MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pSLT_SL1344

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017720	TAAAT	2	10	33088	33097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017720	ATTTT	2	10	34271	34280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017720	CGGGG	2	10	35176	35185	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017720	AGTTC	2	10	35215	35224	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017720	CCCGT	2	10	44590	44599	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_017720	CCCGT	2	10	45767	45776	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_017720	CGTCC	2	10	52265	52274	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017720	TTATA	2	10	54199	54208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017720	CCAGA	2	10	55105	55114	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017720	CATTA	2	10	56348	56357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017720	TCAAC	2	10	61229	61238	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017720	ATATT	2	10	66866	66875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017720	TGTCA	2	10	77458	77467	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017720	ACGGC	2	10	77518	77527	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017720	TTGCA	2	10	78927	78936	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017720	GGAGC	2	10	88869	88878	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017720	AACAT	2	10	88913	88922	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017720	TGTGG	2	10	88981	88990	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017720	GACGA	2	10	92202	92211	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.