MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p52

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017721	GTG	2	6	30	35	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017721	TGG	2	6	68	73	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017721	ACC	2	6	138	143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017721	AAG	2	6	203	208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017721	GAT	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615176
6	NC_017721	TGC	2	6	516	521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017721	AAC	2	6	599	604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017721	ATA	2	6	757	762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615177
9	NC_017721	ACG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615177
10	NC_017721	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615177
11	NC_017721	AGC	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615177
12	NC_017721	TCT	2	6	1257	1262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615177
13	NC_017721	ACA	3	9	1345	1353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615178
14	NC_017721	TGC	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615178
15	NC_017721	AAG	2	6	1463	1468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615178
16	NC_017721	ATC	2	6	1490	1495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615178
17	NC_017721	GAT	2	6	1497	1502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615178
18	NC_017721	AGA	2	6	1581	1586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615178
19	NC_017721	TGG	2	6	1601	1606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615178
20	NC_017721	TAG	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615178
21	NC_017721	GAT	2	6	1656	1661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615178
22	NC_017721	GGC	2	6	1705	1710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615178
23	NC_017721	GCA	2	6	1717	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615178
24	NC_017721	CTA	2	6	1731	1736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615178
25	NC_017721	GGT	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615178
26	NC_017721	CAT	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615178
27	NC_017721	ACA	3	9	1895	1903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615178
28	NC_017721	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615178
29	NC_017721	CGG	2	6	1939	1944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615178
30	NC_017721	GCA	2	6	2236	2241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017721	CAA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017721	ACC	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017721	CTG	2	6	2359	2364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017721	AGA	2	6	2396	2401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017721	CAA	2	6	2470	2475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017721	ACA	2	6	2605	2610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017721	TGC	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615179
38	NC_017721	CTG	2	6	2798	2803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615179
39	NC_017721	TTC	2	6	3116	3121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615179
40	NC_017721	TTC	2	6	3134	3139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615179
41	NC_017721	TGC	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615179
42	NC_017721	ATC	2	6	3270	3275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615179
43	NC_017721	TCG	2	6	3408	3413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615179
44	NC_017721	TTC	2	6	3517	3522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615179
45	NC_017721	CCG	2	6	3523	3528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615179
46	NC_017721	CGG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615179
47	NC_017721	GTA	2	6	3810	3815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615179
48	NC_017721	TCC	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387615179
49	NC_017721	CGG	2	6	3981	3986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615179
50	NC_017721	TTC	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615179
51	NC_017721	CTT	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615179
52	NC_017721	CAG	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615179
53	NC_017721	CCA	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615179
54	NC_017721	ATC	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615179
55	NC_017721	GAC	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615180
56	NC_017721	CCA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615180
57	NC_017721	CGG	2	6	4351	4356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615180
58	NC_017721	CGC	2	6	4409	4414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615180
59	NC_017721	GTT	2	6	4428	4433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615180
60	NC_017721	TCA	3	9	4466	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615180
61	NC_017721	GCT	2	6	4621	4626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615181
62	NC_017721	CGA	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615181
63	NC_017721	GCG	2	6	5046	5051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017721	ACA	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.