MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p666

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017722	TGTTT	2	10	3662	3671	0 %	80 %	20 %	0 %	387610318
2	NC_017722	CCCGG	2	10	3859	3868	0 %	0 %	40 %	60 %	387610319
3	NC_017722	TATTT	2	10	5719	5728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017722	GACCA	2	10	7582	7591	40 %	0 %	20 %	40 %	387610324
5	NC_017722	CGTGT	2	10	7639	7648	0 %	40 %	40 %	20 %	387610324
6	NC_017722	CAGGT	2	10	7921	7930	20 %	20 %	40 %	20 %	387610325
7	NC_017722	ACGGC	2	10	8459	8468	20 %	0 %	40 %	40 %	387610325
8	NC_017722	CCGGT	2	10	8530	8539	0 %	20 %	40 %	40 %	387610325
9	NC_017722	CGCTG	2	10	9789	9798	0 %	20 %	40 %	40 %	387610325
10	NC_017722	GCCCA	2	10	9886	9895	20 %	0 %	20 %	60 %	387610325
11	NC_017722	AGGTC	2	10	12708	12717	20 %	20 %	40 %	20 %	387610325
12	NC_017722	CAGCA	2	10	14214	14223	40 %	0 %	20 %	40 %	387610326
13	NC_017722	CCGTG	2	10	14666	14675	0 %	20 %	40 %	40 %	387610326
14	NC_017722	TCCGG	2	10	16517	16526	0 %	20 %	40 %	40 %	387610327
15	NC_017722	ACATC	2	10	16993	17002	40 %	20 %	0 %	40 %	387610327
16	NC_017722	CGTTC	2	10	17465	17474	0 %	40 %	20 %	40 %	387610328
17	NC_017722	CAGAC	2	10	18494	18503	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017722	GGCTG	2	10	20766	20775	0 %	20 %	60 %	20 %	387610332
19	NC_017722	AACTG	2	10	21898	21907	40 %	20 %	20 %	20 %	387610334
20	NC_017722	CATTT	2	10	22950	22959	20 %	60 %	0 %	20 %	387610337
21	NC_017722	CCGGG	2	10	24377	24386	0 %	0 %	60 %	40 %	387610338
22	NC_017722	TGTCC	2	10	24476	24485	0 %	40 %	20 %	40 %	387610338
23	NC_017722	CACGG	2	10	24893	24902	20 %	0 %	40 %	40 %	387610339
24	NC_017722	AATGT	2	10	25599	25608	40 %	40 %	20 %	0 %	387610340
25	NC_017722	CCCTG	2	10	27057	27066	0 %	20 %	20 %	60 %	387610343
26	NC_017722	ATAAA	2	10	28613	28622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017722	GTGAT	2	10	31692	31701	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017722	TCTGC	2	10	32922	32931	0 %	40 %	20 %	40 %	387610352
29	NC_017722	TCAGT	2	10	33752	33761	20 %	40 %	20 %	20 %	387610353
30	NC_017722	CATGC	2	10	37938	37947	20 %	20 %	20 %	40 %	387610356
31	NC_017722	CGGCG	2	10	40395	40404	0 %	0 %	60 %	40 %	387610357
32	NC_017722	TGGCG	2	10	42205	42214	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017722	CCAGC	2	10	43235	43244	20 %	0 %	20 %	60 %	387610361
34	NC_017722	CCCGT	2	10	43880	43889	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_017722	GCCGC	2	10	43930	43939	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_017722	CCTTT	2	10	45288	45297	0 %	60 %	0 %	40 %	387610363
37	NC_017722	ATAAA	2	10	45557	45566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017722	TCCCC	2	10	45780	45789	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
39	NC_017722	TATAA	2	10	47163	47172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017722	ATCAC	2	10	48381	48390	40 %	20 %	0 %	40 %	387610365
41	NC_017722	AATTG	2	10	50247	50256	40 %	40 %	20 %	0 %	387610368
42	NC_017722	TTGTT	2	10	51425	51434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017722	GAACG	2	10	55358	55367	40 %	0 %	40 %	20 %	387610373
44	NC_017722	GATGT	2	10	55830	55839	20 %	40 %	40 %	0 %	387610374
45	NC_017722	CCGGA	2	10	56306	56315	20 %	0 %	40 %	40 %	387610374
46	NC_017722	ACCAA	2	10	60501	60510	60 %	0 %	0 %	40 %	387610378
47	NC_017722	ACCCC	2	10	65347	65356	20 %	0 %	0 %	80 %	387610383
48	NC_017722	AAATT	2	10	65912	65921	60 %	40 %	0 %	0 %	387610383

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.