MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p948

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017724	TG	3	6	2139	2144	0 %	50 %	50 %	0 %	387610387
2	NC_017724	GA	3	6	3189	3194	50 %	0 %	50 %	0 %	387610387
3	NC_017724	AG	3	6	3386	3391	50 %	0 %	50 %	0 %	387610387
4	NC_017724	TC	3	6	4186	4191	0 %	50 %	0 %	50 %	387610387
5	NC_017724	CA	3	6	4260	4265	50 %	0 %	0 %	50 %	387610387
6	NC_017724	CT	3	6	4269	4274	0 %	50 %	0 %	50 %	387610387
7	NC_017724	AG	3	6	4467	4472	50 %	0 %	50 %	0 %	387610387
8	NC_017724	AT	3	6	4546	4551	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
9	NC_017724	TA	3	6	4636	4641	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
10	NC_017724	TA	3	6	4670	4675	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
11	NC_017724	AT	3	6	5107	5112	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
12	NC_017724	AG	3	6	5277	5282	50 %	0 %	50 %	0 %	387610387
13	NC_017724	AT	3	6	5295	5300	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
14	NC_017724	TG	3	6	6860	6865	0 %	50 %	50 %	0 %	387610388
15	NC_017724	GC	3	6	7213	7218	0 %	0 %	50 %	50 %	387610388
16	NC_017724	AC	3	6	8955	8960	50 %	0 %	0 %	50 %	387610390
17	NC_017724	CG	3	6	9067	9072	0 %	0 %	50 %	50 %	387610390
18	NC_017724	TG	3	6	9513	9518	0 %	50 %	50 %	0 %	387610390
19	NC_017724	GT	3	6	10364	10369	0 %	50 %	50 %	0 %	387610391
20	NC_017724	GC	3	6	11664	11669	0 %	0 %	50 %	50 %	387610392
21	NC_017724	GC	3	6	11761	11766	0 %	0 %	50 %	50 %	387610392
22	NC_017724	AT	3	6	15636	15641	50 %	50 %	0 %	0 %	387610393
23	NC_017724	GC	3	6	17309	17314	0 %	0 %	50 %	50 %	387610393
24	NC_017724	TA	4	8	17433	17440	50 %	50 %	0 %	0 %	387610393
25	NC_017724	CG	3	6	17613	17618	0 %	0 %	50 %	50 %	387610394
26	NC_017724	AG	3	6	18969	18974	50 %	0 %	50 %	0 %	387610394
27	NC_017724	CG	3	6	19291	19296	0 %	0 %	50 %	50 %	387610394
28	NC_017724	AG	3	6	19299	19304	50 %	0 %	50 %	0 %	387610394
29	NC_017724	TG	3	6	20865	20870	0 %	50 %	50 %	0 %	387610396
30	NC_017724	GC	3	6	21218	21223	0 %	0 %	50 %	50 %	387610396
31	NC_017724	TG	3	6	25317	25322	0 %	50 %	50 %	0 %	387610402
32	NC_017724	GC	3	6	26477	26482	0 %	0 %	50 %	50 %	387610404
33	NC_017724	AC	3	6	26829	26834	50 %	0 %	0 %	50 %	387610404
34	NC_017724	AT	3	6	27615	27620	50 %	50 %	0 %	0 %	387610405
35	NC_017724	GC	3	6	28839	28844	0 %	0 %	50 %	50 %	387610406
36	NC_017724	AC	3	6	31261	31266	50 %	0 %	0 %	50 %	387610408
37	NC_017724	TG	3	6	31466	31471	0 %	50 %	50 %	0 %	387610408
38	NC_017724	TG	3	6	32045	32050	0 %	50 %	50 %	0 %	387610409
39	NC_017724	GC	3	6	32398	32403	0 %	0 %	50 %	50 %	387610409
40	NC_017724	TG	3	6	33764	33769	0 %	50 %	50 %	0 %	387610411
41	NC_017724	AG	3	6	33797	33802	50 %	0 %	50 %	0 %	387610411
42	NC_017724	GC	3	6	36812	36817	0 %	0 %	50 %	50 %	387610416
43	NC_017724	AT	3	6	37892	37897	50 %	50 %	0 %	0 %	387610417
44	NC_017724	AT	3	6	37969	37974	50 %	50 %	0 %	0 %	387610417
45	NC_017724	AT	3	6	37979	37984	50 %	50 %	0 %	0 %	387610417
46	NC_017724	AT	3	6	38277	38282	50 %	50 %	0 %	0 %	387610417
47	NC_017724	AT	4	8	38421	38428	50 %	50 %	0 %	0 %	387610417
48	NC_017724	GT	3	6	38881	38886	0 %	50 %	50 %	0 %	387610418
49	NC_017724	AT	3	6	39204	39209	50 %	50 %	0 %	0 %	387610419
50	NC_017724	CA	3	6	39575	39580	50 %	0 %	0 %	50 %	387610419
51	NC_017724	GC	3	6	39692	39697	0 %	0 %	50 %	50 %	387610419
52	NC_017724	CA	3	6	39936	39941	50 %	0 %	0 %	50 %	387610419
53	NC_017724	AT	3	6	40693	40698	50 %	50 %	0 %	0 %	387610419
54	NC_017724	AT	3	6	40780	40785	50 %	50 %	0 %	0 %	387610419
55	NC_017724	AT	4	8	40821	40828	50 %	50 %	0 %	0 %	387610419
56	NC_017724	AT	3	6	40932	40937	50 %	50 %	0 %	0 %	387610419
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58	NC_017724	AT	3	6	41899	41904	50 %	50 %	0 %	0 %	387610420
59	NC_017724	AT	3	6	42444	42449	50 %	50 %	0 %	0 %	387610420
60	NC_017724	AT	3	6	42792	42797	50 %	50 %	0 %	0 %	387610420
61	NC_017724	CA	3	6	45967	45972	50 %	0 %	0 %	50 %	387610424
62	NC_017724	GA	4	8	46670	46677	50 %	0 %	50 %	0 %	387610425
63	NC_017724	AG	3	6	46947	46952	50 %	0 %	50 %	0 %	387610425
64	NC_017724	AT	3	6	47295	47300	50 %	50 %	0 %	0 %	387610426
65	NC_017724	TA	3	6	47467	47472	50 %	50 %	0 %	0 %	387610426
66	NC_017724	CT	3	6	47474	47479	0 %	50 %	0 %	50 %	387610426
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68	NC_017724	CA	4	8	49229	49236	50 %	0 %	0 %	50 %	387610429
69	NC_017724	TA	4	8	49297	49304	50 %	50 %	0 %	0 %	387610429
70	NC_017724	CA	3	6	49907	49912	50 %	0 %	0 %	50 %	387610430
71	NC_017724	AT	3	6	50155	50160	50 %	50 %	0 %	0 %	387610430
72	NC_017724	CT	3	6	50998	51003	0 %	50 %	0 %	50 %	387610432
73	NC_017724	AG	3	6	51163	51168	50 %	0 %	50 %	0 %	387610432
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77	NC_017724	CA	3	6	57916	57921	50 %	0 %	0 %	50 %	387610441
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81	NC_017724	CA	3	6	61195	61200	50 %	0 %	0 %	50 %	387610444
82	NC_017724	AG	4	8	61549	61556	50 %	0 %	50 %	0 %	387610445
83	NC_017724	AT	3	6	61633	61638	50 %	50 %	0 %	0 %	387610445
84	NC_017724	CT	3	6	61835	61840	0 %	50 %	0 %	50 %	387610446
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87	NC_017724	AG	3	6	64178	64183	50 %	0 %	50 %	0 %	387610448
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91	NC_017724	CG	3	6	72784	72789	0 %	0 %	50 %	50 %	387610456
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93	NC_017724	GA	3	6	73944	73949	50 %	0 %	50 %	0 %	387610456
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97	NC_017724	TA	3	6	76548	76553	50 %	50 %	0 %	0 %	387610458
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100	NC_017724	AT	3	6	77229	77234	50 %	50 %	0 %	0 %	387610459
101	NC_017724	AT	3	6	77249	77254	50 %	50 %	0 %	0 %	387610459
102	NC_017724	TA	3	6	77429	77434	50 %	50 %	0 %	0 %	387610459
103	NC_017724	AG	4	8	77540	77547	50 %	0 %	50 %	0 %	387610459
104	NC_017724	GA	3	6	78270	78275	50 %	0 %	50 %	0 %	387610460
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106	NC_017724	GA	4	8	79446	79453	50 %	0 %	50 %	0 %	387610461
107	NC_017724	AT	4	8	79477	79484	50 %	50 %	0 %	0 %	387610461
108	NC_017724	AC	3	6	82279	82284	50 %	0 %	0 %	50 %	387610465
109	NC_017724	TA	3	6	83595	83600	50 %	50 %	0 %	0 %	387610467
110	NC_017724	AT	3	6	83761	83766	50 %	50 %	0 %	0 %	387610467
111	NC_017724	AT	3	6	84621	84626	50 %	50 %	0 %	0 %	387610467
112	NC_017724	GA	3	6	86445	86450	50 %	0 %	50 %	0 %	387610468
113	NC_017724	AT	4	8	89404	89411	50 %	50 %	0 %	0 %	387610471
114	NC_017724	AT	3	6	89473	89478	50 %	50 %	0 %	0 %	387610471
115	NC_017724	AT	3	6	89577	89582	50 %	50 %	0 %	0 %	387610471
116	NC_017724	AT	3	6	89718	89723	50 %	50 %	0 %	0 %	387610471
117	NC_017724	TA	3	6	89769	89774	50 %	50 %	0 %	0 %	387610471
118	NC_017724	AG	4	8	92107	92114	50 %	0 %	50 %	0 %	387610474
119	NC_017724	GC	3	6	92214	92219	0 %	0 %	50 %	50 %	387610474
120	NC_017724	AC	3	6	92566	92571	50 %	0 %	0 %	50 %	387610474
121	NC_017724	TG	3	6	93235	93240	0 %	50 %	50 %	0 %	387610475
122	NC_017724	TC	3	6	93549	93554	0 %	50 %	0 %	50 %	387610476

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.