %	0 %	25 %	387610419
116	NC_017724	ATGG	2	8	40746	40753	25 %	25 %	50 %	0 %	387610419
117	NC_017724	ACTG	2	8	40803	40810	25 %	25 %	25 %	25 %	387610419
118	NC_017724	TTCA	2	8	41055	41062	25 %	50 %	0 %	25 %	387610419
119	NC_017724	CTGG	2	8	41185	41192	0 %	25 %	50 %	25 %	387610419
120	NC_017724	CCAG	2	8	41317	41324	25 %	0 %	25 %	50 %	387610419
121	NC_017724	AAGT	2	8	41438	41445	50 %	25 %	25 %	0 %	387610419
122	NC_017724	TGAA	2	8	41507	41514	50 %	25 %	25 %	0 %	387610419
123	NC_017724	TATT	2	8	41774	41781	25 %	75 %	0 %	0 %	387610420
124	NC_017724	TAAA	2	8	42245	42252	75 %	25 %	0 %	0 %	387610420
125	NC_017724	AAAC	2	8	42677	42684	75 %	0 %	0 %	25 %	387610420
126	NC_017724	TGTT	2	8	42894	42901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017724	AAAG	2	8	43876	43883	75 %	0 %	25 %	0 %	387610421
128	NC_017724	ACTT	2	8	44498	44505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017724	CATT	2	8	44515	44522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017724	TGAT	2	8	45091	45098	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017724	TCAG	2	8	45261	45268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017724	AGGA	2	8	46086	46093	50 %	0 %	50 %	0 %	387610424
133	NC_017724	TGGA	2	8	46360	46367	25 %	25 %	50 %	0 %	387610425
134	NC_017724	GAAA	2	8	46614	46621	75 %	0 %	25 %	0 %	387610425
135	NC_017724	TCGC	2	8	47082	47089	0 %	25 %	25 %	50 %	387610425
136	NC_017724	GAAA	2	8	47273	47280	75 %	0 %	25 %	0 %	387610426
137	NC_017724	TATT	2	8	47612	47619	25 %	75 %	0 %	0 %	387610426
138	NC_017724	TAAT	2	8	47770	47777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017724	ATTT	2	8	48194	48201	25 %	75 %	0 %	0 %	387610427
140	NC_017724	ATTT	2	8	48277	48284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017724	AAAT	2	8	48493	48500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017724	AAAT	2	8	49749	49756	75 %	25 %	0 %	0 %	387610430
143	NC_017724	CAGC	2	8	50744	50751	25 %	0 %	25 %	50 %	387610431
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145	NC_017724	CCAC	2	8	51992	51999	25 %	0 %	0 %	75 %	387610433
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.