MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p666

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017722	ACTG	2	8	142	149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017722	CAGA	2	8	195	202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017722	CCAG	2	8	595	602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017722	GAGG	2	8	701	708	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017722	TCTG	2	8	822	829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017722	AATG	2	8	865	872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017722	TGTT	2	8	1505	1512	0 %	75 %	25 %	0 %	387610314
8	NC_017722	GTCG	2	8	1600	1607	0 %	25 %	50 %	25 %	387610314
9	NC_017722	GGTA	2	8	1644	1651	25 %	25 %	50 %	0 %	387610314
10	NC_017722	AGAA	2	8	2079	2086	75 %	0 %	25 %	0 %	387610315
11	NC_017722	GCCA	2	8	2269	2276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017722	TTTC	2	8	2373	2380	0 %	75 %	0 %	25 %	387610316
13	NC_017722	GCCT	2	8	2950	2957	0 %	25 %	25 %	50 %	387610317
14	NC_017722	TGGC	2	8	3007	3014	0 %	25 %	50 %	25 %	387610317
15	NC_017722	GAAC	2	8	3045	3052	50 %	0 %	25 %	25 %	387610317
16	NC_017722	TAAT	2	8	3449	3456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017722	ATGA	2	8	3700	3707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017722	TTTA	2	8	3723	3730	25 %	75 %	0 %	0 %	387610319
19	NC_017722	AGGC	2	8	3810	3817	25 %	0 %	50 %	25 %	387610319
20	NC_017722	CATT	2	8	3885	3892	25 %	50 %	0 %	25 %	387610319
21	NC_017722	TGTC	2	8	3990	3997	0 %	50 %	25 %	25 %	387610319
22	NC_017722	ATAA	2	8	4154	4161	75 %	25 %	0 %	0 %	387610319
23	NC_017722	CATT	2	8	4614	4621	25 %	50 %	0 %	25 %	387610320
24	NC_017722	ACAG	2	8	4878	4885	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017722	CCTG	2	8	5483	5490	0 %	25 %	25 %	50 %	387610321
26	NC_017722	AAAG	2	8	5746	5753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017722	ATCA	2	8	5806	5813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017722	AATG	2	8	5857	5864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017722	TCCA	2	8	6074	6081	25 %	25 %	0 %	50 %	387610322
30	NC_017722	GGCA	2	8	6440	6447	25 %	0 %	50 %	25 %	387610323
31	NC_017722	CAGC	2	8	7103	7110	25 %	0 %	25 %	50 %	387610324
32	NC_017722	AGGC	2	8	7111	7118	25 %	0 %	50 %	25 %	387610324
33	NC_017722	CCAC	2	8	7260	7267	25 %	0 %	0 %	75 %	387610324
34	NC_017722	CTGC	2	8	7998	8005	0 %	25 %	25 %	50 %	387610325
35	NC_017722	CAGC	2	8	8202	8209	25 %	0 %	25 %	50 %	387610325
36	NC_017722	CAGC	2	8	8436	8443	25 %	0 %	25 %	50 %	387610325
37	NC_017722	TCCG	2	8	8827	8834	0 %	25 %	25 %	50 %	387610325
38	NC_017722	ACCG	2	8	9865	9872	25 %	0 %	25 %	50 %	387610325
39	NC_017722	CAGG	2	8	10680	10687	25 %	0 %	50 %	25 %	387610325
40	NC_017722	GCCC	2	8	10700	10707	0 %	0 %	25 %	75 %	387610325
41	NC_017722	TCGC	2	8	10807	10814	0 %	25 %	25 %	50 %	387610325
42	NC_017722	CCGG	2	8	10836	10843	0 %	0 %	50 %	50 %	387610325
43	NC_017722	CCAG	2	8	11040	11047	25 %	0 %	25 %	50 %	387610325
44	NC_017722	GCGA	2	8	11541	11548	25 %	0 %	50 %	25 %	387610325
45	NC_017722	TGCG	2	8	12047	12054	0 %	25 %	50 %	25 %	387610325
46	NC_017722	ACTC	2	8	12348	12355	25 %	25 %	0 %	50 %	387610325
47	NC_017722	GTCC	2	8	12570	12577	0 %	25 %	25 %	50 %	387610325
48	NC_017722	GGCC	2	8	12852	12859	0 %	0 %	50 %	50 %	387610325
49	NC_017722	CTGC	2	8	12923	12930	0 %	25 %	25 %	50 %	387610325
50	NC_017722	CAGC	2	8	14100	14107	25 %	0 %	25 %	50 %	387610326
51	NC_017722	CAGA	2	8	14676	14683	50 %	0 %	25 %	25 %	387610326
52	NC_017722	TGTC	2	8	14783	14790	0 %	50 %	25 %	25 %	387610326
53	NC_017722	GTCA	2	8	15386	15393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017722	TGCA	2	8	16365	16372	25 %	25 %	25 %	25 %	387610327
55	NC_017722	TGGA	2	8	16503	16510	25 %	25 %	50 %	0 %	387610327
56	NC_017722	CCGG	2	8	17048	17055	0 %	0 %	50 %	50 %	387610327
57	NC_017722	GGCG	2	8	17393	17400	0 %	0 %	75 %	25 %	387610327
58	NC_017722	CCAG	2	8	17757	17764	25 %	0 %	25 %	50 %	387610328
59	NC_017722	CCGG	2	8	17872	17879	0 %	0 %	50 %	50 %	387610329
60	NC_017722	AGGC	2	8	18250	18257	25 %	0 %	50 %	25 %	387610329
61	NC_017722	TCGC	2	8	18963	18970	0 %	25 %	25 %	50 %	387610330
62	NC_017722	CGGC	2	8	20096	20103	0 %	0 %	50 %	50 %	387610332
63	NC_017722	ATGC	2	8	20146	20153	25 %	25 %	25 %	25 %	387610332
64	NC_017722	TGAC	2	8	20200	20207	25 %	25 %	25 %	25 %	387610332
65	NC_017722	CATC	2	8	20366	20373	25 %	25 %	0 %	50 %	387610332
66	NC_017722	CTGC	2	8	20467	20474	0 %	25 %	25 %	50 %	387610332
67	NC_017722	TCAG	2	8	21104	21111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017722	ATTT	2	8	21524	21531	25 %	75 %	0 %	0 %	387610333
69	NC_017722	TTAA	2	8	21742	21749	50 %	50 %	0 %	0 %	387610334
70	NC_017722	ACGG	2	8	21873	21880	25 %	0 %	50 %	25 %	387610334
71	NC_017722	CGGA	2	8	22005	22012	25 %	0 %	50 %	25 %	387610334
72	NC_017722	AATA	2	8	22234	22241	75 %	25 %	0 %	0 %	387610334
73	NC_017722	ATTT	2	8	22464	22471	25 %	75 %	0 %	0 %	387610335
74	NC_017722	GCAT	2	8	22742	22749	25 %	25 %	25 %	25 %	387610336
75	NC_017722	TGTT	2	8	22837	22844	0 %	75 %	25 %	0 %	387610337
76	NC_017722	TGCC	2	8	22987	22994	0 %	25 %	25 %	50 %	387610337
77	NC_017722	AAAC	2	8	23254	23261	75 %	0 %	0 %	25 %	387610337
78	NC_017722	CCCT	2	8	23377	23384	0 %	25 %	0 %	75 %	387610338
79	NC_017722	AGGC	2	8	24392	24399	25 %	0 %	50 %	25 %	387610338
80	NC_017722	TGTT	2	8	24520	24527	0 %	75 %	25 %	0 %	387610338
81	NC_017722	CAGA	2	8	24710	24717	50 %	0 %	25 %	25 %	387610338
82	NC_017722	CTGG	2	8	24869	24876	0 %	25 %	50 %	25 %	387610339
83	NC_017722	GGCT	2	8	24879	24886	0 %	25 %	50 %	25 %	387610339
84	NC_017722	CCAG	2	8	25562	25569	25 %	0 %	25 %	50 %	387610340
85	NC_017722	TGGT	2	8	26368	26375	0 %	50 %	50 %	0 %	387610341
86	NC_017722	AATA	2	8	26471	26478	75 %	25 %	0 %	0 %	387610342
87	NC_017722	TAAT	2	8	28126	28133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017722	ATTT	2	8	28541	28548	25 %	75 %	0 %	0 %	387610345
89	NC_017722	AAAT	2	8	30088	30095	75 %	25 %	0 %	0 %	387610347
90	NC_017722	CAGT	2	8	31280	31287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017722	GCCC	2	8	31570	31577	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_017722	CACT	2	8	32303	32310	25 %	25 %	0 %	50 %	387610351
93	NC_017722	CAGA	2	8	32471	32478	50 %	0 %	25 %	25 %	387610351
94	NC_017722	ACGG	2	8	32665	32672	25 %	0 %	50 %	25 %	387610352
95	NC_017722	CCGC	2	8	33273	33280	0 %	0 %	25 %	75 %	387610352
96	NC_017722	ATGA	2	8	33363	33370	50 %	25 %	25 %	0 %	387610353
97	NC_017722	CCAG	2	8	33894	33901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017722	CCTT	2	8	34303	34310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017722	GTTC	2	8	34769	34776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017722	CAGG	2	8	35540	35547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017722	CACT	2	8	35675	35682	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017722	CAGT	2	8	36129	36136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017722	TCTG	2	8	36507	36514	0 %	50 %	25 %	25 %	387610355
104	NC_017722	CAGT	2	8	36909	36916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017722	CAGG	2	8	37691	37698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017722	GGAC	2	8	38605	38612	25 %	0 %	50 %	25 %	387610356
107	NC_017722	GAAA	2	8	39025	39032	75 %	0 %	25 %	0 %	387610356
108	NC_017722	AGGC	2	8	39142	39149	25 %	0 %	50 %	25 %	387610356
109	NC_017722	AACC	2	8	39391	39398	50 %	0 %	0 %	50 %	387610356
110	NC_017722	ACTG	2	8	40445	40452	25 %	25 %	25 %	25 %	387610357
111	NC_017722	CTGG	2	8	40726	40733	0 %	25 %	50 %	25 %	387610358
112	NC_017722	CTTC	2	8	41111	41118	0 %	50 %	0 %	50 %	387610358
113	NC_017722	CGGG	2	8	41487	41494	0 %	0 %	75 %	25 %	387610358
114	NC_017722	TCAT	2	8	42237	42244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017722	CTGC	2	8	43122	43129	0 %	25 %	25 %	50 %	387610361
116	NC_017722	ACCA	2	8	43364	43371	50 %	0 %	0 %	50 %	387610361
117	NC_017722	CACC	2	8	43984	43991	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_017722	ATTG	2	8	44055	44062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017722	AACC	2	8	44491	44498	50 %	0 %	0 %	50 %	387610362
120	NC_017722	ATTA	2	8	44655	44662	50 %	50 %	0 %	0 %	387610362
121	NC_017722	AATG	2	8	44910	44917	50 %	25 %	25 %	0 %	387610362
122	NC_017722	GTAT	2	8	45098	45105	25 %	50 %	25 %	0 %	387610362
123	NC_017722	TAAT	2	8	45114	45121	50 %	50 %	0 %	0 %	387610362
124	NC_017722	TTGT	2	8	45184	45191	0 %	75 %	25 %	0 %	387610363
125	NC_017722	GAAA	2	8	45314	45321	75 %	0 %	25 %	0 %	387610363
126	NC_017722	GCTG	2	8	46248	46255	0 %	25 %	50 %	25 %	387610364
127	NC_017722	TGGC	2	8	46381	46388	0 %	25 %	50 %	25 %	387610364
128	NC_017722	TTCA	2	8	47576	47583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017722	GCAA	2	8	47749	47756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017722	GATT	2	8	47889	47896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017722	GCCA	2	8	48184	48191	25 %	0 %	25 %	50 %	387610365
132	NC_017722	CAGC	2	8	48317	48324	25 %	0 %	25 %	50 %	387610365
133	NC_017722	TCCT	2	8	48762	48769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017722	CAGA	2	8	49144	49151	50 %	0 %	25 %	25 %	387610367
135	NC_017722	TGCC	2	8	50435	50442	0 %	25 %	25 %	50 %	387610368
136	NC_017722	TAAA	2	8	50567	50574	75 %	25 %	0 %	0 %	387610368
137	NC_017722	ATTC	2	8	50599	50606	25 %	50 %	0 %	25 %	387610369
138	NC_017722	CTGA	2	8	50632	50639	25 %	25 %	25 %	25 %	387610369
139	NC_017722	TGAT	2	8	50669	50676	25 %	50 %	25 %	0 %	387610369
140	NC_017722	CCAT	2	8	50936	50943	25 %	25 %	0 %	50 %	387610369
141	NC_017722	AAAG	2	8	51513	51520	75 %	0 %	25 %	0 %	387610370
142	NC_017722	CAAC	2	8	51992	51999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017722	TCCT	2	8	52012	52019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017722	GCGG	2	8	52024	52031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017722	TGCC	2	8	52166	52173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017722	GCTG	2	8	52300	52307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017722	ATCG	2	8	52516	52523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017722	ATTG	2	8	52568	52575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017722	CGAT	2	8	53328	53335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017722	GACA	2	8	53538	53545	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017722	GGTC	2	8	53733	53740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017722	TGCC	2	8	54574	54581	0 %	25 %	25 %	50 %	387610372
153	NC_017722	GCCG	2	8	54952	54959	0 %	0 %	50 %	50 %	387610372
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155	NC_017722	CGCC	2	8	55432	55439	0 %	0 %	25 %	75 %	387610374
156	NC_017722	CCGG	2	8	55777	55784	0 %	0 %	50 %	50 %	387610374
157	NC_017722	CCTG	2	8	55799	55806	0 %	25 %	25 %	50 %	387610374
158	NC_017722	ATCC	2	8	56321	56328	25 %	25 %	0 %	50 %	387610374
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164	NC_017722	TGGA	2	8	59235	59242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017722	CATC	2	8	59670	59677	25 %	25 %	0 %	50 %	387610378
166	NC_017722	CTGG	2	8	60328	60335	0 %	25 %	50 %	25 %	387610378
167	NC_017722	GATC	2	8	61343	61350	25 %	25 %	25 %	25 %	387610379
168	NC_017722	TTTA	2	8	61885	61892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017722	AGCG	2	8	62211	62218	25 %	0 %	50 %	25 %	387610380
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174	NC_017722	TTAT	2	8	63648	63655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017722	ATTC	2	8	63871	63878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
176	NC_017722	TGTA	2	8	64159	64166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_017722	ACTG	2	8	64427	64434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
179	NC_017722	TCAA	2	8	64735	64742	50 %	25 %	0 %	25 %	387610383
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185	NC_017722	TATT	2	8	65833	65840	25 %	75 %	0 %	0 %	387610383
186	NC_017722	ACGT	2	8	66330	66337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
187	NC_017722	TACC	2	8	66412	66419	25 %	25 %	0 %	50 %	387610384
188	NC_017722	ATCA	2	8	66446	66453	50 %	25 %	0 %	25 %	387610384
189	NC_017722	ATAA	2	8	66648	66655	75 %	25 %	0 %	0 %	387610384

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.