MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p666

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017722	ACTG	2	8	142	149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017722	CAGA	2	8	195	202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017722	CCAG	2	8	595	602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017722	GAGG	2	8	701	708	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017722	TCTG	2	8	822	829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017722	AATG	2	8	865	872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017722	GCCA	2	8	2269	2276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017722	TAAT	2	8	3449	3456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017722	ATGA	2	8	3700	3707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017722	ACAG	2	8	4878	4885	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017722	AAAG	2	8	5746	5753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017722	ATCA	2	8	5806	5813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017722	AATG	2	8	5857	5864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017722	GTCA	2	8	15386	15393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017722	TCAG	2	8	21104	21111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017722	TAAT	2	8	28126	28133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017722	CAGT	2	8	31280	31287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017722	GCCC	2	8	31570	31577	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_017722	CCAG	2	8	33894	33901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017722	CCTT	2	8	34303	34310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017722	GTTC	2	8	34769	34776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017722	CAGG	2	8	35540	35547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017722	CACT	2	8	35675	35682	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017722	CAGT	2	8	36129	36136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017722	CAGT	2	8	36909	36916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017722	CAGG	2	8	37691	37698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017722	TCAT	2	8	42237	42244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017722	CACC	2	8	43984	43991	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_017722	ATTG	2	8	44055	44062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017722	TTCA	2	8	47576	47583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017722	GCAA	2	8	47749	47756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017722	GATT	2	8	47889	47896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017722	TCCT	2	8	48762	48769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017722	CAAC	2	8	51992	51999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017722	TCCT	2	8	52012	52019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017722	GCGG	2	8	52024	52031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017722	TGCC	2	8	52166	52173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017722	GCTG	2	8	52300	52307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017722	ATCG	2	8	52516	52523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017722	ATTG	2	8	52568	52575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017722	CGAT	2	8	53328	53335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017722	GACA	2	8	53538	53545	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017722	GGTC	2	8	53733	53740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017722	TGGA	2	8	59235	59242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017722	TTTA	2	8	61885	61892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017722	TTAT	2	8	63648	63655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017722	ATTC	2	8	63871	63878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017722	TGTA	2	8	64159	64166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017722	CAGT	2	8	64413	64420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017722	ACTG	2	8	64427	64434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017722	ACGT	2	8	66330	66337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.