MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p58

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017723	GTT	2	6	19	24	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615183
2	NC_017723	CGG	2	6	112	117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615183
3	NC_017723	CCG	2	6	192	197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615183
4	NC_017723	TTC	2	6	260	265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615183
5	NC_017723	TAG	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615184
6	NC_017723	GCT	3	9	448	456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
7	NC_017723	TGC	2	6	486	491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
8	NC_017723	TGC	2	6	626	631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
9	NC_017723	GCT	2	6	634	639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
10	NC_017723	CTG	3	9	658	666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
11	NC_017723	GCA	2	6	864	869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615184
12	NC_017723	CCA	2	6	870	875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615184
13	NC_017723	GTC	2	6	895	900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
14	NC_017723	CGC	2	6	921	926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615184
15	NC_017723	GCT	2	6	948	953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
16	NC_017723	TGA	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615184
17	NC_017723	CAG	2	6	1033	1038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615184
18	NC_017723	CTG	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
19	NC_017723	GCC	2	6	1304	1309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615184
20	NC_017723	CAC	2	6	1382	1387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615184
21	NC_017723	CTG	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615184
22	NC_017723	TCA	2	6	1426	1431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615184
23	NC_017723	CGG	2	6	1435	1440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615184
24	NC_017723	GCC	2	6	1452	1457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615184
25	NC_017723	CAG	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615184
26	NC_017723	CAG	2	6	1901	1906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615184
27	NC_017723	CAG	2	6	1974	1979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615185
28	NC_017723	ACG	2	6	2011	2016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615185
29	NC_017723	AGC	2	6	2017	2022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615185
30	NC_017723	GTT	2	6	2085	2090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615185
31	NC_017723	ATA	2	6	2789	2794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615186
32	NC_017723	TTA	2	6	2858	2863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615187
33	NC_017723	ATT	2	6	2897	2902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615187
34	NC_017723	ATG	2	6	3006	3011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
35	NC_017723	AAG	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615187
36	NC_017723	GGC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615187
37	NC_017723	CAT	2	6	3244	3249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615187
38	NC_017723	AGG	2	6	3360	3365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387615187
39	NC_017723	ATA	2	6	3395	3400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615187
40	NC_017723	TGA	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
41	NC_017723	TGA	3	9	3418	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
42	NC_017723	TGC	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615187
43	NC_017723	CTT	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615187
44	NC_017723	GAT	2	6	3650	3655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
45	NC_017723	TCT	2	6	3664	3669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615187
46	NC_017723	ATG	2	6	3684	3689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
47	NC_017723	TGA	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
48	NC_017723	ATC	2	6	3738	3743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615187
49	NC_017723	CAA	2	6	3780	3785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615187
50	NC_017723	TGA	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615187
51	NC_017723	AAC	2	6	3887	3892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615187
52	NC_017723	ATC	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615187
53	NC_017723	AAC	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615187
54	NC_017723	ATC	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615187
55	NC_017723	ACA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615187
56	NC_017723	ACC	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615187
57	NC_017723	AGA	2	6	4165	4170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615187
58	NC_017723	AAG	2	6	4213	4218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615187
59	NC_017723	TTC	2	6	4229	4234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615187
60	NC_017723	TTG	2	6	4350	4355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615187
61	NC_017723	AAG	2	6	4427	4432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615188
62	NC_017723	CTT	2	6	4443	4448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615188
63	NC_017723	GTC	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615188
64	NC_017723	CCT	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387615188
65	NC_017723	CGC	2	6	4836	4841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615188
66	NC_017723	CGG	3	9	4991	4999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615188
67	NC_017723	CAG	2	6	5061	5066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615188
68	NC_017723	ATC	2	6	5259	5264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615188
69	NC_017723	GCC	2	6	5523	5528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615189
70	NC_017723	GAA	2	6	5537	5542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615189
71	NC_017723	CGC	2	6	5576	5581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615189
72	NC_017723	CTT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615189

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.