MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pSLT_SL1344

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017720	AACCC	2	10	2308	2317	40 %	0 %	0 %	60 %	386730662
2	NC_017720	CGCTG	2	10	3492	3501	0 %	20 %	40 %	40 %	386730662
3	NC_017720	TTTCG	2	10	3709	3718	0 %	60 %	20 %	20 %	386730662
4	NC_017720	TCCGG	2	10	4932	4941	0 %	20 %	40 %	40 %	386730662
5	NC_017720	CCTGC	2	10	4972	4981	0 %	20 %	20 %	60 %	386730662
6	NC_017720	CGCGC	2	10	5081	5090	0 %	0 %	40 %	60 %	386730662
7	NC_017720	CCCGG	2	10	5581	5590	0 %	0 %	40 %	60 %	386730662
8	NC_017720	CAGGT	2	10	7902	7911	20 %	20 %	40 %	20 %	386730664
9	NC_017720	CTGCG	2	10	12232	12241	0 %	20 %	40 %	40 %	386730667
10	NC_017720	CCCAG	2	10	13831	13840	20 %	0 %	20 %	60 %	386730667
11	NC_017720	TTCAG	2	10	20169	20178	20 %	40 %	20 %	20 %	386730674
12	NC_017720	TATTT	2	10	20307	20316	20 %	80 %	0 %	0 %	386730674
13	NC_017720	TTCGC	2	10	24307	24316	0 %	40 %	20 %	40 %	386730679
14	NC_017720	CCGGA	2	10	27575	27584	20 %	0 %	40 %	40 %	386730684
15	NC_017720	ATTTT	2	10	29358	29367	20 %	80 %	0 %	0 %	386730686
16	NC_017720	AATGT	2	10	30018	30027	40 %	40 %	20 %	0 %	386730687
17	NC_017720	ACCGT	2	10	31026	31035	20 %	20 %	20 %	40 %	386730689
18	NC_017720	CACAA	2	10	31913	31922	60 %	0 %	0 %	40 %	386730691
19	NC_017720	TTATT	2	10	32796	32805	20 %	80 %	0 %	0 %	386730692
20	NC_017720	CGCGC	2	10	36751	36760	0 %	0 %	40 %	60 %	386730696
21	NC_017720	ACATC	2	10	40478	40487	40 %	20 %	0 %	40 %	386730699
22	NC_017720	TCTTT	2	10	42095	42104	0 %	80 %	0 %	20 %	386730702
23	NC_017720	AGGCC	2	10	43065	43074	20 %	0 %	40 %	40 %	386730704
24	NC_017720	AGTTC	2	10	43367	43376	20 %	40 %	20 %	20 %	386730704
25	NC_017720	TGTGC	2	10	53567	53576	0 %	40 %	40 %	20 %	386730715
26	NC_017720	CCGGA	2	10	56638	56647	20 %	0 %	40 %	40 %	386730718
27	NC_017720	AACAG	2	10	56791	56800	60 %	0 %	20 %	20 %	386730718
28	NC_017720	CTGCG	2	10	57715	57724	0 %	20 %	40 %	40 %	386730719
29	NC_017720	AAAAT	2	10	58916	58925	80 %	20 %	0 %	0 %	386730720
30	NC_017720	CCCGT	2	10	60236	60245	0 %	20 %	20 %	60 %	386730721
31	NC_017720	GTAAA	2	10	60713	60722	60 %	20 %	20 %	0 %	386730721
32	NC_017720	GTTCA	2	10	62197	62206	20 %	40 %	20 %	20 %	386730722
33	NC_017720	CTGAC	2	10	63535	63544	20 %	20 %	20 %	40 %	386730723
34	NC_017720	TAATA	2	10	65346	65355	60 %	40 %	0 %	0 %	386730724
35	NC_017720	ACTCA	2	10	65637	65646	40 %	20 %	0 %	40 %	386730724
36	NC_017720	ACCAG	2	10	66409	66418	40 %	0 %	20 %	40 %	386730725
37	NC_017720	ACGTC	2	10	71818	71827	20 %	20 %	20 %	40 %	386730733
38	NC_017720	TGACC	2	10	79862	79871	20 %	20 %	20 %	40 %	386730743
39	NC_017720	TACAG	2	10	81878	81887	40 %	20 %	20 %	20 %	386730744
40	NC_017720	GAAAG	2	10	81997	82006	60 %	0 %	40 %	0 %	386730744
41	NC_017720	GAACG	2	10	83528	83537	40 %	0 %	40 %	20 %	386730745
42	NC_017720	CCATT	2	10	83721	83730	20 %	40 %	0 %	40 %	386730746
43	NC_017720	TCCAG	2	10	92908	92917	20 %	20 %	20 %	40 %	386730759

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.