MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p948

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017724	TG	3	6	2139	2144	0 %	50 %	50 %	0 %	387610387
2	NC_017724	GA	3	6	3189	3194	50 %	0 %	50 %	0 %	387610387
3	NC_017724	AG	3	6	3386	3391	50 %	0 %	50 %	0 %	387610387
4	NC_017724	TC	3	6	4186	4191	0 %	50 %	0 %	50 %	387610387
5	NC_017724	CA	3	6	4260	4265	50 %	0 %	0 %	50 %	387610387
6	NC_017724	CT	3	6	4269	4274	0 %	50 %	0 %	50 %	387610387
7	NC_017724	AG	3	6	4467	4472	50 %	0 %	50 %	0 %	387610387
8	NC_017724	AT	3	6	4546	4551	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
9	NC_017724	TA	3	6	4636	4641	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
10	NC_017724	TA	3	6	4670	4675	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
11	NC_017724	AT	3	6	5107	5112	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
12	NC_017724	AG	3	6	5277	5282	50 %	0 %	50 %	0 %	387610387
13	NC_017724	AT	3	6	5295	5300	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
14	NC_017724	CA	3	6	5329	5334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017724	TA	3	6	5582	5587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017724	TC	3	6	6055	6060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017724	TC	3	6	6286	6291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017724	TG	3	6	6860	6865	0 %	50 %	50 %	0 %	387610388
19	NC_017724	GC	3	6	7213	7218	0 %	0 %	50 %	50 %	387610388
20	NC_017724	AC	3	6	8955	8960	50 %	0 %	0 %	50 %	387610390
21	NC_017724	CG	3	6	9067	9072	0 %	0 %	50 %	50 %	387610390
22	NC_017724	TG	3	6	9513	9518	0 %	50 %	50 %	0 %	387610390
23	NC_017724	TC	3	6	10090	10095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017724	GT	3	6	10364	10369	0 %	50 %	50 %	0 %	387610391
25	NC_017724	GC	3	6	11664	11669	0 %	0 %	50 %	50 %	387610392
26	NC_017724	GC	3	6	11761	11766	0 %	0 %	50 %	50 %	387610392
27	NC_017724	CA	4	8	12747	12754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017724	AT	3	6	15636	15641	50 %	50 %	0 %	0 %	387610393
29	NC_017724	GC	3	6	17309	17314	0 %	0 %	50 %	50 %	387610393
30	NC_017724	TA	4	8	17433	17440	50 %	50 %	0 %	0 %	387610393
31	NC_017724	TC	3	6	17454	17459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017724	CG	3	6	17613	17618	0 %	0 %	50 %	50 %	387610394
33	NC_017724	AG	3	6	18969	18974	50 %	0 %	50 %	0 %	387610394
34	NC_017724	CG	3	6	19291	19296	0 %	0 %	50 %	50 %	387610394
35	NC_017724	AG	3	6	19299	19304	50 %	0 %	50 %	0 %	387610394
36	NC_017724	TG	3	6	20865	20870	0 %	50 %	50 %	0 %	387610396
37	NC_017724	GC	3	6	21218	21223	0 %	0 %	50 %	50 %	387610396
38	NC_017724	TA	3	6	23148	23153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017724	TA	3	6	23159	23164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017724	TG	3	6	23580	23585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017724	CG	3	6	23643	23648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017724	TG	3	6	25317	25322	0 %	50 %	50 %	0 %	387610402
43	NC_017724	GC	3	6	26477	26482	0 %	0 %	50 %	50 %	387610404
44	NC_017724	AC	3	6	26829	26834	50 %	0 %	0 %	50 %	387610404
45	NC_017724	AT	3	6	27615	27620	50 %	50 %	0 %	0 %	387610405
46	NC_017724	GC	3	6	28839	28844	0 %	0 %	50 %	50 %	387610406
47	NC_017724	GC	3	6	29383	29388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017724	TC	3	6	30336	30341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017724	GT	3	6	30852	30857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017724	AC	3	6	31261	31266	50 %	0 %	0 %	50 %	387610408
51	NC_017724	TG	3	6	31466	31471	0 %	50 %	50 %	0 %	387610408
52	NC_017724	TG	3	6	32045	32050	0 %	50 %	50 %	0 %	387610409
53	NC_017724	GC	3	6	32398	32403	0 %	0 %	50 %	50 %	387610409
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56	NC_017724	GT	3	6	35615	35620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017724	CA	3	6	35686	35691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017724	AT	3	6	36118	36123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017724	GC	3	6	36812	36817	0 %	0 %	50 %	50 %	387610416
60	NC_017724	AT	3	6	37892	37897	50 %	50 %	0 %	0 %	387610417
61	NC_017724	AT	3	6	37969	37974	50 %	50 %	0 %	0 %	387610417
62	NC_017724	AT	3	6	37979	37984	50 %	50 %	0 %	0 %	387610417
63	NC_017724	AT	3	6	38277	38282	50 %	50 %	0 %	0 %	387610417
64	NC_017724	AT	4	8	38421	38428	50 %	50 %	0 %	0 %	387610417
65	NC_017724	TA	3	6	38552	38557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017724	GT	3	6	38881	38886	0 %	50 %	50 %	0 %	387610418
67	NC_017724	AT	3	6	39204	39209	50 %	50 %	0 %	0 %	387610419
68	NC_017724	CA	3	6	39575	39580	50 %	0 %	0 %	50 %	387610419
69	NC_017724	GC	3	6	39692	39697	0 %	0 %	50 %	50 %	387610419
70	NC_017724	CA	3	6	39936	39941	50 %	0 %	0 %	50 %	387610419
71	NC_017724	AT	3	6	40693	40698	50 %	50 %	0 %	0 %	387610419
72	NC_017724	AT	3	6	40780	40785	50 %	50 %	0 %	0 %	387610419
73	NC_017724	AT	4	8	40821	40828	50 %	50 %	0 %	0 %	387610419
74	NC_017724	AT	3	6	40932	40937	50 %	50 %	0 %	0 %	387610419
75	NC_017724	TC	3	6	41101	41106	0 %	50 %	0 %	50 %	387610419
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77	NC_017724	AT	3	6	42444	42449	50 %	50 %	0 %	0 %	387610420
78	NC_017724	AT	3	6	42792	42797	50 %	50 %	0 %	0 %	387610420
79	NC_017724	GC	3	6	42867	42872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017724	AT	3	6	43333	43338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017724	AT	3	6	43384	43389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017724	AT	3	6	43525	43530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017724	AT	3	6	43586	43591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017724	AT	3	6	43629	43634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017724	AT	4	8	43696	43703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017724	TA	3	6	43722	43727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017724	TA	3	6	43736	43741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017724	TG	3	6	43955	43960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017724	CA	3	6	44202	44207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017724	TA	4	8	44666	44673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017724	TA	3	6	44746	44751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017724	TC	3	6	45205	45210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017724	GT	3	6	45239	45244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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98	NC_017724	TA	3	6	47467	47472	50 %	50 %	0 %	0 %	387610426
99	NC_017724	CT	3	6	47474	47479	0 %	50 %	0 %	50 %	387610426
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102	NC_017724	TA	4	8	49297	49304	50 %	50 %	0 %	0 %	387610429
103	NC_017724	CA	3	6	49907	49912	50 %	0 %	0 %	50 %	387610430
104	NC_017724	AT	3	6	50155	50160	50 %	50 %	0 %	0 %	387610430
105	NC_017724	CT	3	6	50998	51003	0 %	50 %	0 %	50 %	387610432
106	NC_017724	AG	3	6	51163	51168	50 %	0 %	50 %	0 %	387610432
107	NC_017724	TG	3	6	52156	52161	0 %	50 %	50 %	0 %	387610433
108	NC_017724	TG	3	6	53569	53574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017724	CA	3	6	54932	54937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017724	CA	3	6	55471	55476	50 %	0 %	0 %	50 %	387610438
111	NC_017724	TG	3	6	55483	55488	0 %	50 %	50 %	0 %	387610438
112	NC_017724	GA	3	6	56411	56416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017724	GT	3	6	56586	56591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017724	CA	3	6	57916	57921	50 %	0 %	0 %	50 %	387610441
115	NC_017724	GC	3	6	58650	58655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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117	NC_017724	TG	3	6	60459	60464	0 %	50 %	50 %	0 %	387610444
118	NC_017724	AT	4	8	61008	61015	50 %	50 %	0 %	0 %	387610444
119	NC_017724	CA	3	6	61195	61200	50 %	0 %	0 %	50 %	387610444
120	NC_017724	AG	4	8	61549	61556	50 %	0 %	50 %	0 %	387610445
121	NC_017724	AT	3	6	61633	61638	50 %	50 %	0 %	0 %	387610445
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123	NC_017724	AT	3	6	62058	62063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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126	NC_017724	AG	3	6	64178	64183	50 %	0 %	50 %	0 %	387610448
127	NC_017724	TG	3	6	66288	66293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017724	GA	3	6	67277	67282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017724	CA	3	6	67387	67392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017724	TC	3	6	68605	68610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017724	TC	3	6	68930	68935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017724	AC	3	6	71062	71067	50 %	0 %	0 %	50 %	387610455
133	NC_017724	TC	4	8	71198	71205	0 %	50 %	0 %	50 %	387610455
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146	NC_017724	AT	3	6	77249	77254	50 %	50 %	0 %	0 %	387610459
147	NC_017724	TA	3	6	77429	77434	50 %	50 %	0 %	0 %	387610459
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.