MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p666

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017722	CA	3	6	4131	4136	50 %	0 %	0 %	50 %	387610319
2	NC_017722	AT	3	6	4172	4177	50 %	50 %	0 %	0 %	387610319
3	NC_017722	TG	3	6	5123	5128	0 %	50 %	50 %	0 %	387610321
4	NC_017722	AC	3	6	5471	5476	50 %	0 %	0 %	50 %	387610321
5	NC_017722	CA	3	6	6461	6466	50 %	0 %	0 %	50 %	387610323
6	NC_017722	GA	3	6	9125	9130	50 %	0 %	50 %	0 %	387610325
7	NC_017722	TG	3	6	9956	9961	0 %	50 %	50 %	0 %	387610325
8	NC_017722	CT	3	6	10077	10082	0 %	50 %	0 %	50 %	387610325
9	NC_017722	TG	3	6	10577	10582	0 %	50 %	50 %	0 %	387610325
10	NC_017722	CT	3	6	11168	11173	0 %	50 %	0 %	50 %	387610325
11	NC_017722	AT	3	6	12358	12363	50 %	50 %	0 %	0 %	387610325
12	NC_017722	GT	3	6	12485	12490	0 %	50 %	50 %	0 %	387610325
13	NC_017722	CA	3	6	13984	13989	50 %	0 %	0 %	50 %	387610326
14	NC_017722	GT	3	6	14324	14329	0 %	50 %	50 %	0 %	387610326
15	NC_017722	GA	3	6	17782	17787	50 %	0 %	50 %	0 %	387610328
16	NC_017722	CA	3	6	18096	18101	50 %	0 %	0 %	50 %	387610329
17	NC_017722	AG	3	6	18908	18913	50 %	0 %	50 %	0 %	387610330
18	NC_017722	AG	3	6	19709	19714	50 %	0 %	50 %	0 %	387610332
19	NC_017722	AT	3	6	21827	21832	50 %	50 %	0 %	0 %	387610334
20	NC_017722	TC	3	6	23065	23070	0 %	50 %	0 %	50 %	387610337
21	NC_017722	CG	3	6	23093	23098	0 %	0 %	50 %	50 %	387610337
22	NC_017722	GC	3	6	23788	23793	0 %	0 %	50 %	50 %	387610338
23	NC_017722	GC	3	6	24851	24856	0 %	0 %	50 %	50 %	387610339
24	NC_017722	AT	3	6	25795	25800	50 %	50 %	0 %	0 %	387610340
25	NC_017722	AG	3	6	26007	26012	50 %	0 %	50 %	0 %	387610340
26	NC_017722	TA	3	6	27523	27528	50 %	50 %	0 %	0 %	387610344
27	NC_017722	TC	3	6	27819	27824	0 %	50 %	0 %	50 %	387610344
28	NC_017722	GA	3	6	28322	28327	50 %	0 %	50 %	0 %	387610345
29	NC_017722	CA	3	6	30246	30251	50 %	0 %	0 %	50 %	387610347
30	NC_017722	AT	3	6	30494	30499	50 %	50 %	0 %	0 %	387610347
31	NC_017722	GA	3	6	33515	33520	50 %	0 %	50 %	0 %	387610353
32	NC_017722	GT	3	6	33666	33671	0 %	50 %	50 %	0 %	387610353
33	NC_017722	CT	3	6	35845	35850	0 %	50 %	0 %	50 %	387610354
34	NC_017722	AC	3	6	37877	37882	50 %	0 %	0 %	50 %	387610356
35	NC_017722	GT	3	6	37887	37892	0 %	50 %	50 %	0 %	387610356
36	NC_017722	CA	3	6	38123	38128	50 %	0 %	0 %	50 %	387610356
37	NC_017722	TG	3	6	38166	38171	0 %	50 %	50 %	0 %	387610356
38	NC_017722	AT	4	8	38198	38205	50 %	50 %	0 %	0 %	387610356
39	NC_017722	CA	3	6	38809	38814	50 %	0 %	0 %	50 %	387610356
40	NC_017722	GT	3	6	39079	39084	0 %	50 %	50 %	0 %	387610356
41	NC_017722	CT	3	6	39192	39197	0 %	50 %	0 %	50 %	387610356
42	NC_017722	GC	3	6	39898	39903	0 %	0 %	50 %	50 %	387610357
43	NC_017722	CG	3	6	39947	39952	0 %	0 %	50 %	50 %	387610357
44	NC_017722	CA	3	6	40226	40231	50 %	0 %	0 %	50 %	387610357
45	NC_017722	GC	3	6	40417	40422	0 %	0 %	50 %	50 %	387610357
46	NC_017722	TC	3	6	41625	41630	0 %	50 %	0 %	50 %	387610358
47	NC_017722	GA	3	6	41639	41644	50 %	0 %	50 %	0 %	387610358
48	NC_017722	CG	3	6	41800	41805	0 %	0 %	50 %	50 %	387610358
49	NC_017722	GT	4	8	42301	42308	0 %	50 %	50 %	0 %	387610359
50	NC_017722	CA	3	6	42895	42900	50 %	0 %	0 %	50 %	387610360
51	NC_017722	GC	3	6	42927	42932	0 %	0 %	50 %	50 %	387610360
52	NC_017722	GT	3	6	43157	43162	0 %	50 %	50 %	0 %	387610361
53	NC_017722	AC	3	6	44300	44305	50 %	0 %	0 %	50 %	387610362
54	NC_017722	TC	3	6	44753	44758	0 %	50 %	0 %	50 %	387610362
55	NC_017722	CA	4	8	45034	45041	50 %	0 %	0 %	50 %	387610362
56	NC_017722	AT	3	6	45343	45348	50 %	50 %	0 %	0 %	387610363
57	NC_017722	CA	3	6	49445	49450	50 %	0 %	0 %	50 %	387610367
58	NC_017722	TA	3	6	50480	50485	50 %	50 %	0 %	0 %	387610368
59	NC_017722	TG	3	6	50488	50493	0 %	50 %	50 %	0 %	387610368
60	NC_017722	AG	3	6	50548	50553	50 %	0 %	50 %	0 %	387610368
61	NC_017722	TA	3	6	50617	50622	50 %	50 %	0 %	0 %	387610369
62	NC_017722	AT	3	6	50687	50692	50 %	50 %	0 %	0 %	387610369
63	NC_017722	TC	3	6	50790	50795	0 %	50 %	0 %	50 %	387610369
64	NC_017722	AT	3	6	50942	50947	50 %	50 %	0 %	0 %	387610369
65	NC_017722	AT	4	8	51059	51066	50 %	50 %	0 %	0 %	387610369
66	NC_017722	CA	3	6	51691	51696	50 %	0 %	0 %	50 %	387610371
67	NC_017722	TG	3	6	54731	54736	0 %	50 %	50 %	0 %	387610372
68	NC_017722	TC	3	6	55045	55050	0 %	50 %	0 %	50 %	387610373
69	NC_017722	GC	3	6	60106	60111	0 %	0 %	50 %	50 %	387610378
70	NC_017722	CA	3	6	61358	61363	50 %	0 %	0 %	50 %	387610379
71	NC_017722	CG	3	6	61373	61378	0 %	0 %	50 %	50 %	387610379
72	NC_017722	CG	3	6	61475	61480	0 %	0 %	50 %	50 %	387610379
73	NC_017722	TC	3	6	62589	62594	0 %	50 %	0 %	50 %	387610381
74	NC_017722	GC	3	6	63078	63083	0 %	0 %	50 %	50 %	387610381
75	NC_017722	AT	3	6	64830	64835	50 %	50 %	0 %	0 %	387610383
76	NC_017722	TC	3	6	65095	65100	0 %	50 %	0 %	50 %	387610383
77	NC_017722	AT	4	8	65213	65220	50 %	50 %	0 %	0 %	387610383
78	NC_017722	TA	3	6	65794	65799	50 %	50 %	0 %	0 %	387610383
79	NC_017722	TC	3	6	66371	66376	0 %	50 %	0 %	50 %	387610384

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.